T2T ஜீனோம் அசெம்பிளி, கேப் ஃப்ரீ ஜீனோம்
1stஇரண்டு அரிசி மரபணுக்கள்1
தலைப்பு: ஜியான்/இண்டிகா அரிசிக்கான இரண்டு இடைவெளி இல்லாத குறிப்பு ஜீனோம்களின் அசெம்பிளி மற்றும் சரிபார்ப்பு தாவர சென்ட்ரோமியர் கட்டிடக்கலை பற்றிய நுண்ணறிவை வெளிப்படுத்துகிறது
டோய்:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
இடுகையிடப்பட்ட நேரம்: ஜனவரி 01, 2021.
நிறுவனம்: Huazhong விவசாய பல்கலைக்கழகம், சீனா
பொருட்கள்
ஓ. சாடிவா சியான்/இண்டிகாஅரிசி வகைகள் 'ஜென்ஷன் 97 (ZS97)' மற்றும் 'மிங்குய் 63 (MH63)
வரிசைப்படுத்தும் உத்தி
NGS படிக்கிறது + HiFi படிக்கிறது + CLR படிக்கிறது + BioNano + Hi-C
தகவல்கள்:
ZS97: 8.34 Gb（~23x）HiFi வாசிப்புகள் + 48.39 Gb (~131x ) CLR படிக்கிறது + 25 Gb(~69x) NGS + 2 BioNano Irys செல்கள்
MH63: 37.88 Gb (~103x) HiFi ரீட்ஸ் + 48.97 Gb (~132x) CLR படிக்கிறது + 28 Gb(~76x) NGS + 2 BioNano Irys செல்கள்
படம் 1 அரிசியின் இரண்டு இடைவெளி இல்லாத மரபணுக்கள் (MH63 மற்றும் ZS97)
2ndவாழை மரபணு2
தலைப்பு: நானோபோர் வரிசைமுறையைப் பயன்படுத்தி வாழைப்பழத்தின் டெலோமியர்-டு-டெலோமியர் இடைவெளியற்ற குரோமோசோம்கள்
டோய்:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
இடுகையிடப்பட்ட நேரம்: ஏப்ரல் 17, 2021.
நிறுவனம்: பாரிஸ்-சாக்லே பல்கலைக்கழகம், பிரான்ஸ்
பொருட்கள்
இரட்டை ஹாப்ளாய்டுமூசா அக்குமினாட்டாsppமாலாசென்சிஸ்(DH-பஹாங்)
வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி மற்றும் தரவு:
HiSeq2500 PE250 பயன்முறை + MinION/ PromethION (93Gb,~200X )+ ஆப்டிகல் வரைபடம் (DLE-1+BspQ1)
அட்டவணை 1 மூசா அகுமினாட்டா (DH-பஹாங்) மரபணு கூட்டங்களின் ஒப்பீடு
படம் 2 மூசா மரபணுக்களின் கட்டிடக்கலை ஒப்பீடு
3rdஃபியோடாக்டைலம் ட்ரைகார்னூட்டம் மரபணு3
தலைப்பு: டெலோமியர்-டு-டெலோமியர் மரபணு அமைப்புP
ஹீயோடாக்டைலம் முக்கோணம்
டோய்:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
இடுகையிடப்பட்ட நேரம்: மே 04, 2021
நிறுவனம்: மேற்கத்திய பல்கலைக்கழகம், கனடா
பொருட்கள்
ஃபியோடாக்டைலம் ட்ரைகார்னூட்டம்(பாசி மற்றும் புரோட்டோசோவாவின் கலாச்சார சேகரிப்பு CCAP 1055/1)
வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி மற்றும் தரவு:
1 Oxford Nanopore minION ஃப்ளோ செல் + ஒரு 2×75 ஜோடி-இறுதி நடு-வெளியீடு NextSeq 550 ரன்
படம் 3 டெலோமியர்-டு-டெலோமியர் ஜீனோம் அசெம்பிளிக்கான பணிப்பாய்வு
4thமனித CHM13 மரபணு4
தலைப்பு: மனித மரபணுவின் முழுமையான வரிசை
டோய்:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
இடுகையிடப்பட்ட நேரம்: மே 27, 2021
நிறுவனம்: தேசிய சுகாதார நிறுவனங்கள் (NIH), அமெரிக்கா
பொருட்கள்: செல் லைன் CHM13
வரிசைப்படுத்துதல் உத்தி மற்றும் தரவு:
30× PacBio சர்குலர் ஒருமித்த வரிசைமுறை (HiFi) , 120× ஆக்ஸ்போர்டு நானோபூர் அல்ட்ரா-லாங் ரீட் சீக்வென்சிங் , 100× இல்லுமினா PCR-ஃப்ரீ சீக்வென்சிங் (ILMN) , 70× இல்லுமினா / அரிமா ஜெனோமிக்ஸ் ஹை-சி (Hi-Nano சி), பயோனோனோ சி வரைபடங்கள் மற்றும் Strand-seq
அட்டவணை 2 GRCh38 மற்றும் T2T-CHM13 மனித மரபணுக் கூட்டங்களின் ஒப்பீடு
குறிப்பு
1.செர்ஜி நூர்க் மற்றும் பலர்.மனித மரபணுவின் முழுமையான வரிசை.bioRxiv 2021.05.26.445798;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.கரோலின் பெல்சர் மற்றும் பலர்.நானோபோர் வரிசைமுறையைப் பயன்படுத்தி வாழைப்பழத்தின் டெலோமியர்-டு-டெலோமியர் இடைவெளியற்ற குரோமோசோம்கள்.bioRxiv 2021.04.16.440017;doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.டேனியல் ஜே. கிகுரே மற்றும் பலர்.ஃபியோடாக்டைலம் ட்ரைகார்னூட்டத்தின் டெலோமியர்-டு-டெலோமியர் ஜீனோம் அசெம்பிளி.bioRxiv 2021.05.04.442596;doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.ஜியா-மிங் சாங் மற்றும் பலர்.ஜியான்/இண்டிகா அரிசிக்கான இரண்டு இடைவெளி இல்லாத குறிப்பு ஜீனோம்களின் அசெம்பிளி மற்றும் சரிபார்ப்பு தாவர சென்ட்ரோமியர் கட்டிடக்கலை பற்றிய நுண்ணறிவுகளை வெளிப்படுத்துகிறது.bioRxiv 2020.12.24.424073;doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
இடுகை நேரம்: ஜன-06-2022