-
การหาลำดับ mRNA แบบเต็มความยาว-Nanopore
การจัดลำดับ RNA เป็นเครื่องมือที่ทรงคุณค่าสำหรับการวิเคราะห์การถอดรหัสแบบครอบคลุมไม่ต้องสงสัยเลย การจัดลำดับการอ่านระยะสั้นแบบดั้งเดิมประสบความสำเร็จในการพัฒนาที่สำคัญมากมายที่นี่อย่างไรก็ตาม มักพบข้อจำกัดในการระบุไอโซฟอร์มแบบเต็มความยาว การหาปริมาณ ความเอนเอียง PCR
การหาลำดับ Nanopore แตกต่างจากแพลตฟอร์มการหาลำดับอื่นๆ โดยที่นิวคลีโอไทด์ถูกอ่านโดยตรงโดยปราศจากการสังเคราะห์ DNA และสร้างการอ่านที่ยาวนานที่ระดับสิบกิโลเบสสิ่งนี้ช่วยให้สามารถอ่านทรานสคริปต์แบบเต็มความยาวได้โดยตรง และจัดการกับความท้าทายในการศึกษาระดับไอโซฟอร์ม
แพลตฟอร์ม：นาโนพอร์ โพรเมชั่น
ห้องสมุด:cDNA-PCR
-
เดอ โนโว ลำดับการถอดเสียงแบบเต็มความยาว -PacBio
เดอ โนโวลำดับการถอดรหัสแบบเต็มความยาวหรือที่เรียกว่าเดอ โนโวIso-Seq ใช้ประโยชน์จากข้อได้เปรียบของซีเควนเซอร์ PacBio ในด้านความยาวในการอ่าน ซึ่งช่วยให้สามารถจัดลำดับโมเลกุล cDNA แบบเต็มความยาวได้โดยไม่มีการหยุดพักใดๆซึ่งจะช่วยหลีกเลี่ยงข้อผิดพลาดที่เกิดขึ้นในขั้นตอนการประกอบการถอดเสียงได้อย่างสมบูรณ์ และสร้างชุดยูนิจีนที่มีความละเอียดระดับไอโซฟอร์มชุดยูนิจีนนี้ให้ข้อมูลทางพันธุกรรมที่มีประสิทธิภาพในฐานะ "จีโนมอ้างอิง" ที่ระดับการถอดรหัสนอกจากนี้ เมื่อรวมกับข้อมูลการจัดลำดับยุคถัดไป บริการนี้ช่วยให้สามารถหาปริมาณนิพจน์ระดับไอโซฟอร์มได้อย่างแม่นยำ
แพลตฟอร์ม： PacBio Sequel IIห้องสมุด: ห้องสมุดระฆัง SMRT -
การจัดลำดับ Eukaryotic mRNA-Illumina
การจัดลำดับ mRNA ช่วยให้สร้างโปรไฟล์ของ mRNA ทั้งหมดที่ถอดรหัสจากเซลล์ภายใต้สภาวะเฉพาะเป็นเทคโนโลยีที่ทรงพลังสำหรับการเปิดเผยโปรไฟล์การแสดงออกของยีน โครงสร้างยีน และกลไกระดับโมเลกุลของกระบวนการทางชีววิทยาบางอย่างจนถึงปัจจุบัน การจัดลำดับ mRNA ถูกนำมาใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยขั้นพื้นฐาน การวินิจฉัยทางคลินิก การพัฒนายา ฯลฯ
แพลตฟอร์ม: Illumina NovaSeq 6000
-
การจัดลำดับ mRNA ที่ไม่ใช่การอ้างอิง-Illumina
