Bidhaa

Mpangilio mzima wa maandishi - Illumina

Ufuataji wa nukuu nzima - Picha Iliyoangaziwa ya Illumina

Ufuataji wa nukuu nzima unatoa mbinu ya kina ya kuorodhesha molekuli mbalimbali za RNA, ikijumuisha usimbaji (mRNA) na RNA zisizo za kusimba (lncRNA, circRNA, na miRNA).Mbinu hii inachukua nakala kamili ya seli mahususi kwa wakati fulani, ikiruhusu uelewa wa jumla wa michakato ya seli.Pia inajulikana kama "mfuatano wa jumla wa RNA," inalenga kufichua mitandao tata ya udhibiti katika kiwango cha unukuzi, kuwezesha uchanganuzi wa kina kama vile ushindani wa asili wa RNA (ceRNA) na uchanganuzi wa pamoja wa RNA.Hii inaashiria hatua ya awali kuelekea ubainishaji wa utendaji kazi, hasa katika kuibua mitandao ya udhibiti inayohusisha mwingiliano wa ceRNA unaotegemea circRNA-miRNA-mRNA.

Wasiliana nasi

Maelezo ya Huduma

Bioinformatics

Matokeo ya Onyesho

Machapisho Yanayoangaziwa

Vipengele

● Maktaba mbili ili kupanga nakala kamili: rRNA kupungua ikifuatwa na utayarishaji wa maktaba ya PE150 na uteuzi wa saizi ikifuatiwa na utayarishaji wa maktaba ya SE50.

● Kamilisha uchambuzi wa bioinformatics wa mRNA, lncRNA, circRNA na miRNA katika ripoti tofauti za bioinformatics.

● Uchanganuzi wa pamoja wa usemi wote wa RNA katika ripoti iliyojumuishwa, ikijumuisha uchanganuzi wa mitandao ya ceRNA.

Faida za Huduma

●Uchambuzi wa kina wa mitandao ya udhibiti: Uchanganuzi wa mtandao wa ceRNA umewezeshwa na upangaji wa pamoja wa mRNA, lncRNA, circRNA na miRNA na mtiririko kamili wa kazi wa kibiolojia.

●Ufafanuzi wa Kina: tunatumia hifadhidata nyingi ili kufafanua kiutendaji Jeni Zilizoonyeshwa kwa Tofauti (DEGs) na kufanya uchanganuzi unaolingana wa uboreshaji, kutoa maarifa juu ya michakato ya seli na molekuli msingi wa majibu ya nakala.

●Utaalamu wa Kina: kwa rekodi ya mafanikio ya kufunga zaidi ya miradi 2000 ya nakala nzima katika vikoa mbalimbali vya utafiti, timu yetu huleta uzoefu mwingi kwa kila mradi.

●Udhibiti Madhubuti wa Ubora: tunatekeleza vipengele vya udhibiti katika hatua zote, kuanzia sampuli na utayarishaji wa maktaba hadi upangaji na maelezo ya kibiolojia.Ufuatiliaji huu wa kina huhakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa juu kila wakati.

● Ufafanuzi wa Kina: tunatumia hifadhidata nyingi ili kufafanua kiutendaji Jeni Zilizoonyeshwa kwa Tofauti (DEGs) na kufanya uchanganuzi unaolingana wa uboreshaji, kutoa maarifa juu ya michakato ya seli na molekuli msingi wa majibu ya nakala.

●Usaidizi wa Baada ya Mauzo: Ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha huduma cha miezi 3 baada ya kuuza.Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.

Mahitaji ya Sampuli na Uwasilishaji

Maktaba	Mkakati wa mpangilio	Data iliyopendekezwa	Udhibiti wa Ubora
rRNA imekamilika	Illumina PE150	16 Gb	Q30≥85%
Ukubwa umechaguliwa	Illumina SE50	10-20M inasoma	Q30≥85%

Mahitaji ya Sampuli:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Kiasi (μg)

Usafi

Uadilifu

≥ 100

≥ 1

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Uchafuzi wa protini au DNA umepunguzwa au haujaonyeshwa kwenye jeli.

Mimea: RIN≥6.5

Mnyama: RIN≥7.0

5.0≥28S/18S≥1.0;

mwinuko mdogo au hakuna msingi

Uwasilishaji wa Sampuli Uliopendekezwa

Chombo:
2 ml centrifuge tube (bati foil haifai)
Sampuli ya kuweka lebo: Kundi+ kunakili mfano A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Usafirishaji:
1. Barafu-kavu: Sampuli zinahitaji kuingizwa kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.
2.RNAstable tubes: Sampuli RNA inaweza kukaushwa katika RNA utulivu tube (km RNAstable®) na kusafirishwa katika joto la kawaida.

Mtiririko wa Kazi ya Huduma

Muundo wa majaribio

Utoaji wa sampuli

Uchimbaji wa RNA

Ujenzi wa maktaba

Kufuatana

Uchambuzi wa data

Huduma za baada ya kuuza

Iliyotangulia: Mpangilio wa Kinga ya Chromatin (ChIP-seq)

Inayofuata: circRNA mpangilio-Illumina

Bioinformatics

Muhtasari wa kujieleza kwa RNA

Jeni zilizoonyeshwa kwa njia tofauti

uchambuzi wa ceRNA

MiRNA zilizoonyeshwa kwa njia tofauti na RNA zinazohusiana

Chunguza maendeleo ya utafiti yanayowezeshwa na huduma zote za ufuataji wa maandishi ya BMKGene' kupitia mkusanyo ulioratibiwa wa machapisho.

Dai, Y. et al.(2022) 'Maelezo ya kina ya mRNAs, lncRNAs na miRNAs katika ugonjwa wa Kashin-Beck unaotambuliwa na RNA-sequencing', Omics Molecular, 18 (2), pp. 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.

Liu, N. nan et al.(2022) 'Uchanganuzi kamili wa nakala za ustahimilifu wa Apis cerana katika Mlima wa Changbai wakati wa msimu wa baridi kali.', Gene, 830, uk. 146503–146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.

Wang, XJ na wengine.(2022) 'Multi-Omics Integration-Based Kipaumbele cha Competing Endogenous Regulation Networks in Small Cell Lung Cancer: Molecular Characterities and Drug Candidates', Frontiers in Oncology, 12, p.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.

Xu, P. na wengine.(2022) 'Uchambuzi jumuishi wa maelezo mafupi ya usemi ya lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA hufichua maarifa mapya katika mbinu zinazowezekana katika kukabiliana na viwavi wa mizizi kwenye karanga', BMC Genomics, 23(1), uk. 1–12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.

Yan, Z. et al.(2022) 'Mfuatano wa nakala nzima ya RNA huangazia utaratibu wa molekuli unaohusishwa na udumishaji wa ubora wa baada ya kuvuna broccoli kwa miale nyekundu ya LED', Biolojia na Teknolojia ya Baada ya Mavuno, 188, uk.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.