مصنوعات

میٹاجینوم حیاتیات کی مخلوط برادری کے جینیاتی مواد کا مجموعہ ہے، جیسے ماحولیاتی اور انسانی میٹاجینوم۔ اس میں قابل کاشت اور ناقابل کاشت دونوں مائکروجنزموں کے جینوم ہوتے ہیں۔ میٹجینومک سیکوینسنگ ٹیکسونومک پروفائلنگ سے زیادہ فراہم کرکے ماحولیاتی نمونوں میں سرایت شدہ ان پیچیدہ جینومک مناظر کے مطالعہ کو قابل بناتی ہے۔ یہ انکوڈ شدہ جینوں اور ماحولیاتی عمل میں ان کے اہم کرداروں کو تلاش کرکے ایک فعال جینومکس نقطہ نظر بھی پیش کرتا ہے۔ اگرچہ Illumina کی ترتیب کے ساتھ روایتی شاٹگن کے نقطہ نظر کو میٹاجینومک مطالعات میں بڑے پیمانے پر استعمال کیا گیا ہے، نانوپور اور PacBio کی طویل پڑھنے والی ترتیب کی آمد نے میدان کو تبدیل کر دیا ہے۔ Nanopore اور PacBio ٹکنالوجی نیچے کی طرف بایو انفارمیٹک تجزیوں کو بڑھاتی ہے، خاص طور پر میٹاجینوم اسمبلی، مزید مسلسل اسمبلیوں کو یقینی بناتی ہے۔ رپورٹس بتاتی ہیں کہ نانوپور پر مبنی اور PacBio پر مبنی میٹاجینومکس نے پیچیدہ مائکرو بایوم (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020) سے کامیابی کے ساتھ مکمل اور بند بیکٹیریل جینوم تیار کیے ہیں۔ نانوپور ریڈز کو ایلومینا ریڈز کے ساتھ ضم کرنا نینو پور کی موروثی کم درستگی کو کم کرتے ہوئے، غلطی کی اصلاح کے لیے ایک اسٹریٹجک نقطہ نظر فراہم کرتا ہے۔ یہ ہم آہنگی کا امتزاج ہر ترتیب دینے والے پلیٹ فارم کی طاقتوں کا فائدہ اٹھاتا ہے، ممکنہ حدوں پر قابو پانے اور میٹجینومک تجزیوں کی درستگی اور وشوسنییتا کو آگے بڑھانے کے لیے ایک مضبوط حل پیش کرتا ہے۔

پلیٹ فارم: Nanopore PromethION 48، Illumia اور PacBio Revio