Te Whakatairanga mo te Chromatin Whakawhiti-Uhoe me te Whakaraupapa Whakaraupapa Teitei (ATAC-seq)
Painga Ratonga
● Tātari Matawhānui: Pipa tātaritanga ngaio ki te whakatutuki i nga momo hiahia tātari kua whakaritea;
● He Wheako Nui: E hia rau nga kaupapa kua oti pai i tenei wa, tae atu ki nga tauira kararehe me nga tipu.
Whakatakotoranga Ratonga
Papaaho: Illumina NovaSeq turanga
Momo whare pukapuka: ATAC-seq
Putanga raraunga e taunaki ana: ≥20M panui
Nga Whakaritenga Tauira
Momo tauira: Kopa, pūtau ora, pūtau tio ranei me etahi atu
Tau pūtau: ≥ 5×105ngā pūtau, ko te tau pūtau tika te mea matua ki te angitu o te whakamātau;
Te taumaha o te kopa: ≥ 200mg te kiko hou;
Toto: ≥ 2 mL
Te Rerenga Mahi Ratonga
Hoahoa whakamatautau
Te tuku tauira
tangohanga DNA
Te hanga whare pukapuka
Whakaraupapa
Te tātari raraunga
Nga ratonga muri-hoko
1.Heatmap i runga i te ATAC ka panui te tohatoha ki TSS me nga rohe tata (±3 kb)
2.Ko te tohatoha o te rohe chromatin tuwhera i roto i nga waahanga genome rereke
3.Differential tihi karanga i waenganui i ngā rōpū
whiwhi korero
Tuhia to korero ki konei ka tukuna mai ki a matou