การจัดลำดับ mRNA ใช้เทคนิคการเรียงลำดับยุคหน้า (NGS) เพื่อจับภาพ RNA ของผู้ส่งสาร (mRNA) จากรูปแบบยูคาริโอตในช่วงเวลาเฉพาะที่เปิดใช้งานฟังก์ชันพิเศษบางอย่างการต่อข้อความเสียงที่ยาวที่สุดเรียกว่า 'Unigene' และใช้เป็นลำดับอ้างอิงสำหรับการวิเคราะห์ที่ตามมา ซึ่งเป็นวิธีที่มีประสิทธิภาพในการศึกษากลไกระดับโมเลกุลและเครือข่ายการกำกับดูแลของสปีชีส์โดยไม่ต้องอ้างอิง
หลังจากการประกอบข้อมูลการถอดรหัสและคำอธิบายประกอบการทำงานแบบยูนิจีน
(1) การวิเคราะห์ SNP, การวิเคราะห์ SSR, การทำนาย CDS และโครงสร้างยีนจะถูกกำหนดไว้ล่วงหน้า
(2) จะทำการหาปริมาณการแสดงออกของยูนิจีนในแต่ละตัวอย่าง
(3) unigenes ที่แสดงความแตกต่างระหว่างตัวอย่าง (หรือกลุ่ม) จะถูกค้นพบตามการแสดงออกของ unigene
(4) การทำคลัสเตอร์ คำอธิบายประกอบเชิงฟังก์ชัน และการวิเคราะห์การเสริมสมรรถนะของยูนิจีนที่แสดงออกอย่างแตกต่างจะถูกดำเนินการ
-
การจัดลำดับแบบไม่เข้ารหัสแบบยาว-Illumina
Long non-coding RNAs (lncRNAs) เป็นโมเลกุล RNA ชนิดหนึ่งที่มีความยาวเกิน 200 nt ซึ่งมีลักษณะเฉพาะด้วยศักยภาพในการเข้ารหัสที่ต่ำมากLncRNA ในฐานะสมาชิกหลักใน RNA ที่ไม่มีการเข้ารหัส ส่วนใหญ่จะพบในนิวเคลียสและพลาสมาการพัฒนาเทคโนโลยีการจัดลำดับและชีวสารสนเทศช่วยให้สามารถระบุ lncRNA ใหม่ ๆ จำนวนมากและเชื่อมโยงกับหน้าที่ทางชีววิทยาหลักฐานสะสมบ่งชี้ว่า lncRNA มีส่วนเกี่ยวข้องอย่างกว้างขวางในการควบคุมอีพีเจเนติก ระเบียบการถอดรหัส และระเบียบภายหลังการถอดความ
-
การจัดลำดับ RNA ขนาดเล็ก-Illumina
RNA ขนาดเล็กหมายถึงคลาสของโมเลกุล RNA ที่ไม่ได้เข้ารหัสซึ่งมักจะมีความยาวน้อยกว่า 200nt รวมถึง micro RNA (miRNA) RNA การรบกวนขนาดเล็ก (siRNA) และ RNA ที่มีปฏิกิริยาระหว่าง piwi (piRNA)
MicroRNA (miRNA) เป็นคลาสของ RNA ขนาดเล็กภายในตัวที่มีความยาวประมาณ 20-24nt ซึ่งมีบทบาทในการกำกับดูแลที่สำคัญหลายอย่างในเซลล์miRNA เกี่ยวข้องกับกระบวนการของชีวิตหลายอย่างซึ่งเผยให้เห็นเนื้อเยื่อ - เฉพาะและระยะ - การแสดงออกที่เฉพาะเจาะจงและอนุรักษ์ไว้อย่างดีในสายพันธุ์ต่างๆ
-
การจัดลำดับ circRNA-Illumina
