Falanqaynta Segregant Bulked
Faa'iidooyinka Adeegga
Takagi et al., Joornaalka dhirta, 2013
● Degenaansho sax ah: Isku darka busaska 30+30 ilaa 200+200 oo qof si loo yareeyo dhawaaqa asalka;Saadaasha gobolka ee mutatan-ku-salaysan ee musharraxiinta ee aan isku midka ahayn.
● Falanqaynta dhamaystiran: Qoto-dheer ee shaqada hidda-wadaha musharaxa, oo ay ku jiraan NR, SwissProt, GO, KEGG, COG, KOG, iwm.
● Wakhtiga ka-soo-noqoshada oo dhoqso leh: Degdegga hidde-sideyaasha 45 maalmood oo shaqo gudahood.
Khibrad ballaadhan: BMK waxa ay ku biirisay kumanaan astaamood oo deegaan ah, oo daboolaya noocyada kala duwan sida dalagyada, wax soo saarka biyaha, kaynta, ubaxa, miraha, iwm.
Tilmaamaha Adeegga
Dadweynaha:
Kala soocida faraca waalidka oo leh astaamo iska soo horjeeda.
tusaale F2 farcanka, Backcrossing (BC), recombinant inbred line(RIL)
Barkadda isku dhafka ah
Sifada tayada leh: 30 ilaa 50 qof (ugu yaraan 20)/bulk
Marka loo eego tratis tirade: ugu sarreeya 5% ilaa 10% shakhsiyaadka leh noocyo aad u daran oo ka jira dhammaan dadka (ugu yaraan 30+30).
qoto dheer ee isku xigxiga lagu taliyay
Ugu yaraan 20X/waalidka iyo 1X/farac shakhsi ahaaneed (tusaale ahaan barkada isku darka faraca ee 30+30 shaqsi, qoto dheer ee isku xigxiga waxay noqon doontaa 30X bulk kasta)
Falanqaynta bioinformatics
● Genom oo dhan oo isku xiga
● Habaynta xogta
● SNP/Indel wacitaanka
● Baadhitaanka gobolka musharraxiinta
● Sharaxaada shaqada hidda-wadaha musharaxa
Tusaalaha Shuruudaha iyo Bixinta
Tusaalaha Shuruudaha:
Nucleotides:
| muunad gDNA | Muunada unugyada |
| Xooga saarida: ≥30 ng/μl | Dhirta: 1-2 g |
| Qadarka: ≥2 μg (mugga ≥15 μl) | Xoolaha: 0.5-1 g |
| Daahirnimada: OD260/280= 1.6-2.5 | Dhiig dhan: 1.5 ml |
Socodka Shaqada Adeegga
Naqshadaynta tijaabada
Tusaalaha keenista
soo saarista RNA
Dhismaha maktabadda
Isku xigxiga
Falanqaynta xogta
Adeegyada iibka kadib
1.Association analysis base on Euclidean Distance (ED) si loo aqoonsado gobolka musharaxa.Sawirkan soo socda
dhidibka X: Nambarka koromosoomyada;Dhibic kastaa waxay ka dhigan tahay qiimaha ED ee SNP.Khadka madow wuxuu u dhigmaa qiimaha ED ee ku habboon.Qiimaha sare ee ED wuxuu muujinayaa xiriir aad u weyn oo ka dhexeeya goobta iyo phenotype.Khadka cas ee casaanka ah wuxuu u taagan yahay heerka isbahaysiga muhiimka ah.
2.Association analysis ku salaysan ma SNP-index
dhidibka X: Nambarka koromosoomyada;Dhibic kastaa waxay ka dhigan tahay qiimaha SNP-index.Khadka madow wuxuu u taagan yahay qiimaha SNP-index.Markasta oo uu qiimuhu weynaado, waa inta ururku aad muhiim u yahay.
Kiiska BMK
Saamaynta weyn ee tirooyinka goobta Fnl7.1 waxay qeexaysaa embryogenesis soo daahay borotiin badan oo la xidhiidha dhererka qoorta miro ee qajaarka
La daabacay: Wargeyska Biotechnology ee dhirta, 2020
Istaraatiijiyada isku xigxiga:
Waalidiinta (Jin5-508, YN): Genom dhan oo u dhiganta 34× iyo 20×.
Barkadaha DNA-da (50 Qoorta dheer iyo 50 qoor-gaaban): Dib u soo celinta 61× iyo 52×
Natiijooyinka muhiimka ah
Daraasaddan, kala soocidda dadweynaha (F2 iyo F2: 3) ayaa la abuuray iyada oo la gooyay khadka qajaarka qoorta dheer Jin5-508 iyo qoorta gaaban YN.Laba barkadood oo DNA ah ayaa waxaa dhisay 50 qof oo qoor-dheer oo aad u daran iyo 50 qof oo qoor-gaaban ah.Saamaynta weyn ee QTL waxaa lagu aqoonsaday Chr07 falanqaynta BSA iyo khariidaynta QTL ee dhaqameed.Gobolka musharaxa ayaa sidoo kale lagu soo koobay khariidad-khariidad, tirinta muujinta hidda-wadaha iyo tijaabooyinka transgenic, kaas oo muujiyay hidda-wadaha muhiimka ah ee xakamaynta dhererka qoorta, CsFnl7.1.Intaa waxaa dheer, polymorphism-ka CsFnl7.1 ee gobolka dhiirrigeliyaha ayaa la ogaaday inuu la xiriiro muujinta u dhiganta.Falanqaynta phylogenetic dheeraad ah ayaa soo jeedisay in meesha Fnl7.1 ay aad ugu dhowdahay inuu ka soo jeedo Hindiya.
 Khariidadda QTL ee falanqaynta BSA si loo aqoonsado gobolka musharaxa ee la xidhiidha dhererka qoorta qajaarka |  Noocyada LOD ee QTL-qajaarka qoorta-dhererka ayaa lagu aqoonsaday Chr07 |
Xu, X., iyo al."Saamaynta tirada ugu weyn ee goobta Fnl7.1 waxay qeexaysaa embryogenesis soo daahay borotiin badan oo la xidhiidha dhererka qoorta miro ee qajaarka."Wargeyska Biotechnology ee dhirta 18.7(2020).
