Bidhaa

10x Genomics Visium Transcriptome

Nakala za anga ni teknolojia ya kisasa ambayo inaruhusu watafiti kuchunguza mifumo ya usemi wa jeni ndani ya tishu huku wakihifadhi muktadha wao wa anga.Jukwaa moja lenye nguvu katika kikoa hiki ni 10x Genomics Visium pamoja na mpangilio wa Illumina.Kanuni ya Visium ya 10X iko kwenye chip maalum iliyo na eneo maalum la kukamata ambapo sehemu za tishu zimewekwa.Eneo hili la kunasa lina madoa yenye msimbo, ambayo kila moja inalingana na eneo la kipekee la anga ndani ya tishu.Molekuli za RNA zilizonaswa kutoka kwenye tishu huwekwa lebo ya vitambulishi vya kipekee vya molekuli (UMIs) wakati wa mchakato wa unukuzi wa kinyume.Maeneo haya yenye misimbo mipau na UMI huwezesha upangaji ramani sahihi wa anga na ukadiriaji wa usemi wa jeni katika mwonekano wa seli moja.Mchanganyiko wa sampuli zenye pau na UMIs huhakikisha usahihi na umahususi wa data inayozalishwa.Kwa kutumia teknolojia hii ya Spatial Transcriptomics, watafiti wanaweza kupata uelewa wa kina wa shirika la anga la seli na mwingiliano changamano wa molekuli unaotokea ndani ya tishu, wakitoa ufahamu wa thamani sana katika taratibu zinazohusu michakato ya kibayolojia katika nyanja mbalimbali, ikiwa ni pamoja na oncology, neuroscience, biolojia ya maendeleo, immunology. , na masomo ya mimea.

Jukwaa: Visium ya 10X ya Genomics na Illumina NovaSeq

Bei ya FOB:US $0.5 - 9,999 / Kipande

Kiasi kidogo cha Agizo:Vipande 100/Vipande

Uwezo wa Ugavi:10000 Kipande/Vipande kwa Mwezi

Wasiliana nasi

Maelezo ya Huduma

Bioinformatics

Matokeo ya Onyesho

Machapisho yaliyoangaziwa

Vipengele

● Azimio: 100 µM

● Kipenyo cha Mahali: 55 µM

● Idadi ya nafasi: 4992

● Eneo la kunasa: 6.5 x 6.5 mm

● Kila sehemu iliyo na upau imepakiwa na vianzio vinavyojumuisha sehemu 4:

- mkia wa aina nyingi (dT) kwa uanzishaji wa mRNA na usanisi wa cDNA

- Kitambulisho cha Kipekee cha Molekuli (UMI) ili kurekebisha upendeleo wa ukuzaji

- Msimbo wa pau wa anga

- Kufunga mlolongo wa sehemu ya kusoma 1 primer mpangilio

● Uchafuzi wa H&E wa sehemu

Faida

●Huduma ya kituo kimoja: hujumuisha hatua zote za uzoefu na ustadi, ikijumuisha utenganishaji wa cryo, upakaji madoa, uboreshaji wa tishu, uwekaji alama za anga, utayarishaji wa maktaba, mpangilio na habari za kibayolojia .

● Timu ya ufundi yenye ujuzi wa hali ya juu: mwenye uzoefu katika zaidi ya aina 250 za tishu na spishi 100+ ikijumuisha binadamu, panya, mamalia, samaki na mimea.

●Sasisho la wakati halisi kwenye mradi mzima: kwa udhibiti kamili wa maendeleo ya majaribio.

●Maelezo ya kina ya kibayolojia:kifurushi kinajumuisha uchanganuzi 29 na takwimu 100+ za ubora wa juu.

●Uchambuzi na taswira ya data iliyobinafsishwa: inapatikana kwa maombi tofauti ya utafiti.

