T2T ГЕНОМЫН АССАМБЛЕ, ЗӨВРӨГҮЙ ГЕНОМ
1stЦагаан будааны хоёр геном1
Гарчиг: Xian/indica Rice-д зориулсан хоёр цоорхойгүй лавлагаа геномын угсралт ба баталгаажуулалт нь ургамлын центромерын архитектурын талаарх ойлголтыг илчилсэн.
Дои:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Нийтэлсэн цаг: 2021 оны 1-р сарын 01.
Хүрээлэн: Хуажун хөдөө аж ахуйн их сургууль, Хятад
Материал
O. sativa xian/indica"Жэньшань 97 (ZS97)" ба "Минхуй 63 (MH63)" будааны сортууд
Дараалсан стратеги
NGS унших + HiFi унших + CLR унших + BioNano + Hi-C
Өгөгдөл:
ZS97: 8.34 Гб（~23x）HiFi унших + 48.39 Гб (~131x) CLR унших + 25 Гб(~69x) NGS + 2 BioNano Irys эс
MH63: 37.88 Гб (~103x) HiFi унших + 48.97 Гб (~132x) CLR унших + 28 Гб(~76x) NGS + 2 BioNano Irys эс
Зураг 1 Цагаан будааны ялгаагүй хоёр геном (MH63 ба ZS97)
2ndБананы геном2
Гарчиг: Нанопорын дараалал ашиглан гадил жимсний теломерээс теломер хүртэлх цоорхойгүй хромосомууд
Дои:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
Нийтэлсэн цаг: 2021 оны 4-р сарын 17.
Хүрээлэн: Парис-Саклайгийн их сургууль, Франц
Материал
Давхар гаплоидMusa acuminatasppmalaccensis(DH-Pahang)
Дараалсан стратеги ба өгөгдөл:
HiSeq2500 PE250 горим + MinION/ PromethION (93Gb,~200X )+ Оптик зураг (DLE-1+BspQ1)
Хүснэгт 1 Musa acuminata (DH-Pahang) геномын угсралтын харьцуулалт
Зураг 2 Муза геномын архитектурын харьцуулалт
3rdPhaeodactylum tricornutum геном3
Гарчиг: Теломерээс теломер хүртэлх геномын нэгдэлP
haeodactylum tricornutum
Дои:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
Нийтэлсэн цаг: 2021 оны 5-р сарын 04
Хүрээлэн: Барууны их сургууль, Канад
Материал
Phaeodactylum tricornutum(Замаг ба эгэл биетний соёлын цуглуулга CCAP 1055/1)
Дараалсан стратеги ба өгөгдөл:
1 Оксфордын Nanopore minION урсгалын эс + 2×75 хосолсон төгсгөлийн NextSeq 550 гүйлт
Зураг 3 Теломераас теломер хүртэлх геномын угсралтын ажлын урсгал
4thХүний CHM13 геном4
Гарчиг: Хүний геномын бүрэн дараалал
Дои:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
Нийтэлсэн цаг: 2021 оны 5-р сарын 27
Хүрээлэн: Эрүүл мэндийн үндэсний хүрээлэн (NIH), АНУ
Материал: эсийн шугам CHM13
Дараалсан стратеги ба өгөгдөл:
30 × PacBio дугуй зөвшилцлийн дараалал (HiFi), 120 × Оксфордын Нанопор хэт урт унших дараалал, 100 × Illumina ПГУ-гүй дараалал (ILMN), 70 × Illumina / Arima Genomics Hi-C (Hi-C), BioNano, болон Strand-seq
Хүснэгт 2 Хүний геномын GRCh38 ба T2T-CHM13-ийн харьцуулалт
Лавлагаа
1.Сергей Нурк нар.Хүний геномын бүрэн дараалал.bioRxiv 2021.05.26.445798;дои:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.Каролин Белсер нар.Нанопорын дараалал ашиглан гадил жимсний теломерээс теломер хүртэлх цоорхойгүй хромосомууд.bioRxiv 2021.04.16.440017;дои:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al.Phaeodactylum tricornutum-ийн теломер-теломер геномын нэгдэл.bioRxiv 2021.05.04.442596;дои:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.Жя-Мин Сүн нар.Xian/indica Rice-д зориулсан хоёр цоорхойгүй лавлагаа геномын угсралт ба баталгаажуулалт нь ургамлын центромерын архитектурын талаархи ойлголтыг харуулж байна.bioRxiv 2020.12.24.424073;дои:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Шуудангийн цаг: 2022-01-06