mRNA-seq (NGS) yenye jenomu ya marejeleo
RNA-seq ni kifaa cha kawaida katika sayansi ya maisha na mazao, kinachoziba pengo kati ya jenomu na proteome. Nguvu yake iko katika kugundua nakala mpya na kupima usemi wao katika jaribio moja. Inatumika sana kwa tafiti za kulinganisha za transcriptomic, ikitoa mwanga juu ya jeni zinazohusiana na sifa au fenotipu mbalimbali, kama vile kulinganisha mutants na aina za porini au kufichua usemi wa jeni chini ya hali maalum. Programu ya BMKCloud mRNA(Reference) hujumuisha upimaji wa usemi, uchambuzi wa usemi tofauti (DEG), na uchambuzi wa muundo wa mfuatano katika bomba la bioinformatics la mRNA-seq(NGS) na huunganisha nguvu za programu sawa, kuhakikisha urahisi na urahisi wa mtumiaji. Watumiaji wanaweza kupakia data yao ya RNA-seq kwenye wingu, ambapo Programu hutoa suluhisho kamili la uchambuzi wa bioinformatiki la kituo kimoja. Zaidi ya hayo, inaweka kipaumbele uzoefu wa wateja, ikitoa shughuli za kibinafsi zilizoundwa kulingana na mahitaji maalum ya watumiaji. Watumiaji wanaweza kuweka vigezo na kuwasilisha dhamira ya bomba peke yao, kuangalia ripoti shirikishi, kutazama data/michoro na uchimbaji kamili wa data, kama vile: uteuzi wa jeni lengwa, mkusanyiko wa utendaji kazi, michoro, n.k.
Jukwaa:Illumina, MGI
Mkakati:Mfuatano wa RNA
Mpangilio: Imepunguzwa, data safi.
Aina ya maktaba:fr-unstrand, fr-firststrand au fr-secondstrand
Urefu wa kusoma:150 bp
Aina ya faili:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz au *.fq.gz. Mfumo utaunganisha kiotomatiki faili za .fastq kulingana na majina ya faili zao,mfano *_1.fastq imeunganishwa na *._2.fastq.
Idadi ya sampuli:Hakuna vikwazo kwa idadiya sampuli, lakini muda wa uchambuzi utaongezeka kadri idadi yasampuli hukua.
Kiasi cha Data Kilichopendekezwa:6G kwa kila sampuli