●Uchanganuzi wa hiari wa pamoja na mpangilio wa mRNA wa seli Moja

Vipimo

Mahitaji ya Sampuli

Maktaba

Mkakati wa mpangilio

Data iliyopendekezwa

Udhibiti wa Ubora

Sampuli za cryo zilizopachikwa OCT, sampuli za FFPE

(Kipenyo bora zaidi: takriban 6x6x6 mm3)

Vitalu 3 kwa kila sampuli

Maktaba ya 10X Visium cDNA

Illumina PE150

50K PE usomaji kwa kila doa

(Gb 60)

RIN>7

Kwa maelezo zaidi kuhusu mwongozo wa maandalizi ya sampuli na mtiririko wa huduma, tafadhali jisikie huru kuzungumza na aBMKGENE mtaalam

Mtiririko wa kazi wa huduma

Katika awamu ya maandalizi ya sampuli, jaribio la awali la uchimbaji mwingi wa RNA hufanywa ili kuhakikisha kuwa RNA ya ubora wa juu inaweza kupatikana.Katika hatua ya uboreshaji wa tishu sehemu hutiwa madoa na kuonekana na hali ya upenyezaji wa kutolewa kwa mRNA kutoka kwa tishu huboreshwa.Itifaki iliyoboreshwa basi inatumika wakati wa ujenzi wa maktaba, ikifuatiwa na mpangilio na uchambuzi wa data.

Mtiririko kamili wa huduma unahusisha masasisho ya wakati halisi na uthibitisho wa mteja ili kudumisha kitanzi cha maoni kinachojibu, kuhakikisha utekelezaji wa mradi mzuri.

Iliyotangulia: Upangaji wa Urefu Kamili wa mRNA-Nanopore

Inayofuata: Nakala ya Spatial ya BMKMANU S1000

Inajumuisha uchambuzi ufuatao:

Udhibiti wa Ubora wa Data:

o Matokeo ya data na usambazaji wa alama za ubora

o Utambuzi wa jeni kwa kila sehemu

o Kufunika kwa tishu

Uchambuzi wa sampuli za ndani:

o Utajiri wa jeni

o Kuunganisha madoa, ikijumuisha uchanganuzi wa vipimo uliopunguzwa

o Uchanganuzi wa usemi tofauti kati ya nguzo: utambuzi wa jeni za alama

o Ufafanuzi wa kiutendaji na uboreshaji wa jeni za alama

Uchambuzi wa vikundi

o Kuchanganya tena madoa kutoka kwa sampuli zote mbili (km. magonjwa na udhibiti) na kuunganisha tena

o Utambulisho wa jeni za alama kwa kila nguzo

o Ufafanuzi wa kiutendaji na uboreshaji wa jeni za alama

o Usemi tofauti wa nguzo moja kati ya vikundi

Uchambuzi wa sampuli za ndani

Kuunganisha doa

10x (10)

Utambulisho wa jeni za alama na usambazaji wa anga

10x (12)

Uchambuzi wa vikundi

Mchanganyiko wa data kutoka kwa vikundi vyote viwili na kikundi tena

Jeni za alama za vikundi vipya

Gundua maendeleo yanayowezeshwa na huduma ya maandishi ya anga ya BMKGene na 10X Visium Katika machapisho haya yaliyoangaziwa:

Chen, D. et al.(2023) 'mthl1, homologue inayowezekana ya Drosophila ya GPCRs za mamalia za kushikamana, inahusika katika athari za antitumor kwa seli za oncogenic zilizodungwa kwenye nzi', Mijadala ya Chuo cha Kitaifa cha Sayansi cha Amerika, 120(30), uk.e2303462120.doi: /10.1073/pnas.2303462120

Chen, Y. na wengine.(2023) 'CHUMU huwezesha ubainishaji wa ubora wa juu wa data ya maandishi ya angavu', Muhtasari katika Bioinformatics, 24(2), uk. 1–10.doi: 10.1093/BIB/BBAD068.

Liu, C. na wenzake.(2022) 'Atlasi ya anga ya muda ya organogenesis katika ukuzaji wa maua ya okidi', Nucleic Acids Research, 50(17), uk. 9724–9737.doi: 10.1093/NAR/GKAC773.

Wang, J. na wengine.(2023) 'Kuunganisha Maandishi ya Spoti na Upangaji wa Kiini Kimoja cha RNA Hufichua Mikakati Inayoweza Kutokea ya Kitiba kwa Uterine Leiomyoma', Jarida la Kimataifa la Sayansi ya Biolojia, 19(8), uk. 2515–2530.doi: 10.7150/IJBS.83510.