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Secuenciación de ARNm de longitud completa-Nanopore
La secuenciación del ARN ha sido una herramienta invaluable para el análisis completo del transcriptoma.Sin duda, la secuenciación tradicional de lectura corta logró numerosos desarrollos importantes aquí.Sin embargo, a menudo encuentra limitaciones en las identificaciones de isoformas de longitud completa, cuantificación, sesgo de PCR.
La secuenciación de nanoporos se distingue de otras plataformas de secuenciación en que los nucleótidos se leen directamente sin síntesis de ADN y genera una lectura larga de decenas de kilobases.Esto permite la lectura directa cruzando transcripciones completas y abordando los desafíos en los estudios de nivel de isoforma.
Plataforma：PromethION de nanoporos
Biblioteca:ADNc-PCR
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Secuenciación de transcriptoma de longitud completa de novo -PacBio
de novosecuenciación del transcriptoma de longitud completa, también conocida comode novoIso-Seq aprovecha las ventajas del secuenciador PacBio en la longitud de lectura, lo que permite la secuenciación de moléculas de cDNA de longitud completa sin interrupciones.Esto evita por completo los errores generados en los pasos de ensamblaje de la transcripción y construye conjuntos unígenos con resolución de nivel de isoforma.Este conjunto de unigenes proporciona información genética poderosa como "genoma de referencia" a nivel de transcriptoma.Además, al combinarse con datos de secuenciación de próxima generación, este servicio permite una cuantificación precisa de la expresión a nivel de isoforma.
Plataforma: PacBio Sequel IIBiblioteca: biblioteca de campana SMRT -
Secuenciación de ARNm eucariótico-Illumina
La secuenciación de ARNm permite la elaboración de perfiles de todos los ARNm transcritos de células en condiciones específicas.Es una tecnología poderosa para revelar el perfil de expresión génica, las estructuras génicas y los mecanismos moleculares de ciertos procesos biológicos.Hasta la fecha, la secuenciación de ARNm se ha empleado ampliamente en investigación fundamental, diagnóstico clínico, desarrollo de fármacos, etc.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
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Secuenciación de ARNm no basada en referencia: Illumina
La secuenciación de ARNm adopta la técnica de secuenciación de próxima generación (NGS) para capturar el ARN mensajero (ARNm) de eucariotas en un período específico en el que se activan algunas funciones especiales.La transcripción empalmada más larga se denominó 'Unigene' y se usó como secuencia de referencia para el análisis posterior, que es un medio eficaz para estudiar el mecanismo molecular y la red reguladora de la especie sin referencia.
Después del ensamblaje de datos del transcriptoma y la anotación funcional unigene
(1) Se realizarán análisis SNP, análisis SSR, predicción CDS y estructura génica.
(2) Se realizará la cuantificación de la expresión unigénica en cada muestra.
(3) Los unigenes expresados diferencialmente entre muestras (o grupos) se descubrirán en función de la expresión unigene
(4) Se realizarán análisis de agrupamiento, anotación funcional y enriquecimiento de unigenes expresados diferencialmente.
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Secuenciación larga sin codificación-Illumina
Los ARN largos no codificantes (lncRNA) son un tipo de moléculas de ARN con una longitud superior a 200 nt, que se caracterizan por un potencial de codificación extremadamente bajo.LncRNA, como miembro clave en los ARN no codificantes, se encuentra principalmente en el núcleo y el plasma.El desarrollo de la tecnología de secuenciación y la bioinformática permite identificar numerosos lncRNA nuevos y asociarlos con funciones biológicas.Las evidencias acumuladas sugieren que el lncRNA está ampliamente involucrado en la regulación epigenética, la regulación de la transcripción y la regulación posterior a la transcripción.
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Secuenciación de ARN pequeño-Illumina
El ARN pequeño se refiere a una clase de moléculas de ARN no codificantes que generalmente tienen menos de 200 nt de longitud, incluido el micro ARN (miARN), el ARN de interferencia pequeño (siARN) y el ARN que interactúa con piwi (piARN).
El microARN (miARN) es una clase de ARN pequeño endógeno con una longitud de aproximadamente 20-24 nt, que desempeña una variedad de funciones reguladoras importantes en las células.miARN involucrado en muchos procesos de vida que revelan expresión específica de tejido y etapa específica y altamente conservada en diferentes especies.
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Secuenciación de circRNA-Illumina
La secuenciación del transcriptoma completo está diseñada para perfilar todos los tipos de moléculas de ARN, incluidos los ARN codificantes (ARNm) y no codificantes (incluidos lncRNA, circRNA y miRNA) que se transcriben en células específicas en un momento determinado.La secuenciación del transcriptoma completo, también conocida como "secuenciación del ARN total", tiene como objetivo revelar redes reguladoras integrales a nivel del transcriptoma.Aprovechando la tecnología NGS, las secuencias de productos transcriptómicos completos están disponibles para el análisis de ARNce y el análisis de ARN conjunto, lo que proporciona el primer paso hacia la caracterización funcional.Reveladora red reguladora de ceRNA basada en circRNA-miRNA-mRNA.
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Secuenciación del transcriptoma completo: Illumina
La secuenciación del transcriptoma completo está diseñada para perfilar todos los tipos de moléculas de ARN, incluidos los ARN codificantes (ARNm) y no codificantes (incluidos lncRNA, circRNA y miRNA) que se transcriben en células específicas en un momento determinado.La secuenciación del transcriptoma completo, también conocida como "secuenciación del ARN total", tiene como objetivo revelar redes reguladoras integrales a nivel del transcriptoma.Aprovechando la tecnología NGS, las secuencias de productos transcriptómicos completos están disponibles para el análisis de ARNce y el análisis de ARN conjunto, lo que proporciona el primer paso hacia la caracterización funcional.Reveladora red reguladora de ceRNA basada en circRNA-miRNA-mRNA.
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Secuenciación de ARN procariótico
La secuenciación de ARN procariótico utiliza la secuenciación de próxima generación (NGS) para revelar la presencia y la cantidad de ARN en un momento dado, mediante el análisis del transcriptoma celular cambiante.La secuenciación de ARN procariótico de nuestra empresa apunta específicamente a los procariotas con genomas de referencia, brindándole perfiles transcriptómicos, análisis de estructura genética, etc. Se ha aplicado ampliamente a la investigación científica básica, la investigación y el desarrollo de fármacos, y más.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
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Secuenciación del metatranscriptoma
La secuenciación del metatranscriptoma identifica la expresión génica de microbios (tanto eucariotas como procariotas) dentro de entornos naturales (es decir, suelo, agua, mar, heces e intestinos). Específicamente, este servicio le permite obtener perfiles completos de expresión génica de comunidades microbianas complejas, análisis taxonómico de especies, análisis de enriquecimiento funcional de genes expresados de manera diferente, y más.
Plataforma: Illumina NovaSeq 6000
