条形banner-03

פּראָדוקטן

16S/18S/ITS אַמפּליקאָן סיקווענסינג-פּאַקביאָ

די 16S און 18S rRNA גענעס, צוזאמען מיט די אינטערנאַל טראַנסקריבעד ספּייסער (ITS) ראַיאָן, דינען ווי וויכטיקע מאָלעקולאַרע פינגערפּרינטינג מאַרקערס צוליב זייער קאָמבינאַציע פון ​​העכסט קאָנסערווירטע און היפּער-וועריאַבאַל ראַיאָנען, מאַכנדיג זיי אומשאַצבארע מכשירים פֿאַר כאַראַקטעריזירן פּראָקאַריאָטישע און עוקאַריאָטישע אָרגאַניזמען. אַמפּליפיקאַציע און סיקווענסינג פון די ראַיאָנען פאָרשלאָגן אַן איזאָלאַציע-פֿרייע צוגאַנג פֿאַר אויספֿאָרשן די מיקראָביאַלע זאַץ און דייווערסיטי אַריבער פֿאַרשידענע עקאָסיסטעמען. כאָטש Illumina סיקווענסינג טיפּיקלי צילט קורצע היפּערוועריאַבאַל ראַיאָנען ווי V3-V4 פון 16S און ITS1, איז עס דעמאַנסטרירט געוואָרן אַז העכערע טאַקסאָנאָמישע אַנאָטאַציע איז דערגרייכלעך דורך סיקווענסינג די פולע לענג פון 16S, 18S, און ITS. דעם קאָמפּרעהענסיוו צוגאַנג רעזולטאַטן אין העכערע פּראָצענטן פון אַקיעראַטלי קלאַסיפֿיצירטע סיקווענסעס, דערגרייכנדיג אַ מדרגה פון רעזאָלוציע וואָס עקסטענדעד צו מינים אידענטיפיקאַציע. PacBio'ס סינגל-מאָלעקול רעאַל-טיים (SMRT) סיקווענסינג פּלאַטפאָרמע שטייט אויס דורך צושטעלן העכסט אַקיעראַטלי לאַנג רידס (HiFi) וואָס דעקן די פול-לענג אַמפּליקאָנס, קאָנקורירנדיג די פּינקטלעכקייט פון Illumina סיקווענסינג. די מעגלעכקייט ערלויבט פארשער צו דערגרייכן אן אומגעגלייכטן אויבערהאנט — א פאנאראמישן בליק אויף דער גענעטישער לאנדשאפט. די פארברייטערטע באדעקונג פארהויכט באדייטנד די רעזאלוציע אין מינים אנאטאציע, ספעציעל אין באַקטיריעלע אדער פונגאַל קהילות, און ערמעגליכט א טיפערן פארשטאנד פון די קאמפליצירטקייטן פון מיקראָביעלע פאפולאציעס.


סערוויס דעטאלן

ביאָאינפאָרמאַטיק

דעמאָ רעזולטאַטן

אויסגעצייכנטע אויסגאבעס

סערוויס פֿעיִטשערז

● סיקווענסינג פּלאַטפאָרמע: PacBio Revio

● סיקווענסינג מאָדע: CCS (HiFi לייענט)

● פֿאַרשטאַרקונג פֿון ציל־געגנט, נאכגעפֿאָלגט דורך טאַנדעם־פֿאַרבינדונג פֿון אַמפּליקאָנס איידער דער צוגרייטונג פֿון דער HiFi SMRT גלאָק־ביבליאָטעק

סערוויס מעלות

העכערע טאַקסאָנאָמישע רעזאָלוציע: טהאַן קורץ-אַמפּליקאָן סיקווענסינג,ערמעגליכן העכערע OTU קלאַסיפֿיקאַציע ראַטעס אויף דער מינים מדרגה.

העכסט גענויע באַזע רופןפּאַקביאָ CCS מאָדע סיקווענסינג (HiFi לייענט).

אפגעזונדערטקייט-פֿרײַשנעלע אידענטיפיקאציע פון ​​מיקראָביעלער צוזאמענשטעלונג אין סביבה'דיקע מוסטערן.

ברייט אָנווענדלעךפארשידענע מיקראביאלע קהילה שטודיעס.

קאָמפּרעהענסיוו ביאָינפאָרמאַטיש אַנאַליזדי לעצטע QIIME2 פּעקל (קוואַנטיטאַטיווע איינבליק אין מיקראָביאַלער עקאָלאָגיע) מיט פֿאַרשיידענע אַנאַליזן אין טערמינען פון דאַטאַבייס, אַנאָטאַציע, OTU/ASV.

ברייטע עקספּערטיזמיט טויזנטער אַמפּליקאָן סיקווענסינג פּראָיעקטן וואָס ווערן דורכגעפירט יערלעך, ברענגט BMKGENE איבער אַ יאָרצענדלינג דערפאַרונג, אַ העכסט באָקע אַנאַליז מאַנשאַפֿט, פולשטענדיק אינהאַלט, און ויסגעצייכנטע נאָך-פאַרקויף שטיצע.

