T2T ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ, ਗੈਪ ਫ੍ਰੀ ਜੀਨੋਮ
1stਦੋ ਚਾਵਲ ਜੀਨੋਮ1
ਸਿਰਲੇਖ: ਜ਼ਿਆਨ/ਇੰਡਿਕਾ ਰਾਈਸ ਲਈ ਦੋ ਗੈਪ-ਫ੍ਰੀ ਰੈਫਰੈਂਸ ਜੀਨੋਮਜ਼ ਦੀ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ ਪਲਾਂਟ ਸੈਂਟਰੋਮੇਰ ਆਰਕੀਟੈਕਚਰ ਦੀ ਜਾਣਕਾਰੀ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੀ ਹੈ
ਦੋਈ:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
ਪੋਸਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸਮਾਂ: ਜਨਵਰੀ 01, 2021।
ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ: ਹੁਆਜ਼ੋਂਗ ਐਗਰੀਕਲਚਰਲ ਯੂਨੀਵਰਸਿਟੀ, ਚੀਨ
ਸਮੱਗਰੀ
ਓ. ਸੈਟੀਵਾ ਜ਼ਿਆਨ/ਇੰਡਿਕਾਚੌਲਾਂ ਦੀਆਂ ਕਿਸਮਾਂ 'Zhenshan 97 (ZS97)' ਅਤੇ 'Minghui 63 (MH63)
ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਰਣਨੀਤੀ
NGS ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ + HiFi ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ + CLR ਪੜ੍ਹਦਾ ਹੈ + BioNano + Hi-C
ਡਾਟਾ:
ZS97: 8.34 Gb（~23x）HiFi ਰੀਡਜ਼ + 48.39 Gb (~131x) CLR ਰੀਡਜ਼ + 25 Gb(~69x) NGS + 2 ਬਾਇਓ ਨੈਨੋ ਆਇਰੀਜ਼ ਸੈੱਲ
MH63: 37.88 Gb (~103x) HiFi ਰੀਡਜ਼ + 48.97 Gb (~132x) CLR ਰੀਡਜ਼ + 28 Gb(~76x) NGS + 2 ਬਾਇਓ ਨੈਨੋ ਆਇਰੀਜ਼ ਸੈੱਲ
ਚਿੱਤਰ 1 ਚੌਲਾਂ ਦੇ ਦੋ ਅੰਤਰ-ਮੁਕਤ ਜੀਨੋਮ (MH63 ਅਤੇ ZS97)
2ndਕੇਲਾ ਜੀਨੋਮ2
ਸਿਰਲੇਖ: ਨੈਨੋਪੋਰ ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਕੇਲੇ ਦੇ ਟੈਲੋਮੇਰ-ਟੂ-ਟੇਲੋਮੇਰ ਗੈਪਲੈੱਸ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ
ਦੋਈ:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
ਪੋਸਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸਮਾਂ: ਅਪ੍ਰੈਲ 17, 2021।
ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ: ਯੂਨੀਵਰਸਿਟੀ ਪੈਰਿਸ-ਸੈਕਲੇ, ਫਰਾਂਸ
ਸਮੱਗਰੀ
ਡਬਲ ਹੈਪਲੋਇਡਮੂਸਾ ਐਕੂਮੀਨਾਟਾsppmalaccensis(DH-ਪਹੰਗ)
ਲੜੀਬੱਧ ਰਣਨੀਤੀ ਅਤੇ ਡੇਟਾ:
HiSeq2500 PE250 ਮੋਡ + MinION/ PromethION (93Gb,~200X )+ ਆਪਟੀਕਲ ਨਕਸ਼ਾ (DLE-1+BspQ1)
ਟੇਬਲ 1 ਮੂਸਾ ਐਕੂਮੀਨਾਟਾ (ਡੀਐਚ-ਪਹਾਂਗ) ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀਆਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ
ਚਿੱਤਰ 2 ਮੂਸਾ ਜੀਨੋਮ ਆਰਕੀਟੈਕਚਰ ਦੀ ਤੁਲਨਾ
3rdਫਾਈਓਡੈਕਟਿਲਮ ਟ੍ਰਾਈਕੋਰਨਟਮ ਜੀਨੋਮ3
