-
Uchambuzi wa Muungano wa Genome
Utafiti wa shirika pana la genome (GWAS) unalenga kutambua vibadala vya kijenetiki (genotype) vinavyohusishwa na sifa maalum (fenotipu).Utafiti wa GWAS huchunguza viashirio vya kijenetiki vinavyovuka jenomu nzima ya idadi kubwa ya watu na kutabiri uhusiano wa genotype-phenotype kwa uchanganuzi wa takwimu katika kiwango cha idadi ya watu.Imetumika sana katika utafiti juu ya magonjwa ya binadamu na uchimbaji wa jeni unaofanya kazi kwenye sifa changamano za wanyama au mimea.
-
Mpangilio wa kiini kimoja cha RNA
Uendelezaji wa kunasa seli moja na mbinu ya ujenzi wa maktaba ya mtu binafsi ikichanganya na upangaji wa matokeo ya juu huruhusu masomo ya usemi wa jeni kwa msingi wa seli baada ya seli.Huwezesha uchanganuzi wa kina na kamili wa mfumo juu ya idadi ya seli changamano, ambapo kwa kiasi kikubwa huepuka kuficha utofauti wao kwa kuchukua wastani wa seli zote.
Hata hivyo, baadhi ya seli hazifai kufanywa kuwa kusimamishwa kwa seli moja, hivyo mbinu nyingine za utayarishaji wa sampuli - uchimbaji wa kiini kutoka kwa tishu unahitajika, yaani, kiini hutolewa moja kwa moja kutoka kwa tishu au seli na kutayarishwa kuwa kusimamishwa kwa kiini kimoja kwa moja- mpangilio wa seli.
BMK hutoa 10× Genomics ChromiumTM kulingana na huduma ya mpangilio wa RNA ya seli moja.Huduma hii imetumika sana katika tafiti za tafiti zinazohusiana na magonjwa, kama vile utofautishaji wa seli za kinga, tofauti za tumor, ukuzaji wa tishu, n.k.
Chip ya nakala ya anga: 10× Genomics
Jukwaa: Illumina NovaSeq 6000
-
Mpangilio wa Genome wa Mimea/Wanyama
Upangaji upya wa jenomu nzima, pia unajulikana kama WGS, huwezesha kufichuliwa kwa mabadiliko ya kawaida na adimu kwenye jenomu nzima ikijumuisha Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Ufutaji wa Uingizaji (InDel), Utofauti wa Muundo (SV), na Nakili Tofauti ya Namba (CNV). )SVs hufanya sehemu kubwa ya msingi wa tofauti kuliko SNP na kuwa na athari kubwa kwenye jenomu, ambayo ina athari kubwa kwa viumbe hai.Ufuataji uliosomwa kwa muda mrefu huruhusu utambuzi sahihi zaidi wa vipande vikubwa na tofauti changamano kwa sababu usomaji wa muda mrefu hurahisisha zaidi kuvuka kwa kromosomu kwenye maeneo changamano kama vile marudio ya sanjari, maeneo yenye GC/AT-tajiri, na maeneo yanayobadilika sana.
Jukwaa: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Nakala ya Spatial ya BMKMANU S1000
Mpangilio wa anga wa seli una jukumu muhimu katika michakato mbalimbali ya kibayolojia, kama vile kupenya kwa kinga, ukuzaji wa kiinitete, n.k. Mpangilio wa nakala za anga, ambao unaonyesha wasifu wa usemi wa jeni huku ukihifadhi maelezo ya nafasi ya anga, umetoa maarifa makubwa katika usanifu wa tishu wa kiwango cha nukuu.Pamoja na maendeleo ya teknolojia, mofolojia ya tishu zilizo wazi kabisa na tofauti halisi ya kimuundo ya usemi wa anga wa molekuli zinahitaji kuchunguzwa kwa azimio la juu zaidi.BMKGENE hutoa huduma ya kina, ya sehemu moja ya ufuataji wa nukuu ya anga kutoka kwa sampuli hadi maarifa ya kibayolojia.
