-
גענאָמע-ברייט אַססאָסיאַטיאָן אַנאַליסיס
גענאָמע-ברייט פאַרבאַנד לערנען (GWAS) יימז צו ידענטיפיצירן גענעטיק וועריאַנץ (גענאָטיפּע) וואָס איז פארבונדן מיט ספּעציפיש טרייץ (פענאָטיפּע).GWAS לערנען ינוועסטאַגייץ גענעטיק מאַרקערס קרייַז גאַנץ גענאָמע פון גרויס נומער פון מענטשן און פּרידיקס גענאָטיפּע-פענאָטיפּע אַסאָוסייישאַנז דורך סטאַטיסטיש אַנאַליסיס אויף באַפעלקערונג מדרגה.עס איז וויידלי געווענדט אין פאָרשונג אויף מענטש חולאתן און פאַנגקשאַנאַל דזשין מיינינג אויף קאָמפּלעקס טרייץ פון אַנימאַלס אָדער געוויקסן.
-
איין-קערן רנאַ סיקוואַנסינג
די שטייַגן אין איין צעל קאַפּטשערינג און יחיד ביבליאָטעק קאַנסטראַקשאַן טעכניק קאַמביינינג מיט הויך-טרופּוט סיקוואַנסינג אַלאַוז דזשין אויסדרוק שטודיום אויף צעל-ביי-צעל יקער.עס ינייבאַלז אַ דיפּער און פולשטענדיק סיסטעם אַנאַליסיס אויף קאָמפּלעקס צעל פּאַפּיאַליישאַנז, אין וואָס עס לאַרגעלי אַוווידז מאַסקינג פון זייער העטעראַדזשיניאַטי דורך די דורכשניטלעך פון אַלע סעלז.
אָבער, עטלעכע סעלז זענען נישט פּאַסיק צו זיין געמאכט אין איין-צעל סאַספּענשאַן, אַזוי אנדערע מוסטער צוגרייטונג מעטהאָדס - קערן יקסטראַקשאַן פון געוועבן זענען דארף, דאָס הייסט, קערן איז גלייַך יקסטראַקטיד פון געוועבן אָדער צעל און צוגעגרייט אין איין-קערן סאַספּענשאַן פֿאַר איין-קערן. צעל סיקוואַנסינג.
BMK גיט 10 × Genomics Chromium TM באזירט איין-צעל רנאַ סיקוואַנסינג דינסט.דער דינסט איז וויידלי געניצט אין שטודיום אויף קרענק פֿאַרבונדענע שטודיום, אַזאַ ווי ימיון צעל דיפערענשייישאַן, אָנוווקס העטעראָגענעאַטי, געוועב אַנטוויקלונג, עטק.
ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע שפּאָן: 10 × גענאָמיקס
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq Platform
-
פּלאַנט / כייַע גאַנץ גענאָמע סיקוואַנסינג
גאַנץ גענאָמע שייַעך-סיקוואַנסינג, אויך באקאנט ווי WGS, ינייבאַלז די ריווילינג פון ביידע פּראָסט און זעלטן מיוטיישאַנז אויף די גאנצע גענאָמע אַרייַנגערעכנט סינגלע נוקלעאָטידע פּאָלימאָרפיסם (SNP), ינסערשאַן דילישאַן (InDel), סטרוקטור ווערייישאַן (SV), און קאָפּיע נומער ווערייישאַן (CNV) ).SVs מאַכן אַ גרעסערע טייל פון די ווערייישאַן באַזע ווי SNPs און האָבן אַ גרעסערע פּראַל אויף די גענאָמע, וואָס האט אַ באַטייטיק ווירקונג אויף לעבעדיק אָרגאַניזאַמז.לאנג-לייענען ריסעקווענסינג אַלאַוז מער גענוי לעגיטימאַציע פון גרויס פראַגמאַנץ און קאָמפּליצירט ווערייישאַנז ווייַל לאַנג לייענען מאַכן עס פיל גרינגער צו כראָמאָסאָמאַל אַריבער קאָמפּליצירט מקומות אַזאַ ווי טאַנדאַם ריפּיץ, GC / AT-רייַך מקומות און כייפּער-ווייאַבאַל מקומות.
