Genome Jamur
Kaluwihan Service
● Multiple sequencing strategi kasedhiya kanggo tujuan riset beda
● Pengalaman banget ing perakitan genom jamur kanthi luwih saka 10.000 genome lengkap pene dirakit.
● Tim dhukungan teknis profesional sawise-sale sing nyukupi kabutuhan riset sing luwih spesifik.
Spesifikasi Layanan
| Layanan | Strategi Sequencing | Kualitas dijamin | Perkiraan wektu giliran |
| Peta jamur alus | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 dina kerja |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Peta jamur pene lengkap | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Rasio jangkar kromosom> 90% | 45 dina kerja |
Analisis bioinformatika
● Kontrol kualitas data mentah
● Déwan génom
● Analisis komponen génom
● Anotasi fungsi gen
● Analisis genomik komparatif
Syarat Sampel lan Pangiriman
Syarat Sampel:
KanggoEkstrak DNA:
| Tipe Sampel | Jumlah | Konsentrasi | Kemurnian |
| Ekstrak DNA | > 1,2 ug | > 20 ng/ml | OD260/280= 1.6-2.5 |
Kanggo sampel jaringan:
| jinis sampel | Dianjurake perawatan sampel | Panyimpenan sampel lan pangiriman |
| Jamur uniseluler | Mirsani ragi ing mikroskop lan kumpulake ing fase eksponensial Transfer budaya (ngemot kira-kira. 3-4.5e9 sel) menyang 1,5 utawa 2 ml eppendorf.(Terus es) Centrifuge tabung kanggo 1 menit ing 14000 g kanggo ngumpulake bakteri lan mbusak supernatant kasebut kanthi teliti, Segel tabung lan beku bakteri ing nitrogen cair paling sethithik 1-3 jam.Simpen tabung ing -80 ℃ kulkas. | Beku conto ing nitrogen cair kanggo 3-4 jam lan simpen ing nitrogen cair utawa -80 derajat kanggo reservasi jangka panjang.Pengiriman sampel nganggo es garing dibutuhake. |
| Jamur Makro | Tisu ing fase pertumbuhan aktif dianjurake. Bilas jaringan nganggo banyu tanpa endotoksin, banjur 70% eton. Simpen sampel ing cryo-tabung. |
Alur Kerja Layanan
pangiriman sampel
Konstruksi perpustakaan
Sequencing
Analisis data
Layanan sawise-sale
1.Circos diagram ing komponen genomic jamur
2. Analisis genom komparatif: wit filogenetik
