-
Повнорозмірне секвенування мРНК-Nanopore
Секвенування РНК було безцінним інструментом для комплексного аналізу транскриптомів.Безсумнівно, традиційна послідовність короткого читання досягла тут багатьох важливих змін.Тим не менш, він часто стикається з обмеженнями в ідентифікації повнорозмірної ізоформи, кількісній оцінці, упередженні ПЛР.
Секвенування нанопор відрізняється від інших платформ секвенування тим, що нуклеотиди зчитуються безпосередньо без синтезу ДНК і генерує довге зчитування на десятках кілобаз.Це дає можливість прямого зчитування схрещувати повнорозмірні стенограми та вирішувати проблеми в дослідженнях на рівні ізоформ.
Платформа:Nanopore PromethION
Бібліотека:кДНК-ПЛР
-
Повнорозмірне секвенування транскриптомів De novo -PacBio
De novoповнорозмірне секвенування транскриптомів, також відоме якDe novoIso-Seq використовує переваги секвенсора PacBio щодо довжини зчитування, що дозволяє секвенувати повнорозмірні молекули кДНК без будь-яких розривів.Це повністю уникає будь-яких помилок, що виникають на етапах складання транскрипту, і створює унігенні набори з роздільною здатністю на рівні ізоформи.Цей унігенний набір надає потужну генетичну інформацію як «еталонний геном» на рівні транскриптомів.Крім того, у поєднанні з даними секвенування наступного покоління, ця послуга дає можливість точного кількісного визначення виразу на рівні ізоформи.
Платформа: PacBio Sequel IIБібліотека: SMRT bell library -
Секвенування мРНК еукаріотів-Illumina
Секвенування мРНК дає змогу профілювати всі мРНК, транскриповані з клітин, у певних умовах.Це потужна технологія для виявлення профілю експресії генів, генних структур і молекулярних механізмів певних біологічних процесів.На сьогоднішній день секвенування мРНК широко використовується у фундаментальних дослідженнях, клінічній діагностиці, розробці ліків тощо.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Нереферентне секвенування мРНК-Illumina
Секвенування мРНК використовує техніку секвенування наступного покоління (NGS) для захоплення інформаційної РНК (мРНК) з еукаріотів у певний період, коли активуються деякі спеціальні функції.Найдовший транскрипт, який був зрощений, був названий «Unigene» і використовувався як еталонна послідовність для подальшого аналізу, що є ефективним засобом для вивчення молекулярного механізму та регуляторної мережі виду без посилання.
Після складання даних транскриптому та унігенної функціональної анотації
(1) Буде виконано аналіз SNP, аналіз SSR, прогноз CDS та генної структури.
(2) Буде виконано кількісне визначення експресії унігену в кожному зразку.
(3) Диференційно виражені унігени між зразками (або групами) будуть виявлені на основі унігенної експресії
(4) Буде виконано кластеризацію, функціональну анотацію та аналіз збагачення диференційно експресованих унігенів
-
Довге некодуюче секвенування-Illumina
Довгі некодуючі РНК (lncRNAs) — це тип молекул РНК довжиною понад 200 нт, які характеризуються надзвичайно низьким потенціалом кодування.LncRNA, як ключовий член некодуючих РНК, в основному міститься в ядрі та плазмі.Розвиток технологій секвенування та біоінформації дає змогу ідентифікувати численні нові lncRNA та пов’язати їх з біологічними функціями.Накопичені дані свідчать про те, що lncRNA широко задіяна в епігенетичній регуляції, регуляції транскрипції та регуляції після транскрипції.
-
Секвенування малих РНК-Illumina
Мала РНК відноситься до класу некодуючих молекул РНК, які зазвичай мають довжину менше 200 нт, включаючи мікроРНК (miRNA), малу інтерференційну РНК (siRNA) і РНК, що взаємодіє з piwi (piRNA).
МікроРНК (miRNA) — це клас ендогенної невеликої РНК довжиною близько 20-24 нт, яка відіграє різноманітні важливі регуляторні ролі в клітинах.мікроРНК бере участь у багатьох життєвих процесах, які виявляють тканинну – специфічну та стадію – специфічну експресію та високо консервативну у різних видів.
-
Секвенування circRNA-Illumina
Повне секвенування транскриптомів призначене для профілювання всіх типів молекул РНК, включаючи кодуючі (мРНК) і некодуючі РНК (включаючи lncRNA, circRNA і miRNA), які транскрибуються певними клітинами в певний час.Повне секвенування транскриптомів, також відоме як «загальне секвенування РНК», має на меті виявлення комплексних регуляторних мереж на рівні транскриптомів.Використовуючи переваги технології NGS, послідовності цілих продуктів транскриптому доступні для аналізу ceRNA та спільного аналізу РНК, що забезпечує перший крок до функціональної характеристики.Виявлення регуляторної мережі цеРНК на основі цирРНК-міРНК-мРНК.
-
Секвенування всієї транскриптоми – Illumina
Повне секвенування транскриптомів призначене для профілювання всіх типів молекул РНК, включаючи кодуючі (мРНК) і некодуючі РНК (включаючи lncRNA, circRNA і miRNA), які транскрибуються певними клітинами в певний час.Повне секвенування транскриптомів, також відоме як «загальне секвенування РНК», має на меті виявлення комплексних регуляторних мереж на рівні транскриптомів.Використовуючи переваги технології NGS, послідовності цілих продуктів транскриптому доступні для аналізу ceRNA та спільного аналізу РНК, що забезпечує перший крок до функціональної характеристики.Виявлення регуляторної мережі цеРНК на основі цирРНК-міРНК-мРНК.
-
Секвенування прокаріотичної РНК
Секвенування прокаріотичної РНК використовує секвенування наступного покоління (NGS) для виявлення присутності та кількості РНК у певний момент шляхом аналізу змінного клітинного транскриптому.Секвенування прокаріотичної РНК нашої компанії спеціально спрямоване на прокаріотів із еталонними геномами, надаючи вам профілювання транскриптомів, аналіз структури генів тощо. Його широко застосовують у фундаментальних наукових дослідженнях, дослідженнях та розробках ліків тощо.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
-
Секвенування метатранскриптомів
Секвенування метатранскриптомів визначає експресію генів мікробів (як еукаріотів, так і прокаріотів) у природному середовищі (тобто ґрунті, воді, морі, фекаліях та кишечнику). Зокрема, ці послуги дозволяють отримати повне профілювання експресії генів складних мікробних спільнот, таксономічний аналіз видів, аналіз функціонального збагачення різноекспресованих генів тощо.
Платформа: Illumina NovaSeq 6000
