Маҷмаи геномҳои T2T, GENOME ОЗОД
1stДу геноми Райс1
Сарлавҳа: Ҷамъоварӣ ва тасдиқи ду геноми истинодҳои холии Сиан/индика Райс фаҳмишҳоро дар бораи меъмории центромери растанӣ ошкор мекунад
Дои:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Вақти интишор: 01 январи соли 2021.
Институт: Донишгоҳи кишоварзии Хуажун, Чин
Материалхо
O. sativa xian/indicaнавъҳои биринҷ 'Zhenshan 97 (ZS97)' ва 'Minghui 63 (MH63)
Стратегияи пайдарпай
NGS мехонад + HiFi мехонад + CLR мехонад + BioNano + Hi-C
Маълумот:
ZS97: 8,34 Гб（~23х）HiFi хондан + 48,39 Гб (~131х) CLR хондан + 25 Гб(~69х) NGS + 2 ҳуҷайраи BioNano Irys
MH63: 37,88 Гб (~103х) хондани HiFi + 48,97 Гб (~132х) CLR хондан + 28 Гб (~76х) NGS + 2 ҳуҷайраи BioNano Irys
Тасвири 1 Ду геноми холии биринҷ (MH63 ва ZS97)
2ndГеном банан2
Сарлавҳа: Хромосомаҳои холии теломер то теломераи банан бо истифода аз пайдарпайии нанопора
Дои:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
Вақти интишор: 17 апрели соли 2021.
Донишкада: Université Paris-Saclay, Фаронса
Материалхо
Гаплоиди дукаратаМусо acuminatasppмалаксенсис(DH-Паханг)
Стратегияи пайдарпайӣ ва маълумот:
Ҳолати HiSeq2500 PE250 + MinION/ PromethION (93Гб,~200X)+ Харитаи оптикӣ (DLE-1+BspQ1)
Љадвали 1 Муќоисаи маљлисњои геномии Мусо акумината (DH-Pahang).
Тасвири 2 Муқоисаи меъмории геномҳои Мусо
3rdГеном Phaeodactylum tricornutum3
Сарлавҳа: Маҷмӯи геномҳои теломер-то-теломераP
haeodactylum tricornutum
Дои:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
Вақти интишор: 04 майи соли 2021
Институт: Донишгоҳи Ғарбӣ, Канада
Материалхо
Phaeodactylum tricornutum(Маҷмӯаи фарҳанги Алгаҳо ва Protozoa CCAP 1055/1)
Стратегияи пайдарпайӣ ва маълумот:
1 ҳуҷайраи ҷараёнии Оксфорд Nanopore minION + як 2×75 ҷуфтшуда-охири миёнаи баромади NextSeq 550
Тасвири 3 Ҷараёни кор барои маҷмӯи геномҳои теломер-то-теломера
4thГеном CHM13 инсон4
Сарлавҳа: пайдарпайии пурраи геноми инсон
Дои:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
Вақти интишор: 27 майи соли 2021
Институт: Институтҳои Миллии Тандурустӣ (NIH), ИМА
Маводҳо: хати ҳуҷайраи CHM13
Стратегияи пайдарпайӣ ва маълумот:
30 × пайдарпаии консенсуси даврии PacBio (HiFi), 120 × пайдарпаии хониши ултра-дарози Оксфорд Nanopore, 100 × пайдарпаии Illumina-PCR-Free (ILMN), 70 × Illumina / Arima Genomics Hi-C (Hi-C), харитаҳои оптикӣ, BioNano, ва Strand-seq
Ҷадвали 2 Муқоисаи GRCh38 ва T2T-CHM13 ассамблеяҳои геноми инсон
Истинод
1.Сергей Нурк ва дигарон.пайдарпайии пурраи геноми инсон.bioRxiv 2021.05.26.445798;дой:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.Каролин Белсер ва дигарон.Хромосомаҳои холии теломер то теломераи банан бо истифода аз пайдарпайии нанопур.bioRxiv 2021.04.16.440017;дой:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Даниэл Ҷ. Гигер ва дигарон.Маҷмӯи геномҳои теломера-то-теломера аз Phaeodactylum tricornutum.bioRxiv 2021.05.04.442596;дой:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.Jia-Ming Song ва дигарон.Маҷмӯа ва тасдиқи ду геноми истинодҳои бидуни холигоҳ барои Сиан/индика Райс фаҳмишҳоро дар бораи меъмории центромери растанӣ ошкор мекунад.bioRxiv 2020.12.24.424073;дой:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Вақти фиристодан: январ-06-2022