-
Analisis Asosiasi Genome-wide
Studi asosiasi genom (GWAS) nduweni tujuan kanggo ngenali varian genetik (genotip) sing ana gandhengane karo sifat spesifik (fenotipe).Panaliten GWAS nyelidiki tandha-tandha genetik nyabrang kabeh genom saka akeh individu lan prédhiksi asosiasi genotipe-fenotip kanthi analisis statistik ing tingkat populasi.Wis akeh diterapake ing riset babagan penyakit manungsa lan pertambangan gen fungsional babagan sifat kompleks kewan utawa tanduran.
-
Urutan RNA nukleus tunggal
Maju ing teknik tangkapan sel tunggal lan teknik konstruksi perpustakaan individu sing digabungake karo urutan throughput dhuwur ngidini sinau ekspresi gen ing basis sel-sel.Iki ngidini analisis sistem sing luwih jero lan lengkap babagan populasi sel sing kompleks, sing umume nyegah masking heterogenitas kanthi njupuk rata-rata kabeh sel.
Nanging, sawetara sel ora cocog kanggo digawe dadi suspensi sel siji, mula metode persiapan sampel liyane - ekstraksi inti saka jaringan dibutuhake, yaiku, inti langsung diekstrak saka jaringan utawa sel lan disiapake dadi suspensi inti tunggal kanggo siji- urutan sel.
BMK nyedhiyakake layanan urutan RNA sel tunggal adhedhasar 10 × Genomics ChromiumTM.Layanan iki wis akeh digunakake ing studi babagan studi sing gegandhengan karo penyakit, kayata diferensiasi sel kekebalan, heterogenitas tumor, pangembangan jaringan, lsp.
Chip transkriptom spasial: 10 × Genomics
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Urutan Genome Tanduran / Kewan Kabèh
Urutan ulang genom wutuh, uga dikenal minangka WGS, ngidini mutasi umum lan langka ing kabeh genom kalebu Polimorfisme Nukleotida Tunggal (SNP), Pambusakan Insertion (InDel), Variasi Struktur (SV), lan Variasi Nomer Salinan (CNV). ).SV nggawe bagean sing luwih gedhe saka basis variasi tinimbang SNP lan nduwe pengaruh sing luwih gedhe ing genom, sing nduwe pengaruh sing signifikan marang organisme urip.Resequencing sing dawa diwaca ngidini identifikasi pecahan gedhe lan variasi rumit sing luwih tepat amarga maca dawa nggawe luwih gampang kromosom nyebrang wilayah sing rumit kayata tandem repeats, wilayah sing sugih GC/AT, lan wilayah hiper-variabel.
Platform: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Transkriptom Spasial BMKMANU S1000
Organisasi spasial sel nduweni peran penting ing macem-macem proses biologi, kayata infiltrasi kekebalan, perkembangan embrio, lan liya-liyane. Urutan transkriptom spasial, sing nuduhake profil ekspresi gen nalika nahan informasi posisi spasial, wis menehi wawasan gedhe babagan arsitektur jaringan tingkat transkriptom.Kanthi pangembangan teknologi, morfologi jaringan ultra-jelas lan prabédan struktural nyata ekspresi molekul spasial kudu ditliti kanthi resolusi sing luwih dhuwur.BMKGENE nyedhiyakake layanan urutan transkriptom spasial siji-mandeg saka conto menyang wawasan biologis.
Teknologi transkriptomi spasial nguatake perspektif novel ing macem-macem arena riset kanthi ngrampungake profil ekspresi gen kanthi isi spasial ing sampel heterogen.
Chip transkriptom spasial: BMKMANU S1000
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
10x Transkriptom Spasial Visium Genomics
Ekspresi Gen Spasial Visium minangka teknologi urutan transkriptom spasial utama kanggo klasifikasi jaringan adhedhasar total mRNA.Peta kabeh transkrip kanthi konteks morfologis kanggo nemokake wawasan novel babagan perkembangan normal, patologi penyakit, lan riset terjemahan klinis.BMKGENE nyedhiyakake layanan urutan transkriptom spasial siji-mandeg saka conto menyang wawasan biologis.
Teknologi transkriptomi spasial nguatake perspektif novel ing macem-macem arena riset kanthi ngrampungake profil ekspresi gen kanthi konten spasial ing sampel heterogen..
Chip transkriptom spasial: 10x Genomics Visium
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Full-Length mRNA Sequencing-Nanopore
Urutan RNA wis dadi alat sing penting kanggo analisis transkriptom lengkap.Mesthi, urutan maca cekak tradisional entuk akeh pangembangan penting ing kene.Nanging, asring nemoni watesan ing identifikasi isoform lengkap, kuantifikasi, bias PCR.
