-
முழு நீள mRNA வரிசைமுறை-நானோபூர்
ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையானது விரிவான டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் பகுப்பாய்விற்கான ஒரு விலைமதிப்பற்ற கருவியாகும்.சந்தேகத்திற்கு இடமின்றி, பாரம்பரிய குறுகிய வாசிப்பு வரிசைமுறை இங்கு பல முக்கியமான வளர்ச்சியை அடைந்தது.ஆயினும்கூட, இது பெரும்பாலும் முழு நீள ஐசோஃபார்ம் அடையாளங்கள், அளவு, PCR சார்பு ஆகியவற்றில் வரம்புகளை சந்திக்கிறது.
நானோபோர் சீக்வென்சிங் மற்ற வரிசைமுறை தளங்களில் இருந்து தன்னை வேறுபடுத்திக் கொள்கிறது, இதில் நியூக்ளியோடைடுகள் டிஎன்ஏ தொகுப்பு இல்லாமல் நேரடியாகப் படிக்கப்படுகின்றன மற்றும் பல்லாயிரக்கணக்கான கிலோபேஸ்களில் நீண்ட வாசிப்பை உருவாக்குகின்றன.இது முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டுகளை நேரடியாகப் படிக்கவும், ஐசோஃபார்ம்-நிலை ஆய்வுகளில் உள்ள சவால்களைச் சமாளிக்கவும் உதவுகிறது.
நடைமேடை：நானோபூர் ப்ரோமேதியன்
நூலகம்:சிடிஎன்ஏ-பிசிஆர்
-
டி நோவோ முழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை -PacBio
டி நோவோமுழு நீள டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங், என்றும் அழைக்கப்படுகிறதுடி நோவோIso-Seq PacBio சீக்வென்சரின் நன்மைகளை வாசிப்பு நீளத்தில் எடுத்துக்கொள்கிறது, இது எந்த இடைவெளியும் இல்லாமல் முழு நீள சிடிஎன்ஏ மூலக்கூறுகளை வரிசைப்படுத்த உதவுகிறது.இது டிரான்ஸ்கிரிப்ட் அசெம்பிளி படிகளில் ஏற்படும் எந்தப் பிழையையும் முற்றிலும் தவிர்க்கிறது மற்றும் ஐசோஃபார்ம்-நிலைத் தீர்மானத்துடன் யூனிஜீன் செட்களை உருவாக்குகிறது.இந்த யுனிஜீன் தொகுப்புகள் டிரான்ஸ்கிரிப்டோம்-நிலையில் "குறிப்பு மரபணு" என சக்திவாய்ந்த மரபணு தகவலை வழங்குகிறது.கூடுதலாக, அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை தரவுகளுடன் இணைந்து, இந்தச் சேவையானது ஐசோஃபார்ம்-நிலை வெளிப்பாட்டின் துல்லியமான அளவீட்டை மேம்படுத்துகிறது.
தளம்: PacBio தொடர்ச்சி IIநூலகம்: SMRT மணி நூலகம் -
யூகாரியோடிக் எம்ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை-இலுமினா
mRNA வரிசைமுறையானது குறிப்பிட்ட நிபந்தனைகளின் கீழ் செல்களிலிருந்து படியெடுத்த அனைத்து mRNAகளின் விவரக்குறிப்பை செயல்படுத்துகிறது.இது மரபணு வெளிப்பாடு சுயவிவரம், மரபணு கட்டமைப்புகள் மற்றும் சில உயிரியல் செயல்முறைகளின் மூலக்கூறு வழிமுறைகளை வெளிப்படுத்தும் சக்திவாய்ந்த தொழில்நுட்பமாகும்.இன்றுவரை, mRNA வரிசைமுறையானது அடிப்படை ஆராய்ச்சி, மருத்துவ நோயறிதல், மருந்து மேம்பாடு போன்றவற்றில் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
இயங்குதளம்: Illumina NovaSeq 6000
-
குறிப்பு அல்லாத mRNA வரிசைமுறை-இல்லுமினா
mRNA வரிசைமுறையானது, சில சிறப்புச் செயல்பாடுகள் செயல்படுத்தப்படும் குறிப்பிட்ட காலகட்டத்தில் யூகாரியோட்டின் தூதுவர் RNA(mRNA) வடிவத்தைப் பிடிக்க அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறை நுட்பத்தை (NGS) ஏற்றுக்கொள்கிறது.பிரிக்கப்பட்ட மிக நீளமான டிரான்ஸ்கிரிப்ட் 'யுனிஜீன்' என்று அழைக்கப்பட்டது மற்றும் அடுத்தடுத்த பகுப்பாய்விற்கான குறிப்பு வரிசையாகப் பயன்படுத்தப்பட்டது, இது குறிப்பு இல்லாமல் உயிரினங்களின் மூலக்கூறு வழிமுறை மற்றும் ஒழுங்குமுறை வலையமைப்பை ஆய்வு செய்வதற்கான ஒரு சிறந்த வழிமுறையாகும்.
டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் டேட்டா அசெம்பிளி மற்றும் யூனிஜீன் செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்புக்குப் பிறகு
(1)SNP பகுப்பாய்வு, SSR பகுப்பாய்வு, CDS முன்கணிப்பு மற்றும் மரபணு அமைப்பு ஆகியவை முன்கூட்டியே வடிவமைக்கப்படும்.
(2)ஒவ்வொரு மாதிரியிலும் யூனிஜீன் வெளிப்பாட்டின் அளவீடு செய்யப்படும்.
(3) மாதிரிகள் (அல்லது குழுக்கள்) இடையே வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட யூனிஜீன்கள் யூனிஜீன் வெளிப்பாட்டின் அடிப்படையில் கண்டறியப்படும்
(4) வேறுபட்ட வெளிப்படுத்தப்பட்ட யூனிஜீன்களின் கிளஸ்டரிங், செயல்பாட்டு சிறுகுறிப்பு மற்றும் செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு செய்யப்படும்
-
நீண்ட குறியீட்டு அல்லாத வரிசைமுறை-இல்லுமினா
நீண்ட குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏக்கள் (எல்என்சிஆர்என்ஏக்கள்) என்பது 200 என்டிக்கு மேல் நீளம் கொண்ட ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளின் வகையாகும், இவை மிகக் குறைந்த குறியீட்டு திறன் கொண்டவை.எல்என்சிஆர்என்ஏ, குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏக்களில் முக்கிய உறுப்பினராக உள்ளது, முக்கியமாக நியூக்ளியஸ் மற்றும் பிளாஸ்மாவில் காணப்படுகிறது.வரிசைப்படுத்துதல் தொழில்நுட்பம் மற்றும் உயிர் தகவலியல் வளர்ச்சியானது பல நாவல் எல்என்சிஆர்என்ஏக்களை அடையாளம் காணவும், உயிரியல் செயல்பாடுகளுடன் தொடர்புபடுத்தவும் உதவுகிறது.எல்என்சிஆர்என்ஏ எபிஜெனெடிக் ஒழுங்குமுறை, டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஒழுங்குமுறை மற்றும் பிந்தைய டிரான்ஸ்கிரிப்ஷன் ஒழுங்குமுறை ஆகியவற்றில் பரவலாக ஈடுபட்டுள்ளது என்று திரட்டப்பட்ட சான்றுகள் தெரிவிக்கின்றன.
-
சிறிய ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை-இல்லுமினா
சிறிய ஆர்என்ஏ என்பது மைக்ரோ ஆர்என்ஏ (மைஆர்என்ஏ), சிறிய குறுக்கீடு ஆர்என்ஏ (சிஆர்என்ஏ) மற்றும் பிவி-இன்டராக்டிங் ஆர்என்ஏ (பைஆர்என்ஏ) உட்பட பொதுவாக 200ன்டிக்கும் குறைவான நீளமுள்ள குறியீட்டு அல்லாத ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளின் வகுப்பைக் குறிக்கிறது.
மைக்ரோஆர்என்ஏ (மைஆர்என்ஏ) என்பது சுமார் 20-24ன்டி நீளம் கொண்ட எண்டோஜெனஸ் சிறிய ஆர்என்ஏ வகுப்பாகும், இது உயிரணுக்களில் பல்வேறு முக்கிய ஒழுங்குமுறை பாத்திரங்களை வகிக்கிறது.மைஆர்என்ஏ பல வாழ்க்கை செயல்முறைகளில் ஈடுபட்டுள்ளது, இது திசுக்களை வெளிப்படுத்துகிறது - குறிப்பிட்ட மற்றும் நிலை - குறிப்பிட்ட வெளிப்பாடு மற்றும் பல்வேறு உயிரினங்களில் மிகவும் பாதுகாக்கப்படுகிறது.
