-
Tout longè mRNA sekans-Nanopore
Sekans RNA se yon zouti anpil valè pou analiz transcriptom konplè.San dout, sekans lekti kout tradisyonèl reyalize anpil devlopman enpòtan isit la.Men, li souvan rankontre limit nan idantifikasyon izoform plen longè, quantification, patipri PCR.
Nanopore sekans distenge tèt li ak lòt platfòm sekans, nan ke nukleotid yo li dirèkteman san sentèz ADN ak jenere lekti long nan dè dizèn de kilobaz.Sa a pèmèt lekti dirèk travèse relve nòt plen longè ak abòde defi yo nan syans nan nivo isoform.
Platfòm：Nanopore PromethION
Bibliyotèk:cDNA-PCR
-
De novo Full-length Transcriptome sekans -PacBio
De novosekans transcriptom plen longè, ke yo rele touDe novoIso-Seq pran avantaj ki genyen nan sekansè PacBio nan longè lekti, ki pèmèt sekans nan molekil cDNA plen longè san okenn repo.Sa a konplètman evite nenpòt erè ki te pwodwi nan etap asanble transkripsyon ak konstwi seri unigene ak rezolisyon nivo isoform.Ansanm unigene sa a bay enfòmasyon jenetik pwisan kòm "referans genòm" nan nivo transcriptome.Anplis de sa, konbine avèk pwochen jenerasyon done sekans, sèvis sa a pèmèt yon quantification egzat nan ekspresyon nivo isoform.
Platfòm: PacBio Sequel IIBibliyotèk: SMRT bell library -
Eukaryotic mRNA sekans-Illumina
Sekans mRNA pèmèt profilage tout mRNA transkripte nan selil yo nan kondisyon espesifik.Li se yon teknoloji pwisan pou revele pwofil ekspresyon jèn, estrikti jèn ak mekanis molekilè nan sèten pwosesis byolojik.Jiska dat, sekans mRNA te lajman itilize nan rechèch fondamantal, dyagnostik klinik, devlopman dwòg, elatriye.
Platfòm: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekans mRNA ki pa baze sou referans-Illumina
Sekans mRNA adopte teknik sekans pwochen jenerasyon (NGS) pou pran mesaje RNA (mRNA) fòm Eukaryote nan peryòd espesifik ke kèk fonksyon espesyal yo aktive.Transkripsyon ki pi long spliced te rele 'Unigene' epi itilize kòm sekans referans pou analiz ki vin apre, ki se yon mwayen efikas pou etidye mekanis molekilè ak rezo regilasyon espès yo san referans.
Apre transcriptome done asanble ak anotasyon fonksyonèl unigene
(1) Analiz SNP, analiz SSR, prediksyon CDS ak estrikti jèn yo pral prefòme.
(2) Kantifikasyon ekspresyon unigene nan chak echantiyon yo pral fèt.
(3) Yo pral dekouvri yonijèn ki eksprime diferan ant echantiyon (oswa gwoup) ki baze sou ekspresyon unigene.
(4) Yo pral fè gwoupman, anotasyon fonksyonèl ak analiz anrichisman nan unigenes ki eksprime diferan.
-
Long ki pa kodaj sekans-Illumina
Long ki pa kodaj RNAs (lncRNAs) se yon kalite molekil RNA ak longè ki depase 200 nt, ki karakterize pa potansyèl kodaj ki ba anpil.LncRNA, kòm yon manm kle nan RNAs ki pa kodaj, yo jwenn sitou nan nwayo ak plasma.Devlopman nan teknoloji sekans ak bioinformtics pèmèt idantifikasyon anpil lncRNAs roman ak asosye sa yo ak fonksyon byolojik.Prèv akimilasyon sijere ke lncRNA se lajman patisipe nan règleman epigenetik, règleman transkripsyon ak règleman pòs-transkripsyon.
-
Ti RNA sekans-Illumina
Ti RNA refere a yon klas molekil RNA ki pa kode ki anjeneral mwens pase 200nt nan longè, ki gen ladan mikwo RNA (miRNA), ti entèferans RNA (siRNA), ak piwi-interacting RNA (piRNA).
MicroRNA (miRNA) se yon klas ti RNA andojèn ak yon longè apeprè 20-24nt, ki jwe yon varyete wòl regilasyon enpòtan nan selil yo.miRNA patisipe nan anpil pwosesis lavi ki revele tisi - espesifik ak etap - ekspresyon espesifik ak trè konsève nan diferan espès.
-
circRNA sekans-Illumina
Sekans transcriptom antye fèt pou pwofite tout kalite molekil RNA, ki gen ladan kodaj (mRNA) ak RNA ki pa kode (ki gen ladan lncRNA, circRNA ak miRNA) ki transkri pa selil espesifik nan yon sèten tan.Sekans transcriptom antye, ke yo rele tou "sekans RNA total" gen pou objaktif pou revele rezo regilasyon konplè nan nivo transcriptome.Pran avantaj de teknoloji NGS, sekans tout pwodwi transcriptome yo disponib pou analiz ceRNA ak analiz RNA jwenti, ki bay premye etap nan direksyon pou karakterizasyon fonksyonèl.Revele rezo regilasyon nan ceRNA ki baze sou circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekans transcriptom antye - Illumina
Sekans transcriptom antye fèt pou pwofite tout kalite molekil RNA, ki gen ladan kodaj (mRNA) ak RNA ki pa kode (ki gen ladan lncRNA, circRNA ak miRNA) ki transkri pa selil espesifik nan yon sèten tan.Sekans transcriptom antye, ke yo rele tou "sekans RNA total" gen pou objaktif pou revele rezo regilasyon konplè nan nivo transcriptome.Pran avantaj de teknoloji NGS, sekans tout pwodwi transcriptome yo disponib pou analiz ceRNA ak analiz RNA jwenti, ki bay premye etap nan direksyon pou karakterizasyon fonksyonèl.Revele rezo regilasyon nan ceRNA ki baze sou circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekans prokaryotik RNA
Prokaryotic RNA sekans itilize pwochen jenerasyon sekans (NGS) pou revele prezans ak kantite RNA nan yon moman bay, lè li analize transcriptome selilè ki chanje.Sekans prokaryotic RNA konpayi nou an, espesyalman vize nan prokaryot ak jenom referans, bay ou ak profilage transcriptome, analiz estrikti jèn, elatriye Li te lajman aplike nan rechèch syans debaz, rechèch dwòg ak devlopman, ak plis ankò.
Platfòm: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekans metatranskriptòm
Metatranscriptome sekans idantifye ekspresyon jèn nan mikwòb (tou de ekaryot ak prokaryot) nan anviwònman natirèl (sa vle di tè, dlo, lanmè, poupou, ak zantray). espès yo, analiz fonksyonèl anrichisman jèn yo eksprime yon fason diferan, ak plis ankò.
Platfòm: Illumina NovaSeq 6000
