Mahere wera
Ka whakamahia te konae raraunga matrix mo te tuhi mahere wera, ka taea te tātari, te whakataurite me te kohinga matrix raraunga.Ko te nuinga o te waa e whakamahia ana mo te wetewete huinga o te taumata whakaaturanga ira i waenga i nga tauira rereke.
Gene Annotation
Ka mahia te tohu mahi ira ma te mapi i nga raupapa i roto i te konae FASTA ki nga momo putunga raraunga.
Gene Annotation
Utauta Rapu Whakaritea Paetata Taketake
CDS_UTR_Prediction
I hoahoatia tenei taputapu ki te matapae i nga rohe whakawaehere (CDS) me nga rohe kore-whakawaehere (UTR) i roto i nga raupapa tuhinga kua homai i runga i te pupuhi ki te putunga raraunga pūmua me te matapae ORF.
Manhattan Pikitia
Ka taea e te mahere Manhattan te whakaatu i nga raraunga me te maha o nga tohu raraunga.Kei te whakamahia i roto i nga rangahau hononga-a-ira (GWAS).
Circos
Ka taea e te hoahoa CIRCOS te whakaatu tika i nga tohatoha SNP, InDeL, SV, CNV i runga i te genome.
GO_Whakarangatira
Ko TopGO he taputapu i hangaia mo te whakarangatira mahi.Kei roto i te kete TopGO-Bioconductor he tātari korero rerekee, he tātaritanga whakarangatira GO me te tirohanga o nga hua.Ka whakaputahia he kōpaki me te putanga ko "Graph", kei roto nga hua mo topGO_BP, topGO_CC me topGO_MF.
WGCNA
Ko te WGCNA he tikanga keri raraunga e whakamahia nuitia ana mo te kimi i nga waahanga whakaputa-a-ira.E tika ana ki nga momo huingararaunga korero tae atu ki nga raraunga microarray me nga raraunga whakaputanga ira i ahu mai i te raupapa reanga e whai ake nei.
InterProScan
InterPro raupapa pūmua tātari me te whakarōpūtanga
GO_KEGG_Whakarangatira
He mea hoahoa tenei taputapu ki te whakaputa histogram whakarangatira GO, histogram whakarangatira KEGG me te ara whakarangatira KEGG i runga i te huinga ira kua whakaratohia me te tuhi korero e pa ana.