ਸਿਰਲੇਖ: ਟੈਲੋਮੇਰ-ਟੂ-ਟੇਲੋਮੇਰ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਦੀP
haeodactylum tricornutum
ਦੋਈ:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
ਪੋਸਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸਮਾਂ: ਮਈ 04, 2021
ਸੰਸਥਾ: ਪੱਛਮੀ ਯੂਨੀਵਰਸਿਟੀ, ਕੈਨੇਡਾ
ਸਮੱਗਰੀ
ਫਾਈਓਡੈਕਟਿਲਮ ਟ੍ਰਾਈਕੋਰਨਟਮ(ਐਲਗੀ ਅਤੇ ਪ੍ਰੋਟੋਜ਼ੋਆ ਦਾ ਕਲਚਰ ਕਲੈਕਸ਼ਨ CCAP 1055/1)
ਲੜੀਬੱਧ ਰਣਨੀਤੀ ਅਤੇ ਡੇਟਾ:
1 ਆਕਸਫੋਰਡ ਨੈਨੋਪੋਰ ਮਿਨੀਅਨ ਫਲੋ ਸੈੱਲ + ਇੱਕ 2×75 ਪੇਅਰਡ-ਐਂਡ ਮਿਡ-ਆਉਟਪੁੱਟ NextSeq 550 ਰਨ
ਚਿੱਤਰ 3 ਟੈਲੋਮੇਰ-ਟੂ-ਟੈਲੋਮੇਰ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ ਲਈ ਵਰਕਫਲੋ
4thਮਨੁੱਖੀ CHM13 ਜੀਨੋਮ4
ਸਿਰਲੇਖ: ਮਨੁੱਖੀ ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਪੂਰਾ ਕ੍ਰਮ
ਦੋਈ:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
ਪੋਸਟ ਕੀਤਾ ਗਿਆ ਸਮਾਂ: ਮਈ 27, 2021
ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ: ਨੈਸ਼ਨਲ ਇੰਸਟੀਚਿਊਟ ਆਫ਼ ਹੈਲਥ (ਐਨਆਈਐਚ), ਯੂਐਸਏ
ਸਮੱਗਰੀ: ਸੈੱਲ ਲਾਈਨ CHM13
ਲੜੀਬੱਧ ਰਣਨੀਤੀ ਅਤੇ ਡੇਟਾ:
30× PacBio ਸਰਕੂਲਰ ਸਹਿਮਤੀ ਕ੍ਰਮ (HiFi), 120× ਆਕਸਫੋਰਡ ਨੈਨੋਪੋਰ ਅਲਟਰਾ-ਲੌਂਗ ਰੀਡ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ, 100× ਇਲੂਮਿਨਾ ਪੀਸੀਆਰ-ਫ੍ਰੀ ਸੀਕੁਏਂਸਿੰਗ (ILMN), 70× ਇਲੂਮਿਨਾ / ਅਰਿਮਾ ਜੀਨੋਮਿਕਸ ਹਾਈ-ਸੀ (ਹਾਈ-ਐਨ, ਮੈਪ), ਅਤੇ Strand-seq
ਸਾਰਣੀ 2 GRCh38 ਅਤੇ T2T-CHM13 ਮਨੁੱਖੀ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀਆਂ ਦੀ ਤੁਲਨਾ
ਹਵਾਲਾ
1. ਸਰਗੇਈ ਨੂਰਕ ਐਟ ਅਲ.ਮਨੁੱਖੀ ਜੀਨੋਮ ਦਾ ਪੂਰਾ ਕ੍ਰਮ।bioRxiv 2021.05.26.445798;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2. ਕੈਰੋਲਿਨ ਬੇਲਸਰ ਐਟ ਅਲ.ਨੈਨੋਪੋਰ ਕ੍ਰਮ ਦੀ ਵਰਤੋਂ ਕਰਦੇ ਹੋਏ ਕੇਲੇ ਦੇ ਟੈਲੋਮੇਰ-ਟੂ-ਟੇਲੋਮੇਰ ਗੈਪਲੈੱਸ ਕ੍ਰੋਮੋਸੋਮ।bioRxiv 2021.04.16.440017;doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al.ਫੈਓਡੈਕਟਿਲਮ ਟ੍ਰਾਈਕੋਰਨਟਮ ਦੀ ਟੈਲੋਮੇਰ-ਟੂ-ਟੇਲੋਮੇਰ ਜੀਨੋਮ ਅਸੈਂਬਲੀ।bioRxiv 2021.05.04.442596;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4. ਜੀਆ-ਮਿੰਗ ਗੀਤ ਆਦਿ।ਜ਼ਿਆਨ/ਇੰਡਿਕਾ ਰਾਈਸ ਲਈ ਦੋ ਗੈਪ-ਮੁਕਤ ਸੰਦਰਭ ਜੀਨੋਮਜ਼ ਦੀ ਅਸੈਂਬਲੀ ਅਤੇ ਪ੍ਰਮਾਣਿਕਤਾ ਪਲਾਂਟ ਸੈਂਟਰੋਮੀਅਰ ਆਰਕੀਟੈਕਚਰ ਦੀ ਜਾਣਕਾਰੀ ਨੂੰ ਪ੍ਰਗਟ ਕਰਦੀ ਹੈ।bioRxiv 2020.12.24.424073;doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
ਪੋਸਟ ਟਾਈਮ: ਜਨਵਰੀ-06-2022