פּלאַטפאָרמע: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע
ספּיישאַל אָרגאַניזאַציע פון סעלז פיעסעס וויטאַל ראָלע אין פאַרשידן בייאַלאַדזשיקאַל פּראַסעסאַז, אַזאַ ווי ימיון ינפילטריישאַן, עמבריאָ אַנטוויקלונג, אאז"ו ו. ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג, וואָס ינדיקייץ דזשין אויסדרוק פּראָפילינג בשעת ריטיינינג אינפֿאָרמאַציע פון ספּיישאַל שטעלע, האט צושטעלן גרויס ינסייץ אין טראַנסקריפּטאָם-מדרגה געוועב אַרקאַטעקטשער.מיט דער אַנטוויקלונג פון טעכנאָלאָגיע, די הינטער-קלאָר געוועב מאָרפאָלאָגי און די פאַקטיש סטראַקטשעראַל חילוק פון ספּיישאַל מאָלעקולאַר אויסדרוק דאַרפֿן צו זיין געלערנט מיט העכער האַכלאָטע.BMKGENE גיט פולשטענדיק, איין-האַלטן ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג דינסט פון סאַמפּאַלז צו בייאַלאַדזשיקאַל ינסייץ.
ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמיקס טעקנאַלאַדזשיז ימפּאַוערד ראָמאַן פּערספּעקטיווז אין דייווערס פאָרשונג ארענע דורך ריזאַלווינג דזשין אויסדרוק פּראָפיל מיט ספּיישאַל אינהאַלט אין כעטעראַדזשאַנאַס סאַמפּאַלז.
ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע שפּאָן: BMKMANU S1000
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע
Visium Spatial Gene Expression איז אַ מיינסטרים ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג טעכנאָלאָגיע פֿאַר קלאַסאַפייינג געוועב באזירט אויף גאַנץ מרנאַ.מאַפּע די גאנצע טראַנסקריפּטאָמע מיט מאָרפאַלאַדזשיקאַל קאָנטעקסט צו אַנטדעקן ראָמאַן ינסייץ אין נאָרמאַל אַנטוויקלונג, קרענק פּאַטאַלאַדזשי און קליניש טראַנסלאַטיאָן פאָרשונג.BMKGENE גיט פולשטענדיק, איין-האַלטן ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג דינסט פון סאַמפּאַלז צו בייאַלאַדזשיקאַל ינסייץ.
ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמיקס טעקנאַלאַדזשיז ימפּאַוערד ראָמאַן פּערספּעקטיווז אין דייווערס פאָרשונג ארענע דורך ריזאַלווינג דזשין אויסדרוק פּראָפיל מיט ספּיישאַל אינהאַלט אין כעטעראַדזשאַנאַס סאַמפּאַלז.
ספּיישאַל טראַנסקריפּטאָמע שפּאָן: 10x Genomics Visium
פּלאַטפאָרמע:Illumina NovaSeq פּלאַטפאָרמע
-
גאַנץ-לענג מרנאַ סיקוואַנסינג-נאַנאָפּאָרע
רנאַ סיקוואַנסינג איז געווען אַן ינוואַליאַבאַל געצייַג פֿאַר פולשטענדיק טראַנסקריפּטאָמע אַנאַליסיס.סאָפעק, טראדיציאנעלן קורץ-לייענען סיקוואַנסינג אַטשיווד פילע וויכטיק אַנטוויקלונג אין דאָ.פונדעסטוועגן, עס אָפט ינקאַונטערז לימיטיישאַנז אין פול-לענג יסאָפאָרם לעגיטימאַציע, קוואַנטאַפאַקיישאַן, פּקר פאָרורטייל.
נאַנאָפּאָרע סיקוואַנסינג דיסטינגגווישיז זיך פון אנדערע סיקוואַנסינג פּלאַטפאָרמס, אין אַז די נוקלעאָטידעס זענען לייענען גלייַך אָן דנאַ סינטעז און דזשענערייץ לאַנג לייענען אין טענס פון קילאָבאַסעס.דאָס ימפּאַוערז דירעקט לייענען-אויס אַריבער פול-לענג טראַנסקריפּץ און טאַקלינג די טשאַלאַנדזשיז אין יסאָפאָרם-מדרגה שטודיום.
