د T2T جینوم اسمبلۍ، GAP وړیا جینوم
1stدوه وریجی جینومونه1
سرلیک: د Xian/indica Rice لپاره د دوو تشو څخه پاک ریفرنس جینومونو راټولول او اعتبار د نبات سینټرومیر جوړښت په اړه بصیرت څرګندوي
دوۍ:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
د خپریدو وخت: د جنوري 01، 2021.
انسټیټیوټ: هوزونګ زراعت پوهنتون، چین
مواد
O. sativa xian/indicaد وریجو ډولونه 'ژینشان 97 (ZS97)' او 'Minghui 63 (MH63)
د ترتیب کولو ستراتیژي
NGS لوستل + HiFi لوستل + CLR لوستل + BioNano + Hi-C
معلومات:
ZS97: 8.34 Gb（~23x）HiFi لوستل + 48.39 Gb (~ 131x) CLR لوستل + 25 Gb (~ 69x) NGS + 2 BioNano Irys حجرې
MH63: 37.88 Gb (~ 103x) HiFi لوستل + 48.97 Gb (~ 132x) CLR لوستل + 28 Gb (~ 76x) NGS + 2 BioNano Irys حجرې
شکل 1 د وریجو دوه له تشې څخه پاک جینومونه (MH63 او ZS97)
2ndکیلې جینوم2
سرلیک: د کیلې له ټیلومیر څخه تر ټیلومیري ګپلیس کروموزومونه د نانوپور ترتیب په کارولو سره
دوۍ:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
د خپریدو وخت: د اپریل 17، 2021.
انسټیټیوټ: پوهنتون پاریس ساکلی، فرانسه
مواد
ډبل هاپلویدموسی اکومینتاsppmalaccensis((DH- Pahang)
د ترتیب کولو ستراتیژي او ډاټا:
HiSeq2500 PE250 موډ + MinION/ PromethION (93Gb,~200X)+ نظری نقشه (DLE-1+BspQ1)
جدول 1 د موسی اکومینتا (DH-پاهنګ) جینوم غونډو پرتله کول
شکل 2 د موسی جینوم جوړښت جوړښت پرتله کول
3rdفایوډاکټیلم تریکورنتوم جینوم3
سرلیک: د ټیلومیر څخه تر ټیلومیر جینوم مجلسP
haeodactylum tricornutum
دوۍ:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
د خپریدو وخت: د می 04، 2021
انسټیټیوټ: لویدیځ پوهنتون، کاناډا
مواد
فایډاکټیلم تریکورنتوم(د الګا او پروټوزوا کلتور ټولګه CCAP 1055/1)
د ترتیب کولو ستراتیژي او ډاټا:
1 د اکسفورډ نانوپور منین فلو سیل + یو 2 × 75 جوړه - پای منځنی تولید NextSeq 550 منډې
شکل 3 د telomere-to-telomere جینوم مجلس لپاره کاري جریان
4thد انسان CHM13 جینوم4
سرلیک: د انسان جینوم بشپړ ترتیب
دوۍ:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
د خپریدو وخت: د می 27، 2021
انسټیټیوټ: د روغتیا ملي انسټیټیوټ (NIH)، متحده ایالات
توکي: د حجرو لاین CHM13
د ترتیب کولو ستراتیژي او ډاټا:
30× PacBio سرکلر توافق ترتیب (HiFi) , 120 × اکسفورډ نانوپور الټرا اوږد لوستل شوی ترتیب ، 100 × Illumina PCR - وړیا ترتیب (ILMN) ، 70 × Illumina / اریما جینومکس های-C (Hi-N ، بایوټیک نقشه) ، او Strand-seq
جدول 2 د GRCh38 او T2T-CHM13 انساني جینوم اسمبلۍ پرتله کول
حواله
1. سرګي نورک او نور.د انسان جینوم بشپړ ترتیب.bioRxiv 2021.05.26.445798;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.Caroline Belser et al.Telomere-to-telomere د کیلې د ګپلیس کروموزومونه د نانوپور ترتیب په کارولو سره.bioRxiv 2021.04.16.440017;doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3. ډینیل جې ګیګیر او نور.د ټیلومیر څخه تر ټیلومیر جینوم د فایوډاکټیلم تریکورنتوم جمع.bioRxiv 2021.05.04.442596;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4. جيا مينګ سونګ او نور.د Xian/indica Rice لپاره د دوو تشو څخه پاک ریفرنس جینومونو راټولول او تایید د نبات سینټرومیر آرکیټیکچر په اړه بصیرت څرګندوي.bioRxiv 2020.12.24.424073;doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
د پوسټ وخت: جنوري-06-2022