การจัดลำดับการถอดรหัสทั้งหมดได้รับการออกแบบมาเพื่อสร้างโปรไฟล์ของโมเลกุล RNA ทุกประเภท รวมถึงการเข้ารหัส (mRNA) และ RNA ที่ไม่เข้ารหัส (รวมถึง lncRNA, circRNA และ miRNA) ซึ่งคัดลอกโดยเซลล์เฉพาะในช่วงเวลาหนึ่งการจัดลำดับการถอดรหัสทั้งหมดหรือที่เรียกว่า "การจัดลำดับ RNA ทั้งหมด" มีจุดมุ่งหมายเพื่อเปิดเผยเครือข่ายการกำกับดูแลที่ครอบคลุมในระดับการถอดรหัสการใช้ประโยชน์จากเทคโนโลยี NGS ทำให้ลำดับของผลิตภัณฑ์การถอดรหัสทั้งหมดพร้อมใช้งานสำหรับการวิเคราะห์ ceRNA และการวิเคราะห์ RNA ร่วมกัน ซึ่งเป็นขั้นตอนแรกสู่การกำหนดลักษณะการทำงานเปิดเผยเครือข่ายการกำกับดูแลของ ceRNA ที่ใช้ circRNA-miRNA-mRNA
-
การจัดลำดับการถอดรหัสทั้งหมด – Illumina
การจัดลำดับการถอดรหัสทั้งหมดได้รับการออกแบบมาเพื่อสร้างโปรไฟล์ของโมเลกุล RNA ทุกประเภท รวมถึงการเข้ารหัส (mRNA) และ RNA ที่ไม่เข้ารหัส (รวมถึง lncRNA, circRNA และ miRNA) ซึ่งคัดลอกโดยเซลล์เฉพาะในช่วงเวลาหนึ่งการจัดลำดับการถอดรหัสทั้งหมดหรือที่เรียกว่า "การจัดลำดับ RNA ทั้งหมด" มีจุดมุ่งหมายเพื่อเปิดเผยเครือข่ายการกำกับดูแลที่ครอบคลุมในระดับการถอดรหัสการใช้ประโยชน์จากเทคโนโลยี NGS ทำให้ลำดับของผลิตภัณฑ์การถอดรหัสทั้งหมดพร้อมใช้งานสำหรับการวิเคราะห์ ceRNA และการวิเคราะห์ RNA ร่วมกัน ซึ่งเป็นขั้นตอนแรกสู่การกำหนดลักษณะการทำงานเปิดเผยเครือข่ายการกำกับดูแลของ ceRNA ที่ใช้ circRNA-miRNA-mRNA
-
การจัดลำดับ Prokaryotic RNA
การจัดลำดับ Prokaryotic RNA ใช้การหาลำดับรุ่นถัดไป (NGS) เพื่อเปิดเผยการมีอยู่และปริมาณของ RNA ในช่วงเวลาที่กำหนด โดยการวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงการถอดรหัสของเซลล์การจัดลำดับ RNA โพรคาริโอตของบริษัทของเรามุ่งเป้าไปที่โปรคาริโอตด้วยจีโนมอ้างอิงโดยเฉพาะ ให้คุณสร้างโปรไฟล์การถอดรหัส การวิเคราะห์โครงสร้างยีน ฯลฯ มีการใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ขั้นพื้นฐาน การวิจัยและพัฒนายา และอื่นๆ
แพลตฟอร์ม: Illumina NovaSeq 6000
-
การจัดลำดับ Metatranscriptome
การจัดลำดับ Metatranscriptome ระบุการแสดงออกของยีนของจุลินทรีย์ (ทั้งยูคาริโอตและโปรคาริโอต) ภายในสภาพแวดล้อมทางธรรมชาติ (เช่น ดิน น้ำ ทะเล อุจจาระ และลำไส้) บริการนี้ช่วยให้คุณได้รับโปรไฟล์การแสดงออกของยีนทั้งหมดจากชุมชนจุลินทรีย์ที่ซับซ้อน การวิเคราะห์อนุกรมวิธาน ของสปีชีส์ การวิเคราะห์การเพิ่มสมรรถนะเชิงหน้าที่ของยีนที่แสดงออกมาต่างกัน และอื่นๆ
แพลตฟอร์ม: Illumina NovaSeq 6000
