T2T జీనోమ్ అసెంబ్లీ, గ్యాప్ ఫ్రీ జీనోమ్
1stరెండు రైస్ జీనోమ్స్1
శీర్షిక: జియాన్/ఇండికా రైస్ కోసం రెండు గ్యాప్-ఫ్రీ రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌ల అసెంబ్లీ మరియు ధ్రువీకరణ ప్లాంట్ సెంట్రోమీర్ ఆర్కిటెక్చర్‌లో అంతర్దృష్టులను వెల్లడిస్తుంది.
డోయి:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
పోస్ట్ చేసిన సమయం: జనవరి 01, 2021.
ఇన్స్టిట్యూట్: హువాజోంగ్ అగ్రికల్చరల్ యూనివర్సిటీ, చైనా
మెటీరియల్స్
O. సాటివా జియాన్/ఇండికావరి రకాలు 'జెన్‌షాన్ 97 (ZS97)' మరియు 'Minghui 63 (MH63)
సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం
NGS రీడ్‌లు + హైఫై రీడ్‌లు + CLR రీడ్‌లు + బయోనానో + హై-సి
సమాచారం:
ZS97: 8.34 Gb（~23x）HiFi రీడ్‌లు + 48.39 Gb (~131x ) CLR రీడ్‌లు + 25 Gb(~69x) NGS + 2 బయోనానో ఐరిస్ సెల్‌లు
MH63: 37.88 Gb (~103x) HiFi రీడ్‌లు + 48.97 Gb (~132x) CLR రీడ్‌లు + 28 Gb(~76x) NGS + 2 బయోనానో ఐరిస్ సెల్‌లు
మూర్తి 1 బియ్యం యొక్క రెండు గ్యాప్-ఫ్రీ జన్యువులు (MH63 మరియు ZS97)
2ndఅరటి జీనోమ్2
శీర్షిక: నానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్‌ని ఉపయోగించి అరటిపండు యొక్క టెలోమీర్-టు-టెలోమీర్ గ్యాప్‌లెస్ క్రోమోజోమ్‌లు
డోయి:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
పోస్ట్ చేసిన సమయం: ఏప్రిల్ 17, 2021.
ఇన్స్టిట్యూట్: యూనివర్శిటీ పారిస్-సాక్లే, ఫ్రాన్స్
మెటీరియల్స్
డబుల్ హాప్లోయిడ్మూసా అక్యుమినాటాsppమలాక్సెన్సిస్(DH-పహాంగ్)
సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం మరియు డేటా:
HiSeq2500 PE250 మోడ్ + MinION/ PromethION (93Gb,~200X )+ ఆప్టికల్ మ్యాప్ (DLE-1+BspQ1)
టేబుల్ 1 మూసా అక్యుమినాటా (DH-పహాంగ్) జన్యు సమ్మేళనాల పోలిక
మూర్తి 2 మూసా జన్యువుల నిర్మాణ పోలిక
3rdఫియోడాక్టిలమ్ ట్రైకార్నటమ్ జీనోమ్3
శీర్షిక: టెలోమీర్-టు-టెలోమీర్ జీనోమ్ అసెంబ్లీ ఆఫ్P
హెయోడాక్టిలమ్ ట్రైకార్నటమ్
డోయి:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
పోస్ట్ చేసిన సమయం: మే 04, 2021
ఇన్స్టిట్యూట్: వెస్ట్రన్ యూనివర్సిటీ, కెనడా
మెటీరియల్స్
ఫియోడాక్టిలమ్ ట్రైకార్నటమ్(ఆల్గే మరియు ప్రోటోజోవా యొక్క సంస్కృతి సేకరణ CCAP 1055/1)
సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం మరియు డేటా:
1 ఆక్స్‌ఫర్డ్ నానోపోర్ minION ఫ్లో సెల్ + 2×75 జత-ముగింపు మిడ్-అవుట్‌పుట్ NextSeq 550 రన్
టెలోమీర్-టు-టెలోమీర్ జీనోమ్ అసెంబ్లీ కోసం మూర్తి 3 వర్క్‌ఫ్లో
4thమానవ CHM13 జన్యువు4
శీర్షిక: మానవ జన్యువు యొక్క పూర్తి క్రమం
డోయి:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
పోస్ట్ చేసిన సమయం: మే 27, 2021
ఇన్స్టిట్యూట్: నేషనల్ ఇన్స్టిట్యూట్ ఆఫ్ హెల్త్ (NIH), USA
మెటీరియల్స్: సెల్ లైన్ CHM13
సీక్వెన్సింగ్ వ్యూహం మరియు డేటా:
30× ప్యాక్‌బయో సర్క్యులర్ కన్సెన్సస్ సీక్వెన్సింగ్ (HiFi) , 120× ఆక్స్‌ఫర్డ్ నానోపోర్ అల్ట్రా-లాంగ్ రీడ్ సీక్వెన్సింగ్, 100× ఇల్యూమినా PCR-ఫ్రీ సీక్వెన్సింగ్ (ILMN) , 70× ఇల్యూమినా / అరిమా జెనోమిక్స్ హై-సి (హై-నో-సి), బయోనానో మ్యాప్స్ మరియు స్ట్రాండ్-సీక్
పట్టిక 2 GRCh38 మరియు T2T-CHM13 మానవ జన్యు సమ్మేళనాల పోలిక
సూచన
1.సెర్గీ నూర్క్ మరియు ఇతరులు.మానవ జన్యువు యొక్క పూర్తి క్రమం.bioRxiv 2021.05.26.445798;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.కారోలిన్ బెల్సెర్ మరియు ఇతరులు.నానోపోర్ సీక్వెన్సింగ్‌ని ఉపయోగించి అరటిపండు యొక్క టెలోమీర్-టు-టెలోమీర్ గ్యాప్‌లెస్ క్రోమోజోమ్‌లు.bioRxiv 2021.04.16.440017;doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.డేనియల్ J. గిగురే మరియు ఇతరులు.టెలోమీర్-టు-టెలోమీర్ జీనోమ్ అసెంబ్లీ ఆఫ్ ఫియోడాక్టిలమ్ ట్రైకార్నటమ్.bioRxiv 2021.05.04.442596;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.జియా-మింగ్ సాంగ్ మరియు ఇతరులు.జియాన్/ఇండికా రైస్ కోసం రెండు గ్యాప్-ఫ్రీ రిఫరెన్స్ జీనోమ్‌ల అసెంబ్లీ మరియు ధ్రువీకరణ ప్లాంట్ సెంట్రోమీర్ ఆర్కిటెక్చర్‌లో అంతర్దృష్టులను వెల్లడిస్తుంది.bioRxiv 2020.12.24.424073;doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
పోస్ట్ సమయం: జనవరి-06-2022