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全長mRNAシーケンシング-ナノポア
RNAシーケンスは、包括的なトランスクリプトーム解析のための非常に貴重なツールです。間違いなく、従来のショートリードシーケンスはここで多くの重要な開発を達成しました。それにもかかわらず、完全長のアイソフォームの同定、定量化、PCRバイアスに制限が生じることがよくあります。
ナノポアシーケンシングは、ヌクレオチドがDNA合成なしで直接読み取られ、数十キロベースで長い読み取りを生成するという点で、他のシーケンシングプラットフォームとは異なります。これにより、完全長の転写産物を直接読み取り、アイソフォームレベルの研究における課題に取り組むことができます。
プラットホーム：Nanopore PromethION
としょうかん：cDNA-PCR
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Denovoフルレングストランスクリプトームシーケンシング-PacBio
デノボ完全長トランスクリプトームシーケンシング、別名デノボIso-Seqは、読み取り長においてPacBioシーケンサーの利点を活用します。これにより、完全長のcDNA分子を中断することなくシーケンスできます。これにより、トランスクリプトのアセンブリ手順で生成されるエラーが完全に回避され、アイソフォームレベルの解像度でユニジーンセットが構築されます。この単一遺伝子セットは、トランスクリプトームレベルで「リファレンスゲノム」として強力な遺伝子情報を提供します。さらに、次世代のシーケンシングデータと組み合わせることで、このサービスはアイソフォームレベルの発現の正確な定量化を可能にします。
プラットフォーム：PacBio Sequel IIライブラリ：SMRTベルライブラリ -
真核生物のmRNAシーケンス-イルミナ
mRNAシーケンスにより、特定の条件下で細胞から転写されたすべてのmRNAのプロファイリングが可能になります。これは、特定の生物学的プロセスの遺伝子発現プロファイル、遺伝子構造、および分子メカニズムを明らかにするための強力なテクノロジーです。これまで、mRNAシーケンスは、基礎研究、臨床診断、医薬品開発などで広く採用されてきました。
プラットフォーム：Illumina NovaSeq 6000
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非リファレンスベースのmRNAシーケンス-イルミナ
mRNAシーケンシングは次世代シーケンシング技術（NGS）を採用して、いくつかの特別な機能が活性化している特定の期間に真核生物からメッセンジャーRNA（mRNA）を捕捉します。スプライシングされた最長の転写産物は「Unigene」と呼ばれ、その後の分析の参照配列として使用されました。これは、参照なしで種の分子メカニズムと調節ネットワークを研究するための効果的な手段です。
トランスクリプトームデータの組み立てと単一遺伝子の機能アノテーションの後
（1）SNP解析、SSR解析、CDS予測、遺伝子構造を行います。
（2）各サンプルの単一遺伝子発現の定量化を行います。
（3）サンプル（またはグループ）間で差次的に発現するユニジーンは、ユニジーンの発現に基づいて発見されます
（4）発現差のあるユニジーンのクラスタリング、機能アノテーション、エンリッチメント解析を行います
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長い非コーディングシーケンス-イルミナ
長鎖ノンコーディングRNA（lncRNA）は、長さが200 ntを超えるRNA分子の一種であり、コーディングの可能性が非常に低いという特徴があります。LncRNAは、非コードRNAの主要メンバーとして、主に核と血漿に見られます。シーケンシング技術とバイオインフォマティクスの開発により、多数の新規lncRNAを同定し、それらを生物学的機能と関連付けることができます。蓄積された証拠は、lncRNAがエピジェネティックな調節、転写調節、および転写後調節に広く関与していることを示唆しています。
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smallRNAシーケンシング-イルミナ
small RNAとは、マイクロRNA（miRNA）、スモール干渉RNA（siRNA）、piwi相互作用RNA（piRNA）など、通常200nt未満の長さの非コードRNA分子のクラスを指します。
マイクロRNA（miRNA）は、長さが約20〜24ntの内因性低分子RNAのクラスであり、細胞内でさまざまな重要な調節的役割を果たします。miRNAは、組織（特定およびステージ）を明らかにする多くの生命過程に関与し、特定の発現を示し、さまざまな種で高度に保存されています。
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circRNAシーケンシング-イルミナ
全トランスクリプトームシーケンシングは、特定の細胞によって特定の時間に転写されるコーディング（mRNA）および非コーディングRNA（lncRNA、circRNA、miRNAを含む）を含むすべてのタイプのRNA分子をプロファイリングするように設計されています。「トータルRNAシーケンシング」としても知られる全トランスクリプトームシーケンシングは、トランスクリプトームレベルでの包括的な規制ネットワークを明らかにすることを目的としています。NGSテクノロジーを利用して、トランスクリプトーム産物全体の配列をceRNA分析およびジョイントRNA分析に利用できます。これにより、機能の特性評価に向けた最初のステップが提供されます。circRNA-miRNA-mRNAベースのceRNAの調節ネットワークを明らかにする。
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全トランスクリプトームシーケンシング–イルミナ
全トランスクリプトームシーケンシングは、特定の細胞によって特定の時間に転写されるコーディング（mRNA）および非コーディングRNA（lncRNA、circRNA、miRNAを含む）を含むすべてのタイプのRNA分子をプロファイリングするように設計されています。「トータルRNAシーケンシング」としても知られる全トランスクリプトームシーケンシングは、トランスクリプトームレベルでの包括的な規制ネットワークを明らかにすることを目的としています。NGSテクノロジーを利用して、トランスクリプトーム産物全体の配列をceRNA分析およびジョイントRNA分析に利用できます。これにより、機能の特性評価に向けた最初のステップが提供されます。circRNA-miRNA-mRNAベースのceRNAの調節ネットワークを明らかにする。
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原核生物のRNAシーケンシング
原核生物のRNAシーケンスでは、次世代シーケンス（NGS）を使用して、変化する細胞トランスクリプトームを分析することにより、特定の瞬間におけるRNAの存在と量を明らかにします。当社の原核生物RNAシーケンスは、特にリファレンスゲノムを持つ原核生物を対象としており、トランスクリプトームプロファイリングや遺伝子構造解析などを提供します。これは、基礎科学研究、薬物研究開発などに広く適用されています。
プラットフォーム：Illumina NovaSeq 6000
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メタトランスクリプトームシーケンス
メタトランスクリプトームシーケンシングは、自然環境（すなわち、土壌、水、海、糞便、腸）内の微生物（真核生物と原核生物の両方）の遺伝子発現を識別します。具体的には、このサービスにより、複雑な微生物群集の全遺伝子発現プロファイリング、分類学的分析を取得できます。種の分析、発現の異なる遺伝子の機能強化分析など。
プラットフォーム：Illumina NovaSeq 6000
