Bidhaa

circRNA mpangilio-Illumina

Upangaji wa RNA wa duara (circRNA-seq) ni kuweka wasifu na kuchanganua RNA za duara, darasa la molekuli za RNA ambazo huunda vitanzi vilivyofungwa kutokana na matukio ya kuunganisha yasiyo ya kisheria, na kuzipa RNA hizi uthabiti ulioongezeka.Ingawa baadhi ya circRNA zimeonyeshwa kufanya kazi kama sponji ndogo za RNA, zikichukua microRNA na kuzizuia kudhibiti mRNA zinazolengwa, circRNA zingine zinaweza kuingiliana na protini, kurekebisha usemi wa jeni, au kuwa na majukumu katika michakato ya seli.Uchanganuzi wa usemi wa circRNA hutoa maarifa kuhusu majukumu ya udhibiti wa molekuli hizi na umuhimu wao katika michakato mbalimbali ya seli, hatua za ukuaji na hali ya ugonjwa, ikichangia uelewa wa kina wa ugumu wa udhibiti wa RNA katika muktadha wa usemi wa jeni.

Wasiliana nasi

Maelezo ya Huduma

Bioinformatics

Matokeo ya Onyesho

Machapisho Yanayoangaziwa

Vipengele

● Kupungua kwa rRNA ikifuatwa na utayarishaji wa maktaba ya mwelekeo, kuwezesha data ya mfuatano ambayo ni mahususi.

● Mtiririko wa kazi wa kibiolojia huwezesha ubashiri wa circRNA na ukadiriaji wa usemi

Faida za Huduma

●Maktaba za kina zaidi za RNA:tunatumia upungufu wa rRNA badala ya upungufu wa mstari wa RNA katika utayarishaji wetu wa awali wa maktaba, kuhakikisha kwamba data ya mfuatano inajumuisha si circRNA pekee bali pia mRNA na lncRNA, kuwezesha uchanganuzi wa pamoja kwenye hifadhidata hizi.

●Uchambuzi wa hiari wa mitandao shindani ya RNA (ceRNA).: kutoa maarifa ya kina katika mifumo ya udhibiti wa seli

●Utaalamu wa Kina: yenye rekodi ya usindikaji zaidi ya sampuli 20,000 kwenye BMK, inayojumuisha aina mbalimbali za sampuli na miradi ya lncRNA, timu yetu huleta uzoefu mwingi kwa kila mradi.

●Udhibiti Madhubuti wa Ubora: tunatekeleza vipengele vya udhibiti katika hatua zote, kuanzia sampuli na utayarishaji wa maktaba hadi upangaji na maelezo ya kibiolojia.Ufuatiliaji huu wa kina huhakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa juu kila wakati.

● Usaidizi wa Baada ya Mauzo: Ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha huduma cha miezi 3 baada ya kuuza.Katika wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi, na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.

Mahitaji ya Sampuli na Uwasilishaji

Maktaba	Jukwaa	Data iliyopendekezwa	Data QC
Poly A iliyoboreshwa	Illumina PE150	16-20 Gb	Q30≥85%

Mahitaji ya Sampuli:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Kiasi (μg)

Usafi

Uadilifu

≥ 100

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Uchafuzi wa protini au DNA umepunguzwa au haujaonyeshwa kwenye jeli.

Kwa mimea: RIN≥6.5;

Kwa wanyama: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

mwinuko mdogo au hakuna msingi

● Mimea:

Mizizi, shina au petal: 450 mg

Majani au Mbegu: 300 mg

Matunda: 1.2 g

● Mnyama:

Moyo au utumbo: 450 mg

Viscera au Ubongo: 240 mg

Misuli: 600 mg

Mifupa, Nywele au Ngozi: 1.5g

● Arthropoda:

Wadudu: 9g

Crustacea: 450 mg

● Damu nzima:2 mirija

● Seli: 10⁶seli

● Seramu na Plasma: 6 ml

Uwasilishaji wa Sampuli Uliopendekezwa

Chombo: 2 ml centrifuge tube (bati foil haifai)

Sampuli ya kuweka lebo: Kundi+ kunakili mfano A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Usafirishaji:

1. Barafu kavu: Sampuli zinahitaji kuingizwa kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.

2. Mirija ya RNAstable: Sampuli za RNA zinaweza kukaushwa kwenye mirija ya kusawazisha ya RNA (km RNAstable®) na kusafirishwa kwenye joto la kawaida.

Mtiririko wa Kazi ya Huduma

Muundo wa majaribio

Utoaji wa sampuli

Uchimbaji wa RNA

Ujenzi wa maktaba

Kufuatana

Uchambuzi wa data

Huduma za baada ya kuuza

Iliyotangulia: Mpangilio mzima wa maandishi - Illumina

Inayofuata: Mpangilio mdogo wa RNA-Illumina

Bioinformatics

utabiri wa circRNA: usambazaji wa kromosomu

CircRNA zilizoonyeshwa kwa njia tofauti - njama ya volkano

CircRNAs Zilizoonyeshwa kwa Tofauti - nguzo za daraja

Uboreshaji wa kiutendaji wa jeni mwenyeji wa circRNA

Chunguza maendeleo ya utafiti yanayowezeshwa na huduma za mpangilio wa BMKGene' circRNA kupitia mkusanyiko ulioratibiwa wa machapisho.

Wang, X. et al.(2021) 'CPSF4 inadhibiti uundaji wa circRNA na unyamazishaji wa jeni wa microRNA katika hepatocellular carcinoma', Oncogene 2021 40:25, 40(25), uk. 4338–4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.

Xia, K. et al.(2023) 'X oo-responsive transcriptome inaonyesha dhima ya RNA133 duara katika upinzani wa magonjwa kwa kudhibiti usemi wa OsARAB katika mchele', Phytopathology Research, 5(1), pp. 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.

Y, H. na wengine.(2023) 'CPSF3 hurekebisha usawa wa nakala za mduara na mstari katika saratani ya hepatocellular'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.

Zhang, Y. et al.(2023) 'Tathmini ya kina ya circRNAs katika ugonjwa wa moyo wa cirrhotic kabla na baada ya upandikizaji wa ini', Immunopharmacology ya Kimataifa, 114, p.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.