វេតិកា | ទំហំបណ្ណាល័យ | ទិន្នផលទ្រឹស្តី (ក្នុងមួយកោសិកា) | ភាពត្រឹមត្រូវនៃមូលដ្ឋានតែមួយ | កម្មវិធី |
ណាណូផូន | 8KB 10 គីប, 20 គរលាប់, ultraleong, CDNA-PCR | 70-90GB / ក្រឡា | 85-92% | ការហៅទូរស័ព្ទ SV, de novo, លំដាប់ពេញលេញ, iso-seq, ចំណារពន្យល់ហ្សែន, ការរកឃើញមេតាណុលឌីអិនអេ |
ad បទពិសោធន៍ជាង 5 ឆ្នាំលើវេទិកាលំដាប់ប៉ាស៊ីហ្វិកដែលមានគម្រោងបិទទ្វាររាប់ពាន់ដែលមានប្រភេទផ្សេងៗគ្នា។
bmkgene គឺជាដៃគូផ្លូវការរបស់ Oxford Nanopore ដែលមានស៊ី ank / វិញ្ញាបនប័ត្រឌីអិនអេ / ឌីអិនអេ។
មានម៉ូឌែលសំខាន់ៗនៃលំដាប់ដែលមានឧបករណ៍ពេញលេញនិងមានលំដាប់លំដោយគ្រប់គ្រាន់។
●ផ្អែកលើវេទិកានីណូផូផូផូផូវជាង 10 នាក់និងរុក្ខជាតិស្រាវជ្រាវដែលមិនត្រូវបានបោះពុម្ពផ្សាយជាទិនានុប្បវត្តិដ៏ល្បីល្បាញអន្តរជាតិ។
ប្រភេទគំរូ | ចមនយន | ការផ្តោតអារម្មណ៍ (quebit ®) | ចមនយន | ភាពបរិសុទ្ធ | ផ្សេងៗ |
ឌីអិនអេហ្សិក | អាស្រ័យលើតម្រូវការទិន្នន័យ | ≥20ng / μl | ≥15μអិល | អូឌីអេ 26/280 = 1.7-2.2; អូឌីអេស 60 / 230≥1.5; កំពូលខ្ពស់បំផុតនៅ 260 អិមអិមគ្មានការចម្លងរោគទេ | ការផ្តោតអារម្មណ៍ចាំបាច់ត្រូវវាស់វែងដោយ quitbit និង qubit / nanopore ≤ 2 |
RNA សរុប | ≥1.2μg | ≥100μg / μl | ≥15μអិល | អូឌីអេស 60/280 = 1.7-2.5; OD260 / 230 = 0.5-2.5; គ្មានការចម្លងរោគ | rin តម្លៃ≥7.5 |
ការវាយតម្លៃគុណភាពទិន្នន័យនៃគំរូឌីអិនអេ
តារាងទី 1 ។ ស្ថិតិលើទិន្នន័យស្អាត។
bmkid | rowseqnum | rowsumbase | cleanseseqnum | CleashSumbase | creasnn50len | cleann90len | seftmentlen | SeftMaxlen | សំអាងការ |
dna_bmk01 | 1.218,239 | 26.37 | 1.121.736 | 25.90 | 28.014 | 15.764 | 23.090 | 143,181 | 9 |
ការវាយតំលៃគុណភាពទិន្នន័យនៃគំរូ RNA
តារាងទី 1 ។ ស្ថិតិលើទិន្នន័យស្អាត។
ង្ហរបតិផុ | អតិថិជន | តនើញ | តីធ្លា | n50 | មានរយៈពេល | ប្រវែងតម្លៃ | មានជាតិ |
RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4.047,2303030.083 | 398 | 452 | 129,227 | q12 |
រូបភាពទី 1 ។ ការចែកចាយប្រវែងអាន
រូបភាពទី 2 ការចែកចាយពិន្ទុគុណភាពនៃទិន្នន័យស្អាត
រូបភាពទី 3 ការចែកចាយទិន្នន័យស្អាតនិងគុណភាពប្រកបដោយគុណភាព