Bacteria Complete Genome
Painga Ratonga
● He maha nga rautaki raupapa e waatea ana mo nga whaainga rangahau rereke
● Huakita oti ira ira tangata ki te 0 Gap taurangi.
● He tino mohio ki te huihuinga ira huakita me te neke atu i te 10,000 kua oti te whakahiato.
● Ngaio i muri-hoko roopu tautoko hangarau e whakatutuki ana i nga hiahia rangahau motuhake ake.
Whakatakotoranga Ratonga
| WhakaraupapaRautaki | Whare Pukapuka | Kounga taurangi | Te wa huri-huringa |
| Nanopore 100X + Illumina 50X | Nanopore 20K PE150 | 0 Awha | 30 Ra |
| PacBio HiFi 30X | PacBio 10K |
Ko nga rangahau bioinformatics
● Mana kounga raraunga raw
● Huihuinga Genome
● Te tātari wae o Genome
● Tohu mahi ira
● Te tātari iraira whakatairite
Nga Whakaritenga Tauira me te Tukunga
Whakaritenga Tauira:
MoNga tangohanga DNA:
| Momo Tauira | Te nui | Te aro | Maamaa |
| Nga tangohanga DNA | ＞ 2 μg | ＞ 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Mo nga tauira kiko:
| Momo tauira | Te maimoatanga tauira e taunaki ana | Te rokiroki tauira me te tuku |
| Huakita | Mātakihia te huakita i raro i te karu karu ka kohikohi huakita i roto i te wahanga taupūtanga Whakawhitihia te ahurea huakita (kei roto tata ki te 3-4.5e9 nga pūtau) ki roto i te eppendorf 1.5, 2 ml ranei.(Kia mau ki te hukapapa) Whakawhanahia te ngongo mo te 1 meneti i te 14000 g hei kohi huakita me te ata tango i te supernatant Hirihia te ngongo ka whakatio i nga huakita ki roto i te hauota wai mo te iti rawa 30 meneti.Whakaorangia te ngongo ki roto i te pouaka pouaka -80 ℃. | Whakatiotia nga tauira ki roto i te hauota wai mo te 3-4 haora ka penapena ki roto i te hauota wai, -80 tohu ranei ki te rahui mo te wa roa.Ko te tuku tauira me te huka maroke e hiahiatia ana. |
Te Rerenga Mahi Ratonga
Te tuku tauira
Te hanga whare pukapuka
Whakaraupapa
Te tātari raraunga
Nga ratonga muri-hoko
1.Circos o te ira huakita
2.Whakawaehere ira matapae
3. Te tātari ira tangata whakatairite: te rakau phylogenetic