סערוויס ספּעציפֿיקאַציעס

ביבליאָטעק

סיקווענסינג סטראַטעגיע

דאַטן רעקאָמענדירט

אַמפּליקאָן

פּאַקביאָ רעוויאָ

10/30/50 טויזנט טאַגן (CCS)

מוסטער רעקווייערמענץ

קאָנצענטראַציע (נג/µל)

גאַנץ סומע (µg)

באַנד (µL)

≥5

≥0.3

≥20

רעקאָמענדירטע מוסטער ליפערונג

איינפֿרירן די מוסטערן אין פֿליסיקן שטיקשטאָף פֿאַר 3-4 שעה און האַלטן אין פֿליסיקן שטיקשטאָף אָדער -80 גראַד פֿאַר לאַנג-טערמין רעזערוואַציע. מוסטער שיפּינג מיט טרוקן-אייז איז פארלאנגט.

סערוויס ארבעט פלוס

מוסטער ליפערונג

מוסטער ליפערונג

ביבליאָטעק צוגרייטונג

ביבליאָטעק קאַנסטרוקציע

סיקווענסינג

סיקווענסינג

דאַטן אַנאַליז

דאַטן אַנאַליז

נאך-פארקויף סערוויסעס

נאך-פארקויף סערוויסעס


  • פריערדיג:
  • ווייטער:

  • 流程图第三版2-02

    כולל די פאלגענדע אנאליז:

    ● קאָנטראָל פון רוי דאַטן קוואַליטעט

    ●OTU קלאַסטערינג/דע-נויז (ASV)

    ●OTU אנאטאציע

    ●אַלפֿאַ דייווערסיטי אַנאַליז: קייפל אינדעקסן, אַרייַנגערעכנט שאַנאָן, סימפּסאָן און ACE.

    ●בעטאַ דייווערסיטי אַנאַליז

    ● אינטערגרופע אנאליז

    ● קארעלאציע אנאליז: צווישן סביבה'דיגע פאקטארן און OUT קאמפאזיציע און דייווערסיטי

    ●16S פונקציאָנעלע גענע פאָרויסזאָגן

     

    היסטאָגראַם פון טאַקסאָנאָמישער פאַרשפּרייטונג

    图片57

    פילאָגענעטישער בוים פון דער קהילה-פאַרשפּרייטונג

    图片58

    אַלפֿאַ דייווערסיטי אַנאַליז: ACE

    אינדעקס图片59

     

    ביתא דייווערסיטי אנאליז: PCoA

    图片60

     

    אינטערגרופע אנאליז: ANOVA

    图片61

     

     

     

    אויספאָרשן די פֿאָרשריטן וואָס זענען געוואָרן ערמעגליכט דורך BMKGene'ס אַמפּליקאָן סיקוואַנסינג באַדינונגען מיט PacBio דורך אַ קוראַטירטע זאַמלונג פון פּובליקאַציעס.

    גאַאָ, קס. און וואַנג, ה. (2023) 'פאַרגלייַכנדיקע אַנאַליז פון רומען באַקטעריעלע פּראָופיילז און פונקציעס בעת אַדאַפּטאַציע צו פאַרשידענע פענאָלאָגיע (רעגרין קעגן גראָזי) אין אַלפּיין מערינאָ שעפּס מיט צוויי גראָוינג סטאַגעס אויף אַן אַלפּיין וויזן', פערמענטאַציע, 9(1), ז. 16. doi: 10.3390/FERMENTATION9010016/S1.

    לי, ס. און אנדערע (2023) 'כאפּן די מיקראָביאַלע טונקעלע מאַטעריע אין מדבר באָדנס ניצנדיק קולטוראָמיקס-באַזירטע מעטאַגענאָמיקס און הויך-רעזאָלוציע אַנאַליז', npj ביאָפילמס און מיקראָביאָמעס 2023 9:1, 9(1), זז. 1–14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.

    מו, ל. און אנדערע (2022) 'די ווירקונג פון פעטי זויער זאלץ אויף פערמענטאציע אייגנשאפטן, באַקטיריעלע דייווערסיטי און אַעראָביק פעסטקייט פון געמישט סילאַזש צוגעגרייט מיט אַלפאַלפאַ, רייז שטרוי און ווייץ קלייען', זשורנאַל פון די וויסנשאַפֿט פון עסן און אַגריקולטור, 102(4), זז. 1475–1487. doi: 10.1002/JSFA.11482.

    יאַנג, דזש. עט אַל. (2023) 'די אינטעראַקציע צווישן אָקסידאַטיווע סטרעס ביאָמאַרקערס און געדערעם מיקראָביאָטאַ אין די אַנטיאַקסאַדאַנט יפעקס פון עקסטראַקטן פון סאָנטשוס בראַקיאָטוס די סי. אין אָקסאַזאָלאָן-ינדוסט אינטעסטינאַלע אָקסידאַטיווע סטרעס אין דערוואַקסענע זעבראַפיש', אַנטיאַקסאַדאַנץ 2023, באַנד 12, בלאַט 192, 12(1), ז. 192. doi: 10.3390/ANTIOX12010192.

    באַקומען אַ ציטאַט

    שרייב דיין מעסעדזש דא און שיקט עס צו אונז

    שיקט אייער מעסעדזש צו אונדז: