Mfuatano wa CircRNA-Illumina
Vipengele
● kupungua kwa rRNA ikifuatiwa na utayarishaji wa maktaba ya mwelekeo, kuwezesha data ya mpangilio maalum wa nyuzi.
● Mtiririko wa kazi wa kibiolojia huwezesha utabiri wa duara la RNA na upimaji wa usemi.
Faida za Huduma
●Utaalamu wa Kina: Tumechakata zaidi ya sampuli 20,000, zikijumuisha aina mbalimbali za sampuli, tunaleta utajiri wa utaalamu katika kila mradi.
●Udhibiti Mkali wa Ubora: Tunatekeleza vipengele vya udhibiti mkuu katika hatua zote, kuanzia utayarishaji wa sampuli hadi utayarishaji wa maktaba, mpangilio na bioinformatiki. Ufuatiliaji wetu wa kina unahakikisha utoaji wa matokeo ya ubora wa hali ya juu kila mara.
●Maktaba za RNA zenye Ujumla Zaidi:Tunatumia kupungua kwa rRNA badala ya kupungua kwa RNA ya mstari katika maandalizi yetu ya kabla ya maktaba, kuhakikisha kwamba data ya mfuatano inajumuisha si tu circRNA bali pia mRNA na lncRNA, kuwezesha uchanganuzi wa pamoja wa seti hizi za data.
●Uchambuzi wa Hiari wa Mitandao ya RNA Endogenous Competitive (ceRNA): Kutoa maarifa ya kina kuhusu mifumo ya udhibiti wa seli.
● Usaidizi wa Baada ya Mauzo: Tunaelewa umuhimu wa kuwepo, ndiyo maana ahadi yetu inaenea zaidi ya kukamilika kwa mradi kwa kipindi cha huduma cha miezi 3 baada ya mauzo. Wakati huu, tunatoa ufuatiliaji wa mradi, usaidizi wa utatuzi wa matatizo, na vipindi vya Maswali na Majibu ili kushughulikia maswali yoyote yanayohusiana na matokeo.
Mahitaji ya Sampuli na Uwasilishaji
| Maktaba | Jukwaa | Data iliyopendekezwa | QC ya Data |
| maktaba ya mwelekeo iliyopunguzwa na rRNA | Illumina PE150 | Gb 16-20 | Q30≥85% |
Mahitaji ya Mfano:
Nyukleotidi:
| Kikomo (ng/μl) | Kiasi (μg) | Usafi | Uadilifu |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Uchafuzi mdogo au hakuna protini au DNA unaoonyeshwa kwenye jeli. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; mwinuko mdogo au hakuna msingi |
● Mimea:
Mzizi, Shina au Petali: 450 mg
Jani au Mbegu: 300 mg
Matunda: 1.2 g
● Mnyama:
Moyo au Utumbo: 450 mg
Viscera au Ubongo: 240 mg
Misuli: 600 mg
Mifupa, Nywele au Ngozi: 1.5g
● Arthropodi:
Wadudu: 9g
Krustasia: 450 mg
● Damu nzima:Mirija 2
● Seli: 106 seli
● Seramu na Plasma: 6 mL
Uwasilishaji wa Sampuli Uliopendekezwa
Chombo: Mrija wa sentrifuge wa mililita 2 (Foili ya bati haipendekezwi)
Uwekaji lebo wa sampuli: Kundi+nakili k.m. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Usafirishaji:
1. Barafu kavu: Sampuli zinahitaji kupakiwa kwenye mifuko na kuzikwa kwenye barafu kavu.
2. Mirija ya RNAstable: Sampuli za RNA zinaweza kukaushwa kwenye mrija wa uthabiti wa RNA (km, RNAstable®) na kusafirishwa kwenye joto la kawaida.
Mtiririko wa Kazi ya Huduma
Ubunifu wa majaribio
Uwasilishaji wa sampuli
Uchimbaji wa RNA
Ujenzi wa maktaba
Mfuatano
Uchambuzi wa data
Huduma za baada ya mauzo
Bioinformatiki
- QC ya Data
- Mpangilio wa jenomu
- Utambuzi wa CircRNA
- Usemi wa CircRNA
- Uchambuzi wa usemi tofauti
Utabiri wa circumRNA: usambazaji wa kromosomu
Duru za RNA Zilizoonyeshwa Tofauti - Mchoro wa Volkano
Duru za RNA zilizoonyeshwa tofauti - mkusanyiko wa kihierarkia
Uboreshaji wa utendaji kazi wa jeni mwenyeji wa circRNA
Chunguza maendeleo ya utafiti yaliyowezeshwa na huduma za mpangilio wa circRNA za BMKGene kupitia mkusanyiko wa machapisho yaliyochaguliwa.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 inadhibiti uundaji wa circumRNA na kunyamazisha jeni linalosababishwa na microRNA katika saratani ya ini',Onkojeni2021 40:25, 40(25), uk. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'Transcriptome ya X-oo-reaction inaonyesha jukumu la RNA133 ya mviringo katika upinzani wa magonjwa kwa kudhibiti usemi wa OsARAB katika mchele',Utafiti wa Fitopatholojia, 5(1), uk. 1–14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/VIELELEZO/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 hurekebisha usawa wa nakala za mviringo na za mstari katika saratani ya ini'. doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Tathmini kamili ya circRNA katika ugonjwa wa moyo na mishipa kabla na baada ya kupandikizwa ini',Kinga ya Dawa ya Kimataifa, 114, uk. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