Urutan nanopore mbedakake dhewe saka platform urutan liyane, amarga nukleotida diwaca langsung tanpa sintesis DNA lan ngasilake maca dawa ing puluhan kilobase.Iki nguatake transkrip lengkap sing diwaca langsung lan ngatasi tantangan ing studi tingkat isoform.
Platform:Nanopore PromethION
Pustaka:cDNA-PCR
-
Urutan mRNA lengkap -PacBio
Saikiurutan transkriptom lengkap, uga dikenal minangkaSaikiIso-Seq njupuk kaluwihan saka sequencer PacBio ing dawa diwaca, kang mbisakake urutan molekul cDNA lengkap-dawa tanpa break.Iki rampung ngindhari kesalahan sing diasilake ing langkah perakitan transkrip lan nggawe set unigene kanthi resolusi tingkat isoform.Set unigene iki nyedhiyakake informasi genetik sing kuat minangka "genom referensi" ing tingkat transkriptom.Kajaba iku, nggabungake karo data urutan generasi sabanjure, layanan iki nguatake kuantitas ekspresi tingkat isoform sing akurat.
Platform: PacBio Sekuel IIPerpustakaan: perpustakaan lonceng SMRT -
Eukariotik mRNA Sequencing-Illumina
Urutan mRNA mbisakake profil kabeh mRNA sing ditranskrip saka sel ing kahanan tartamtu.Iki minangka teknologi sing kuat kanggo mbukak profil ekspresi gen, struktur gen lan mekanisme molekuler saka proses biologi tartamtu.Nganti saiki, urutan mRNA wis akeh digunakake ing riset dhasar, diagnostik klinis, pangembangan obat, lsp.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Non-Referensi adhedhasar mRNA Sequencing-Illumina
Urutan mRNA nggunakake teknik urutan generasi sabanjure (NGS) kanggo njupuk RNA (mRNA) utusan saka Eukariota ing wektu tartamtu sing sawetara fungsi khusus diaktifake.Transkrip paling dawa sing disambung diarani 'Unigene' lan digunakake minangka urutan referensi kanggo analisis sakteruse, sing minangka sarana efektif kanggo nyinaoni mekanisme molekuler lan jaringan pangaturan spesies tanpa referensi.
Sawise perakitan data transkrip lan anotasi fungsional unigene
(1)Analisis SSR, prediksi CDS lan struktur gen bakal dibentuk.
(2) Kuantifikasi ekspresi unigene ing saben sampel bakal ditindakake.
(3) Unigenes sing dibedakake antarane conto (utawa klompok) bakal ditemokake adhedhasar ekspresi unigene
(4) Kluster, anotasi fungsional, lan analisis pengayaan saka unigen sing diungkapake kanthi beda bakal ditindakake
-
Long non-coding sequencing-Illumina
Long non-coding RNAs (lncRNAs) minangka jinis molekul RNA sing dawane ngluwihi 200 nt, sing diciriake kanthi potensial pengkodean sing sithik banget.LncRNA, minangka anggota kunci ing RNA non-coding, utamane ditemokake ing nukleus lan plasma.Pangembangan teknologi urutan lan bioinformatika ngidini identifikasi pirang-pirang lncRNA novel lan nggandhengake fungsi biologis.Bukti akumulatif nuduhake manawa lncRNA melu regulasi epigenetik, regulasi transkripsi lan regulasi pasca transkripsi.
-
Urutan RNA cilik-Illumina
RNA cilik nuduhake kelas molekul RNA non-coding sing dawane kurang saka 200nt, kalebu RNA mikro (miRNA), RNA interferensi cilik (siRNA), lan RNA interaksi piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) minangka kelas RNA cilik endogen kanthi dawa udakara 20-24nt, sing nduwe macem-macem peran pangaturan penting ing sel.miRNA melu pirang-pirang proses urip sing ngungkapake jaringan - spesifik lan tahap - ekspresi spesifik lan dijaga banget ing macem-macem spesies.
-
circRNA sequencing-Illumina
CircRNAs (Circular RNAs) minangka salah sawijining kelas molekul RNA non-coding sing cendhak 5′ tutup mburi lan 3′ mburi poli(A) buntut.CircRNAs nindakake struktur bunder kanthi ikatan kovalen sing status nglawan pencernaan RNA exonuclease.circRNA nduweni peran penting ing pertumbuhan lan perkembangan organisme lan resistensi marang lingkungan njaba.
CircRNA nduweni akeh fungsi, sing bisa ngiket miRNA kanthi kompetitif, nindakake fungsi pangaturan ceRNA, kanggo ngatur ekspresi gen.Ing taun-taun pungkasan, uga ditemokake yen ana hubungane karo kedadeyan lan perkembangan penyakit, lan nduweni prospek aplikasi gedhe ing arah panandha diagnosis penyakit lan liya-liyane.