פּלאַטפאָרמע:נאַנאָפּאָרע פּראָמעטיאָן
ביבליאָטעק:cDNA-PCR
-
גאַנץ-לענג מרנאַ סיקוואַנסינג -PacBio
De novoפול-לענג טראַנסקריפּטאָמע סיקוואַנסינג, אויך באקאנט וויDe novoIso-Seq נעמט די אַדוואַנטידזשיז פון PacBio סעקווענסער אין לייענען לענג, וואָס ינייבאַלז סיקוואַנסינג פון פול-לענג cDNA מאַלאַקיולז אָן קיין ברייקס.דאָס גאָר אַוווידז קיין ערראָרס דזשענערייטאַד אין טראַנסקריפּט פֿאַרזאַמלונג סטעפּס און קאַנסטראַקט ונידזשינע סעץ מיט יסאָפאָרם-מדרגה האַכלאָטע.די ונידזשינע שטעלט גיט שטאַרק גענעטיק אינפֿאָרמאַציע ווי "רעפֿערענץ גענאָמע" אויף טראַנסקריפּטאָמע-מדרגה.אין אַדישאַן, קאַמביינינג מיט ווייַטער דור סיקוואַנסינג דאַטן, דעם דינסט ימפּאַוערז אַ פּינטלעך קוואַנטאַפאַקיישאַן פון יסאָפאָרם-מדרגה אויסדרוק.
פּלאַטפאָרמע: PacBio Sequel IIביבליאָטעק: SMRT גלאָק ביבליאָטעק -
עוקאַריאָטיק מרנאַ סיקוואַנסינג-ילומינאַ
mRNA סיקוואַנסינג ינייבאַלז פּראָפילינג פון אַלע מרנאַ טראַנסקריפּציע פון סעלז אונטער ספּעציפיש טנאָים.עס איז אַ שטאַרק טעכנאָלאָגיע פֿאַר ריווילינג דזשין אויסדרוק פּראָפיל, דזשין סטראַקטשערז און מאָלעקולאַר מעקאַניזאַמז פון זיכער בייאַלאַדזשיקאַל פּראַסעסאַז.ביז איצט, mRNA סיקוואַנסינג איז וויידלי געוויינט אין פונדאַמענטאַל פאָרשונג, קליניש דיאַגנאָסטיקס, מעדיצין אַנטוויקלונג, עטק.
פּלאַטפאָרמע: Illumina NovaSeq Platform
-
ניט-רעפערענץ באזירט מרנאַ סיקוואַנסינג-יללומינאַ
mRNA סיקוואַנסינג אַדאַפּץ ווייַטער-דור סיקוואַנסינג טעכניק (NGS) צו כאַפּן די שליח רנאַ (מרנאַ) פאָרעם עוקאַריאָטע אין אַ ספּעציפיש צייט וואָס עטלעכע ספּעציעל פאַנגקשאַנז אַקטאַווייט.די לאָנגעסט טראַנסקריפּט ספּלייסט איז גערופן 'וניגענע' און געוויינט ווי דער רעפֿערענץ סיקוואַנס פֿאַר סאַבסאַקוואַנט אַנאַליסיס, וואָס איז אַ עפעקטיוו מיטל צו לערנען די מאָלעקולאַר מעקאַניזאַם און רעגולאַטאָרי נעץ פון די מינים אָן רעפֿערענץ.
נאָך טראַנסקריפּטאָמע דאַטן פֿאַרזאַמלונג און ונידזשינע פאַנגקשאַנאַל אַנאַטיישאַן
(1) ססר אַנאַליסיס, CDS פּראָגנאָז און דזשין סטרוקטור וועט זיין פּריפאָרמד.
(2) קוואַנטיפיקאַטיאָן פון ונידזשינע אויסדרוק אין יעדער מוסטער וועט זיין דורכגעקאָכט.
(3) דיפערענטשאַלי אויסגעדריקט ונידזשינעס צווישן סאַמפּאַלז (אָדער גרופּעס) וועט זיין דיסקאַווערד באזירט אויף ונידזשינע אויסדרוק
(4) קלאַסטערינג, פאַנגקשאַנאַל אַנאָטאַציע און ענריטשמענט אַנאַליסיס פון דיפערענטשאַלי אויסגעדריקט ונידזשינעס וועט זיין דורכגעקאָכט
-
לאנג ניט-קאָודינג סיקוואַנסינג-יללומינה
לאנג ניט-קאָדינג רנאַ (לנקרנאַ) זענען אַ טיפּ פון רנאַ מאַלאַקיולז מיט אַ לענג פון מער ווי 200 נט, וואָס זענען קעראַקטערייזד דורך גאָר נידעריק קאָדירונג פּאָטענציעל.LncRNA, ווי אַ שליסל מיטגליד אין ניט-קאָדינג רנאַ, איז דער הויפּט געפֿונען אין קערן און פּלאַזמע.די אַנטוויקלונג אין סיקוואַנסינג טעכנאָלאָגיע און ביאָינפאָרמטיק ינייבאַלז לעגיטימאַציע פון פילע ראָמאַן ינקרנאַס און מיטאַרבעטער יענע מיט בייאַלאַדזשיקאַל פאַנגקשאַנז.אַקיומיאַלאַטיוו עווידענסעס פֿאָרשלאָגן אַז lncRNA איז וויידלי ינוואַלווד אין עפּיגענעטיק רעגולירן, טראַנסקריפּציע רעגולירן און פּאָסטן-טראַנסקריפּשאַן רעגולירן.
-
קליין רנאַ סיקוואַנסינג-יללומינאַ
קליין רנאַ רעפערס צו אַ קלאַס פון ניט-קאָדינג רנאַ מאַלאַקיולז וואָס זענען יוזשאַוואַלי ווייניקער ווי 200נט אין לענג, אַרייַנגערעכנט מיקראָ רנאַ (מירנאַ), קליין ינטערפיראַנס רנאַ (סירנאַ), און פּיווי-ינטעראַקטינג רנאַ (פּירנאַ).
מיקראָרנאַ (מירנאַ) איז אַ קלאַס פון ענדאָגענאָוס קליין רנאַ מיט אַ לענג פון וועגן 20-24נט, וואָס פיעסעס אַ פאַרשיידנקייַט פון וויכטיק רעגולאַטאָרי ראָלעס אין סעלז.מירנאַ ינוואַלווד אין פילע לעבן פּראַסעסאַז וואָס אַנטדעקן געוועב - ספּעציפיש און בינע - ספּעציפיש אויסדרוק און העכסט קאַנסערווד אין פאַרשידענע מינים.
-
סיררנאַ סיקוואַנסינג-יללומינאַ
CircRNAs (Circular RNAs) זענען איין קלאַס פון ניט-קאָדינג רנאַ מאַלאַקיולז וואָס זענען קורץ פון 5′ סוף היטל און 3′ סוף פּאָלי (א) עק.סירקרנאַס דורכפירן קייַלעכיק סטרוקטור דורך די קאָוואַלענט בונד וואָס איז סטאַטוס קעגן רנאַ עקסאָנוקלאַסע דיידזשעסטשאַן.סיררנאַ פיעסעס אַ וויכטיק ראָלע אין דער וווּקס און אַנטוויקלונג פון אָרגאַניזאַמז און זייער קעגנשטעל צו די פונדרויסנדיק סוויווע.
CircRNA האט פילע פאַנגקשאַנז, וואָס קענען קאַמפּעטיטיוו בינדן מירנאַ, יגזערט די רעגולאַטאָרי פונקציע פון סערנאַ, צו רעגולירן דזשין אויסדרוק.אין די לעצטע יאָרן, עס איז אויך געפונען אַז עס איז ענג שייַכות צו די פּאַסירונג און אַנטוויקלונג פון חולאתן, און האט גרויס אַפּלאַקיישאַן פּראַספּעקס אין דער ריכטונג פון קרענק דיאַגנאָסיס מאַרקערס און אַזוי אויף.