Teknolojia za nakala za anga ziliwezesha mitazamo ya riwaya katika nyanja mbalimbali za utafiti kwa kusuluhisha wasifu wa usemi wa jeni na maudhui ya anga katika sampuli tofauti.
Chip ya nakala ya anga: BMKMANU S1000
Jukwaa: Illumina NovaSeq 6000
-
10x Genomics Visium Transcriptome
Visium Spatial Gene Expression ni teknolojia kuu ya mpangilio wa nakala za anga za kuainisha tishu kulingana na jumla ya mRNA.Ramani ya nakala nzima na muktadha wa kimofolojia ili kugundua maarifa mapya katika maendeleo ya kawaida, ugonjwa wa ugonjwa, na utafiti wa kimatibabu wa tafsiri.BMKGENE hutoa huduma ya kina, ya sehemu moja ya ufuataji wa nukuu ya anga kutoka kwa sampuli hadi maarifa ya kibayolojia.
Teknolojia za nakala za anga ziliwezesha mitazamo ya riwaya katika nyanja mbalimbali za utafiti kwa kusuluhisha wasifu wa usemi wa jeni na maudhui ya anga katika sampuli tofauti..
Chip ya nukuu ya anga: Visium 10x ya Genomics
Jukwaa:Illumina NovaSeq 6000
-
Upangaji wa Urefu Kamili wa mRNA-Nanopore
Mfuatano wa RNA umekuwa zana yenye thamani sana kwa uchanganuzi wa kina wa nukuu.Bila shaka, mpangilio wa jadi wa kusoma kwa muda mfupi ulipata maendeleo mengi muhimu hapa.Hata hivyo, mara nyingi hukutana na vikwazo katika vitambulisho vya urefu kamili vya isoform, quantification, upendeleo wa PCR.
Mpangilio wa Nanopore hujitofautisha na majukwaa mengine ya mpangilio, kwa kuwa nyukleotidi husomwa moja kwa moja bila usanisi wa DNA na hutoa usomaji wa muda mrefu katika makumi ya kilobases.Hii huwezesha nakala za urefu kamili za kusoma moja kwa moja na kukabiliana na changamoto katika masomo ya kiwango cha isoform.
Jukwaa:Nanopore PromethION
Maktaba:cDNA-PCR
-
Mpangilio wa urefu wa mRNA -PacBio
De novomfuatano wa unukuzi wa urefu kamili, unaojulikana pia kamaDe novoIso-Seq inachukua faida za PacBio sequencer katika urefu wa kusoma, ambayo huwezesha mpangilio wa molekuli za cDNA za urefu kamili bila mapumziko yoyote.Hii huepuka kabisa hitilafu zozote zinazozalishwa katika hatua za mkusanyiko wa nakala na huunda seti za unigene na azimio la kiwango cha isoform.Seti hizi za unigene hutoa taarifa za kinasaba kama "jenomu ya marejeleo" katika kiwango cha transcriptome.Kwa kuongezea, ikichanganya na data ya upangaji wa kizazi kijacho, huduma hii huwezesha ukadiriaji sahihi wa usemi wa kiwango cha isoform.
Jukwaa: PacBio Sequel IIMaktaba: maktaba ya kengele ya SMRT -
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
Upangaji wa mRNA huwezesha uwekaji wasifu wa mRNA zote zilizonakiliwa kutoka kwa seli chini ya hali mahususi.Ni teknolojia yenye nguvu ya kufichua wasifu wa usemi wa jeni, miundo ya jeni na mifumo ya molekuli ya michakato fulani ya kibiolojia.Hadi sasa, mpangilio wa mRNA umetumika sana katika utafiti wa kimsingi, uchunguzi wa kimatibabu, ukuzaji wa dawa, n.k.
