BMKCloud Log in
条形 Banner-០៣

ផលិតផល

លំដាប់ DNA/RNA - លំដាប់ណាណូប៉ូរ

ONT sequencing គឺជាម៉ូលេគុលតែមួយ បច្ចេកវិជ្ជាកំណត់រលកសញ្ញាអគ្គិសនីតាមពេលវេលាជាក់ស្តែង ដោយផ្អែកលើ nanopores គោលការណ៍លំដាប់នៃវេទិកានីមួយៗគឺដូចគ្នា។DNA/RNA ខ្សែទ្វេនឹងភ្ជាប់ទៅនឹងប្រូតេអ៊ីន nanoporous ដែលបានបង្កប់នៅក្នុង biofilm និង unwinding ក្រោមការនាំមុខនៃប្រូតេអ៊ីនម៉ូតូ នៅក្រោមសកម្មភាពនៃភាពខុសគ្នានៃវ៉ុលពីភាគីទាំងពីរនៃ biofilm នោះ strands DNA/RNA ឆ្លងកាត់ប្រូតេអ៊ីនឆានែល nanopore នៅជាក់លាក់មួយ។ អត្រា។ដោយសារតែភាពខុសគ្នានៃលក្ខណៈសម្បត្តិគីមីនៃមូលដ្ឋានផ្សេងគ្នានៅលើខ្សែ DNA/RNA នៅពេលដែលមូលដ្ឋានតែមួយឬម៉ូលេគុល DNA ឆ្លងកាត់ឆានែល nanopore វានឹងបណ្តាលឱ្យមានការផ្លាស់ប្តូរសញ្ញាអគ្គិសនីខុសៗគ្នា។តាមរយៈការរកឃើញ និងត្រូវគ្នាទៅនឹងសញ្ញាទាំងនេះ ប្រភេទមូលដ្ឋានដែលត្រូវគ្នាអាចត្រូវបានគណនា ហើយការរកឃើញតាមពេលវេលាជាក់ស្តែងនៃលំដាប់អាចត្រូវបានបញ្ចប់។


ព័ត៌មានលម្អិតអំពីសេវាកម្ម

លទ្ធផលសាកល្បង

លក្ខណៈពិសេសលម្អិតនៃសេវាកម្ម

វេទិកា

ទំហំបណ្ណាល័យ

ទិន្នផលទិន្នន័យទ្រឹស្តី (ក្នុងមួយកោសិកា)

ភាពត្រឹមត្រូវមូលដ្ឋានតែមួយ

កម្មវិធី

ណាណូប៉ូរ

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Cell

85-92%

ការហៅទូរសព្ទ SV, De novo, លំដាប់ប្រវែងពេញ, Iso-Seq, ចំណារពន្យល់ហ្សែន, ការរកឃើញ DNA methylation

អត្ថប្រយោជន៍សេវាកម្ម

● បទពិសោធន៍ជាង 5 ឆ្នាំនៅលើវេទិកាលំដាប់ PacBio ជាមួយនឹងគម្រោងបិទជិតរាប់ពាន់ជាមួយប្រភេទផ្សេងៗ។
● BMKGENE គឺជាដៃគូផ្លូវការរបស់ Oxford Nanopore ដោយមានវិញ្ញាបនប័ត្រ RNA/DNA ពីរវេទិកា។
● មាន​គំរូ​នៃ​ឧបករណ៍​បន្តបន្ទាប់​គ្នា​ជា​មួយ​នឹង​ឧបករណ៍​ពេញលេញ និង​ការ​បញ្ជូន​បន្តបន្ទាប់​គ្នា​គ្រប់គ្រាន់។
● ដោយផ្អែកលើវេទិកា Nanopore ការស្រាវជ្រាវអំពីសត្វ និងរុក្ខជាតិជាង 10 ប្រភេទ Denovo ត្រូវបានបោះពុម្ពផ្សាយនៅក្នុងទស្សនាវដ្តីល្បីៗជាអន្តរជាតិ។

តម្រូវការគំរូ


ប្រភេទគំរូ

ចំនួនទឹកប្រាក់

ការផ្តោតអារម្មណ៍ (Qubit ®)

កម្រិតសំឡេង

ភាព​បរិសុទ្ធ

ផ្សេងៗ

DNA ហ្សែន

អាស្រ័យលើតម្រូវការទិន្នន័យ

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

ជម្រះកំពូលនៅ 260 nm, គ្មានការចម្លងរោគ

ការផ្តោតអារម្មណ៍ត្រូវវាស់ដោយ Qubit និង Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA សរុប

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5; គ្មានការចម្លងរោគ

តម្លៃ RIN ≥7.5

 

លំហូរការងារសេវាកម្ម

ការរៀបចំគំរូ

ការរៀបចំគំរូ

ការរៀបចំបណ្ណាល័យ

ការសាងសង់បណ្ណាល័យ

លំដាប់

លំដាប់

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

ការវិភាគ​ទិន្នន័យ

គំរូ QC

ការផ្តល់គម្រោង


  • មុន៖
  • បន្ទាប់៖

  • ការវាយតម្លៃគុណភាពទិន្នន័យនៃគំរូ DNA

    តារាងទី 1. ស្ថិតិលើទិន្នន័យស្អាត។

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    CleanSeqNum

    សម្អាតSumBase

    CleanN50Len

    សម្អាតN90Len

    CleanMeanLen

    សម្អាត MaxLen

    CleanMeanQual

    DNA_BMK01

    ១.២១៨.២៣៩

    ២៦.៣៧

    ១.១២១.៧៣៦

    ២៥.៩០

    ២៨.០១៤

    ១៥.៧៦៤

    ២៣.០៩០

    ១៤៣.១៨១

    9

    ការវាយតម្លៃគុណភាពទិន្នន័យនៃគំរូ RNA

    តារាងទី 1. ស្ថិតិលើទិន្នន័យស្អាត។

    ឈ្មោះ​ឯកសារ

    លេខសម្គាល់អតិថិជន

    អានលេខ

    លេខមូលដ្ឋាន

    N50

    ប្រវែងមធ្យម

    ប្រវែងអតិបរមា

    ពិន្ទុ MeanQ

    RNA_BMK001

    C2

    ៨.៩៤៧.៧០៨

    ៤.០៤៧.២៣០.០៨៣

    ៣៩៨

    ៤៥២

    ១២៩.២២៧

    សំណួរទី 12

    រូបភាពទី 1. អានការចែកចាយប្រវែង

    ក៣

    រូបភាពទី 2. ការចែកចាយពិន្ទុគុណភាពនៃទិន្នន័យស្អាត

    ក៤

    រូបភាពទី 3. ការចែកចាយពិន្ទុគុណភាព និងប្រវែងនៃទិន្នន័យស្អាត

    ក៥

    ទទួលបានសម្រង់

    សរសេរសាររបស់អ្នកនៅទីនេះ ហើយផ្ញើវាមកយើង

    ផ្ញើសាររបស់អ្នកមកយើង៖