-
Zaporedje mRNA polne dolžine-Nanopore
Zaporedje RNA je bilo neprecenljivo orodje za celovito analizo transkriptomov.Nedvomno je tradicionalno zaporedje kratkega branja tukaj doseglo številne pomembne napredke.Kljub temu se pogosto srečuje z omejitvami pri identifikaciji izoform v polni dolžini, kvantifikaciji, pristranskosti PCR.
Zaporedje nanopore se razlikuje od drugih platform za sekvenciranje, saj se nukleotidi berejo neposredno brez sinteze DNK in ustvarja dolgo branje pri desetinah kilobaz.To omogoča neposredno odčitavanje s prečkanjem prepisov celotne dolžine in spopadanje z izzivi v študijah na ravni izoform.
Platforma:Nanopore PromethION
Knjižnica:cDNA-PCR
-
De novo Zaporedje transkriptomov polne dolžine -PacBio
De novozaporedje transkriptomov po celotni dolžini, znano tudi kotDe novoIso-Seq uporablja prednosti PacBio sekvencerja v dolžini branja, ki omogoča sekvenciranje molekul cDNA polne dolžine brez prekinitev.S tem se popolnoma izognemo kakršnim koli napakam, ustvarjenim v korakih sestavljanja prepisov, in sestavimo unigene nize z ločljivostjo na ravni izoform.Ta unigenski niz zagotavlja močne genetske informacije kot "referenčni genom" na ravni transkriptoma.Poleg tega ta storitev v kombinaciji s podatki o zaporedju naslednje generacije omogoča natančno kvantificiranje izražanja na ravni izoform.
Platforma: PacBio Sequel IIKnjižnica: Knjižnica zvončkov SMRT -
Zaporedje evkariontske mRNA - Illumina
Zaporedje mRNA omogoča profiliranje vseh mRNA, prepisanih iz celic pod specifičnimi pogoji.Je zmogljiva tehnologija za razkrivanje profila genske ekspresije, genskih struktur in molekularnih mehanizmov nekaterih bioloških procesov.Do danes se je sekvenciranje mRNA široko uporabljalo v temeljnih raziskavah, klinični diagnostiki, razvoju zdravil itd.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Nereferenčno zaporedje mRNA-Illumina
Zaporedje mRNA uporablja tehniko sekvenciranja naslednje generacije (NGS) za zajemanje sporočilne RNA (mRNA) iz evkariontov v določenem obdobju, ko se nekatere posebne funkcije aktivirajo.Najdaljši prepis, ki je bil spojen, je bil imenovan 'Unigene' in uporabljen kot referenčno zaporedje za kasnejšo analizo, ki je učinkovito sredstvo za preučevanje molekularnega mehanizma in regulativne mreže vrste brez sklicevanja.
Po sestavljanju podatkov transkriptoma in unigenem funkcionalnem zapisu
(1) Izvedena bo analiza SNP, analiza SSR, napoved CDS in genska struktura.
(2) Izvedena bo količinska opredelitev unigenske ekspresije v vsakem vzorcu.
(3) Različno izraženi unigeni med vzorci (ali skupinami) bodo odkriti na podlagi unigene ekspresije
(4) Izvedeno bo združevanje, funkcionalna opomba in analiza obogatitve diferencialno izraženih unigenov
-
Dolgo nekodirano zaporedje-Illumina
Dolge nekodirajoče RNA (lncRNA) so vrsta molekul RNA z dolžino več kot 200 nt, za katere je značilen izjemno nizek kodirni potencial.LncRNA, kot ključni člen v nekodirajočih RNA, se večinoma nahaja v jedru in plazmi.Razvoj tehnologije sekvenciranja in bioinformtike omogoča identifikacijo številnih novih lncRNA in povezovanje teh z biološkimi funkcijami.Akumulativni dokazi kažejo, da je lncRNA v veliki meri vključena v epigenetsko regulacijo, regulacijo transkripcije in post-transkripcijsko regulacijo.
-
Zaporedje majhne RNA - Illumina
Majhna RNA se nanaša na razred nekodirajočih RNA molekul, ki so običajno manjše od 200 nt, vključno z mikro RNA (miRNA), majhno interferenčno RNA (siRNA) in RNA, ki deluje na piwi (piRNA).
MikroRNA (miRNA) je razred endogene majhne RNA z dolžino približno 20-24 nt, ki igra številne pomembne regulacijske vloge v celicah.miRNA je vključena v številne življenjske procese, ki razkrivajo specifično izražanje tkiva – specifično in stopnjo – specifično in zelo ohranjeno pri različnih vrstah.
-
zaporedje circRNA-Illumina
Celotno zaporedje transkriptomov je zasnovano za profiliranje vseh vrst molekul RNA, vključno s kodirnimi (mRNA) in nekodirajočimi RNA (vključno z lncRNA, circRNA in miRNA), ki jih določene celice prepisujejo ob določenem času.Celotno zaporedje transkriptomov, znano tudi kot "popolno sekvenciranje RNA", je namenjeno razkrivanju obsežnih regulativnih mrež na ravni transkriptoma.Z uporabo tehnologije NGS so zaporedja celotnih produktov transkriptoma na voljo za analizo ceRNA in skupno analizo RNA, ki zagotavlja prvi korak k funkcionalni karakterizaciji.Razkrivanje regulativne mreže ceRNA na osnovi circRNA-miRNA-mRNA.
-
Celotno zaporedje transkriptomov – Illumina
Celotno zaporedje transkriptomov je zasnovano za profiliranje vseh vrst molekul RNA, vključno s kodirnimi (mRNA) in nekodirajočimi RNA (vključno z lncRNA, circRNA in miRNA), ki jih določene celice prepisujejo ob določenem času.Celotno zaporedje transkriptomov, znano tudi kot "popolno sekvenciranje RNA", je namenjeno razkrivanju obsežnih regulativnih mrež na ravni transkriptoma.Z uporabo tehnologije NGS so zaporedja celotnih produktov transkriptoma na voljo za analizo ceRNA in skupno analizo RNA, ki zagotavlja prvi korak k funkcionalni karakterizaciji.Razkrivanje regulativne mreže ceRNA na osnovi circRNA-miRNA-mRNA.
-
Zaporedje prokariontske RNA
Zaporedje prokariontskih RNA uporablja sekvenciranje naslednje generacije (NGS), da razkrije prisotnost in količino RNA v danem trenutku z analizo spreminjajočega se celičnega transkriptoma.Zaporedje prokariontskih RNA našega podjetja je posebej namenjeno prokariotom z referenčnimi genomi, ki vam zagotavlja profiliranje transkriptomov, analizo genske strukture itd. Široko se uporablja pri temeljnih znanstvenih raziskavah, raziskavah in razvoju zdravil in še več.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Zaporedje metatranskriptomov
Zaporedje metatranskriptomov identificira gensko ekspresijo mikrobov (tako evkariontov kot prokariotov) v naravnih okoljih (tj. tla, voda, morje, iztrebki in črevesje). Natančneje, te storitve vam omogočajo, da pridobite profiliranje celotnega genskega izražanja kompleksnih mikrobnih skupnosti, taksonomsko analizo vrst, analiza funkcionalne obogatitve različno izraženih genov in drugo.
Platforma: Illumina NovaSeq 6000