-
சர்க்ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை-இல்லுமினா
முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங் என்பது அனைத்து வகையான ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளையும் விவரிப்பதற்காக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது, குறியிடுதல் (எம்ஆர்என்ஏ) மற்றும் குறியிடாத ஆர்என்ஏக்கள் (எல்என்சிஆர்என்ஏ, சர்க்ஆர்என்ஏ மற்றும் மைஆர்என்ஏ உட்பட) ஆகியவை ஒரு குறிப்பிட்ட நேரத்தில் குறிப்பிட்ட செல்கள் மூலம் படியெடுக்கப்படுகின்றன.முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங், "மொத்த ஆர்என்ஏ சீக்வென்சிங்" என்றும் அழைக்கப்படுகிறது, இது டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் மட்டத்தில் விரிவான ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளை வெளிப்படுத்துவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது.NGS தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி, முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தயாரிப்புகளின் வரிசைகளும் ceRNA பகுப்பாய்வு மற்றும் கூட்டு RNA பகுப்பாய்வுக்கு கிடைக்கின்றன, இது செயல்பாட்டுத் தன்மையை நோக்கிய முதல் படியை வழங்குகிறது.சர்க்ஆர்என்ஏ-மைஆர்என்ஏ-எம்ஆர்என்ஏ அடிப்படையிலான சிஆர்என்ஏவின் ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்கை வெளிப்படுத்துகிறது.
-
முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை - இல்லுமினா
முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங் என்பது அனைத்து வகையான ஆர்என்ஏ மூலக்கூறுகளையும் விவரிப்பதற்காக வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது, குறியிடுதல் (எம்ஆர்என்ஏ) மற்றும் குறியிடாத ஆர்என்ஏக்கள் (எல்என்சிஆர்என்ஏ, சர்க்ஆர்என்ஏ மற்றும் மைஆர்என்ஏ உட்பட) ஆகியவை ஒரு குறிப்பிட்ட நேரத்தில் குறிப்பிட்ட செல்கள் மூலம் படியெடுக்கப்படுகின்றன.முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் சீக்வென்சிங், "மொத்த ஆர்என்ஏ சீக்வென்சிங்" என்றும் அழைக்கப்படுகிறது, இது டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் மட்டத்தில் விரிவான ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்குகளை வெளிப்படுத்துவதை நோக்கமாகக் கொண்டுள்ளது.NGS தொழில்நுட்பத்தைப் பயன்படுத்தி, முழு டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் தயாரிப்புகளின் வரிசைகளும் ceRNA பகுப்பாய்வு மற்றும் கூட்டு RNA பகுப்பாய்வுக்கு கிடைக்கின்றன, இது செயல்பாட்டுத் தன்மையை நோக்கிய முதல் படியை வழங்குகிறது.சர்க்ஆர்என்ஏ-மைஆர்என்ஏ-எம்ஆர்என்ஏ அடிப்படையிலான சிஆர்என்ஏவின் ஒழுங்குமுறை நெட்வொர்க்கை வெளிப்படுத்துகிறது.
-
புரோகாரியோடிக் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறை
ப்ரோகாரியோடிக் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையானது, மாறிவரும் செல்லுலார் டிரான்ஸ்கிரிப்டோமை பகுப்பாய்வு செய்வதன் மூலம், ஒரு குறிப்பிட்ட தருணத்தில் ஆர்என்ஏவின் இருப்பு மற்றும் அளவை வெளிப்படுத்த அடுத்த தலைமுறை வரிசைமுறையை (என்ஜிஎஸ்) பயன்படுத்துகிறது.எங்கள் நிறுவனத்தின் ப்ரோகாரியோடிக் ஆர்என்ஏ வரிசைமுறையானது, குறிப்பான மரபணுக்களுடன் கூடிய புரோகாரியோட்களை குறிவைத்து, டிரான்ஸ்கிரிப்டோம் விவரக்குறிப்பு, மரபணு அமைப்பு பகுப்பாய்வு போன்றவற்றை உங்களுக்கு வழங்குகிறது. இது அடிப்படை அறிவியல் ஆராய்ச்சி, மருந்து ஆராய்ச்சி மற்றும் மேம்பாடு மற்றும் பலவற்றில் பரவலாகப் பயன்படுத்தப்படுகிறது.
இயங்குதளம்: Illumina NovaSeq 6000
-
மெட்டாட்ரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறை
மெட்டாட்ரான்ஸ்கிரிப்டோம் வரிசைமுறையானது, இயற்கையான சூழலில் (அதாவது மண், நீர், கடல், மலம் மற்றும் குடல்) நுண்ணுயிரிகளின் (யூகாரியோட்டுகள் மற்றும் புரோகாரியோட்டுகள் இரண்டும்) மரபணு வெளிப்பாட்டை அடையாளப்படுத்துகிறது. இனங்கள், வித்தியாசமாக வெளிப்படுத்தப்பட்ட மரபணுக்களின் செயல்பாட்டு செறிவூட்டல் பகுப்பாய்வு மற்றும் பல.
இயங்குதளம்: Illumina NovaSeq 6000