Jukwaa: Illumina NovaSeq 6000
-
Isiyo ya Marejeleo ya mRNA Sequencing-Illumina
Upangaji wa mRNA hutumia mbinu ya kizazi kijacho ya kupanga mpangilio (NGS) ili kunasa fomu ya RNA(mRNA) ya mjumbe ya Eukaryote katika kipindi mahususi ambacho baadhi ya vipengele maalum vinawashwa.Nakala ndefu zaidi iliyogawanywa iliitwa 'Unigene' na kutumika kama mfuatano wa marejeleo kwa uchanganuzi uliofuata, ambayo ni njia mwafaka ya kusoma utaratibu wa molekuli na mtandao wa udhibiti wa spishi bila marejeleo.
Baada ya mkusanyiko wa data ya nakala na ufafanuzi wa utendaji wa unigene
(1) Uchambuzi wa SSR, utabiri wa CDS na muundo wa jeni utarekebishwa mapema.
(2)Ukadiriaji wa usemi wa aina moja katika kila sampuli utafanywa.
(3) Unigene zilizoonyeshwa kwa njia tofauti kati ya sampuli (au vikundi) zitagunduliwa kulingana na usemi wa unigene.
(4) Kuunganisha, ufafanuzi wa utendaji na uchanganuzi wa uboreshaji wa unigene zilizoonyeshwa tofauti utafanywa.
-
Upangaji wa muda mrefu usio na usimbaji-Illumina
RNA ndefu zisizo na misimbo (lncRNAs) ni aina ya molekuli za RNA zenye urefu unaozidi nt 200, ambazo zina sifa ya uwezo mdogo sana wa usimbaji.LncRNA, kama mwanachama muhimu katika RNA zisizo na misimbo, hupatikana hasa kwenye kiini na plazima.Ukuzaji wa upangaji wa teknolojia na habari za kibayolojia huwezesha utambuzi wa riwaya nyingi za lncRNA na kuhusisha zile zilizo na kazi za kibiolojia.Ushahidi wa mkusanyiko unaonyesha kuwa lncRNA inahusika sana katika udhibiti wa epijenetiki, udhibiti wa unukuzi na udhibiti wa baada ya unukuzi.
-
Mpangilio mdogo wa RNA-Illumina
RNA ndogo inarejelea darasa la molekuli za RNA zisizo na usimbaji ambazo kwa kawaida huwa chini ya nt 200 kwa urefu, ikijumuisha RNA ndogo (miRNA), mwingiliano mdogo wa RNA (siRNA), na RNA inayoingiliana na piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) ni darasa la RNA ndogo endogenous yenye urefu wa takriban 20-24nt, ambayo ina aina mbalimbali za majukumu muhimu ya udhibiti katika seli.miRNA inahusika katika michakato mingi ya maisha ambayo inaonyesha tishu - maalum na hatua - kujieleza maalum na kuhifadhiwa sana katika aina tofauti.
-
circRNA mpangilio-Illumina
Ufuataji wa nukuu nzima umeundwa kuanisha aina zote za molekuli za RNA, ikijumuisha usimbaji (mRNA) na RNA zisizo na misimbo (ikijumuisha lncRNA, circRNA na miRNA) ambazo hunakiliwa na seli mahususi kwa wakati fulani.Ufuataji wa nukuu nzima, pia unajulikana kama "mfuatano wa jumla wa RNA" unalenga kufichua mitandao ya udhibiti kamili katika kiwango cha unukuzi.Kwa kutumia teknolojia ya NGS, mlolongo wa bidhaa zote za nakala zinapatikana kwa uchanganuzi wa ceRNA na uchanganuzi wa pamoja wa RNA, ambayo hutoa hatua ya kwanza kuelekea sifa za utendaji.Kufichua mtandao wa udhibiti wa circRNA-miRNA-mRNA msingi ceRNA.
