Ramani ya joto
Zana ya Heatmap hukubali faili ya data ya matrix kama ingizo na huruhusu watumiaji kuchuja, kurekebisha na kukusanya data. Matumizi ya msingi ya heatmaps ni uchanganuzi wa kundi la kiwango cha usemi wa jeni kati ya sampuli tofauti.
Maelezo ya Jeni
Zana ya Ufafanuzi wa Gene hufanya ufafanuzi wa jeni kulingana na mpangilio wa mfuatano wa faili za FASTA zinazoingizwa dhidi ya hifadhidata mbalimbali.
Zana ya Msingi ya Kutafuta Mpangilio wa Eneo (BLAST)
Zana ya BLAST ni toleo lililojumuishwa la BMKCloud la NCBI BLAST na linaweza kutumika kufanya kazi zile zile kwa kutumia data iliyopakiwa kwenye akaunti ya BMKCloud.
Utabiri wa CDS_UTR
Zana ya Utabiri wa CDS_UTR imeundwa kutabiri maeneo ya usimbaji (CDS) na maeneo yasiyo ya usimbaji (UTR) katika mfuatano wa nakala uliotolewa kulingana na matokeo ya BLAST dhidi ya hifadhidata zinazojulikana za protini na matokeo ya utabiri wa ORF.
Kiwanja cha Manhattan
Zana ya Manhattan Plot huwezesha maonyesho ya majaribio ya sampuli nyingi na hutumika sana katika masomo ya uhusiano wa jenomu nzima (GWAS).
Mchoro wa Circos
Zana ya Mchoro wa CIRCOS hutoa taswira bora ya jinsi kipengele cha jenomu kinavyosambazwa katika jenomu. Vipengele vya kawaida ni pamoja na loci ya kiasi, SNP, InDels, tofauti za kimuundo na nambari ya nakala.
Uboreshaji wa Ontolojia ya Jeni (GO)
Zana ya Uboreshaji wa GO hutoa uchanganuzi wa uboreshaji unaofanya kazi. Programu kuu katika zana hii ni kifurushi cha TopGO-Bioconductor, ambacho kinajumuisha uchanganuzi wa usemi tofauti, uchanganuzi wa uboreshaji wa GO na taswira ya matokeo.
Uchambuzi wa Mtandao wa Usemi wa Jini Uliopimwa (WGCNA)
WGCNA ni mbinu inayotumika sana ya uchimbaji data kwa ajili ya kugundua moduli za usemi-mshikamano wa jeni. Inatumika kwa seti mbalimbali za data za usemi ikiwa ni pamoja na data ya microarray na usemi wa jeni wa NGS.
InterProScan
Zana ya InterProScan hutoa uchanganuzi na uainishaji wa mfuatano wa protini ya InterPro.
Uboreshaji wa GO KEGG
Zana ya Uboreshaji wa GO KEGG ni muundo wa kutengeneza histogramu ya uboreshaji wa GO, histogramu ya uboreshaji wa KEGG na njia ya uboreshaji wa KEGG kulingana na seti ya jeni iliyotolewa na maelezo yanayolingana.
