●Mbinu ya Kutengwa na Kukuza Bila Kukuza kwa Uchanganuzi wa Jumuiya ya Microbial: Kuwezesha mpangilio wa nyenzo za kijeni kutoka kwa viumbe visivyoweza kupandwa.
●Azimio la Juu: Tambua spishi zenye wingi mdogo katika sampuli za mazingira.
●Uchambuzi wa kina wa Bioinformatics:Ililenga sio tu juu ya anuwai ya ushuru lakini pia juu ya anuwai ya utendaji ya jamii.
●Uzoefu wa Kina:Kwa rekodi ya mafanikio ya kufunga miradi mingi ya metagenomics katika vikoa mbalimbali vya utafiti na kuchakata zaidi ya sampuli 200,000, timu yetu huleta uzoefu mwingi kwa kila mradi.
Jukwaa la mpangilio | Mkakati wa Kuratibu | Data iliyopendekezwa | Udhibiti wa ubora |
Illumina NovaSeq au DNBSEQ-T7 | PE150 | 6-20Gb | Q30≥85% |
Kuzingatia (ng/µL) | Jumla ya kiasi (ng) | Kiasi (µL) |
≥1 | ≥30 | ≥20 |
● Udongo / matope: 2-3g
● Maudhui ya matumbo-mnyama: 0.5-2g
● Yaliyomo kwenye matumbo-mdudu: 0.1-0.25g
● Uso wa mmea (sediment iliyoboreshwa): 0.5-1g
● Mchuzi wa Fermentation uliboresha sediment): 0.2-0.5g
● Kinyesi (wanyama wakubwa): 0.5-2g
● Kinyesi (panya): 3-5grains
● Kiowevu cha kuosha tundu la mapafu: karatasi ya chujio
● Utambazaji wa uke: usufi 5-6
● Kitambaa cha ngozi/kiungo/mate/kitambaa laini mdomoni/ufio wa koromeo/usufi wa rektamu: usufi 2-3
● Vijiumbe vya uso: swabs 5-6
● Maji/hewa/biofilm: karatasi ya chujio
● Endophytes: 2-3g
● Meno Plaque: 0.5-1g
Inajumuisha uchambuzi ufuatao:
● Kupanga udhibiti wa ubora wa data
● Mkusanyiko wa Metajenomu na utabiri wa jeni
● Dokezo la jeni
● Uchanganuzi wa uanuwai wa alfa wa Kitaxonomic
● Uchambuzi wa kiutendaji wa jumuiya: kazi ya kibiolojia, kimetaboliki, upinzani wa antibiotic
● Uchambuzi wa uanuwai wa kiutendaji na wa taksonomia:
Uchambuzi wa anuwai ya Beta
Uchambuzi wa vikundi
Uchambuzi wa uhusiano: kati ya mambo ya mazingira na muundo wa OUT na utofauti
Uchambuzi wa kiutendaji: Upinzani wa antibiotiki wa KADI
Uchambuzi tofauti wa njia za kimetaboliki za KEGG: ramani ya joto ya njia muhimu
Utofauti wa alfa wa usambazaji wa taxonomic: index ya ACE
Utofauti wa Beta wa usambazaji wa taxonomic: PCoA
Gundua maendeleo yanayowezeshwa na huduma za mpangilio wa metagenome za BMKGene na Illumina kupitia mkusanyiko ulioratibiwa wa machapisho.
Hai, Q. et al. (2023) 'Uchambuzi wa kimetajeni na kimetaboliki wa mabadiliko katika yaliyomo kwenye matumbo ya trout ya upinde wa mvua (Oncorhynchus mykiss) iliyoambukizwa na virusi vya hematopoietic necrosis katika viwango tofauti vya joto vya maji',Mipaka katika Microbiology, 14, uk. 1275649. doi: 10.3389/FMICB.2023.1275649.
Mao, C. et al. (2023) 'Jumuiya ndogo, jeni sugu, na hatari za kupinga katika maziwa ya mijini ya majimbo tofauti ya trophic: Viungo vya ndani na mvuto wa nje',Jarida la Maendeleo ya Nyenzo Hatari, 9, uk. 100233. doi: 10.1016/J.HAZADV.2023.100233.
Su, M. et al. (2022) 'Uchambuzi wa Metagenomic Umefichua Tofauti za Muundo na Utendaji Kati ya Vijiumbe Vinavyohusishwa na Kioevu na Imara-Vinavyohusishwa vya Rumen ya Kondoo',Mipaka katika Microbiology, 13, uk. 851567. doi: 10.3389/FMICB.2022.851567.
Yin, J. na wengine. (2023) 'Mikrobiota inayotokana na nguruwe ya Ningxiang inarejesha kimetaboliki ya carnitine ili kukuza uwekaji wa asidi ya mafuta ya misuli katika nguruwe wa DLY waliokonda',Ubunifu, 4(5), uk. 100486. doi: 10.1016/J.XINN.2023.100486.
Zhao, X. et al. (2023) 'Maarifa ya kitabia kuhusu hatari zinazoweza kutokea za uwakilishi wa bio/plastiki isiyoharibika na uchafu usio wa plastiki katika sehemu za juu na chini za Haihe Estuary, Uchina',Sayansi ya Mazingira Jumla, 887, uk. 164026. doi: 10.1016/J.SCITOTENV.2023.164026.