Metagenomics (NGS)

Metagenomics ya bunduki ya risasi yenye Illumina ni zana maarufu ya kusoma microbiomes kwa kupanga DNA moja kwa moja kutoka kwa sampuli changamano, kuwezesha utafiti wa utofauti wa taksonomia na utendaji kazi. Bomba la metagenomics la BMKCloud (NGS) huanza na udhibiti wa ubora na mkusanyiko wa metagenomics, ambapo jeni hutabiriwa na kukusanywa katika seti za data zisizo na upungufu ambazo zimeorodheshwa kwa ajili ya utendaji kazi na taksonomia kwa kutumia hifadhidata nyingi. Taarifa hii hutumika kuchambua utofauti wa taksonomia ndani ya sampuli (utofauti wa alpha) na utofauti kati ya sampuli (utofauti wa beta). Uchambuzi tofauti kati ya vikundi hupata OTU na kazi za kibiolojia ambazo hutofautiana kati ya vikundi hivyo viwili kwa kutumia vipimo vya parametriki na visivyo vya parametriki, huku uchanganuzi wa uwiano ukihusisha tofauti hizi na mambo ya mazingira.