-
જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન વિશ્લેષણ
જીનોમ-વાઇડ એસોસિએશન સ્ટડી (જીડબ્લ્યુએએસ) નો હેતુ આનુવંશિક પ્રકારો (જીનોટાઇપ) ને ઓળખવાનો છે જે વિશિષ્ટ લક્ષણો (ફીનોટાઇપ) સાથે સંકળાયેલ છે.GWAS અભ્યાસ આનુવંશિક માર્કર્સની તપાસ કરે છે જે મોટી સંખ્યામાં વ્યક્તિઓના સમગ્ર જીનોમને પાર કરે છે અને વસ્તીના સ્તરે આંકડાકીય વિશ્લેષણ દ્વારા જીનોટાઇપ-ફેનોટાઇપ એસોસિએશનની આગાહી કરે છે.માનવીય રોગો અને પ્રાણીઓ અથવા છોડના જટિલ લક્ષણો પર કાર્યાત્મક જનીન ખાણકામ પરના સંશોધનમાં તેનો વ્યાપકપણે ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે.
-
સિંગલ- ન્યુક્લિયસ આરએનએ સિક્વન્સિંગ
સિંગલ સેલ કેપ્ચરિંગ અને વ્યક્તિગત લાઇબ્રેરી કન્સ્ટ્રક્શન ટેકનિકમાં એડવાન્સ હાઇ-થ્રુપુટ સિક્વન્સિંગ સાથે કોષ-દર-કોષના આધારે જનીન અભિવ્યક્તિ અભ્યાસને મંજૂરી આપે છે.તે જટિલ કોષોની વસ્તી પર ઊંડા અને સંપૂર્ણ સિસ્ટમ પૃથ્થકરણને સક્ષમ કરે છે, જેમાં તે મોટાભાગે તમામ કોષોની સરેરાશ લઈને તેમની વિજાતીયતાને ઢાંકવાનું ટાળે છે.
જો કે, કેટલાક કોષો સિંગલ-સેલ સસ્પેન્શન બનાવવા માટે યોગ્ય નથી, તેથી અન્ય નમૂના તૈયાર કરવાની પદ્ધતિઓ - પેશીઓમાંથી ન્યુક્લિયસ નિષ્કર્ષણની જરૂર છે, એટલે કે, ન્યુક્લિયસને પેશીઓ અથવા કોષમાંથી સીધું કાઢવામાં આવે છે અને સિંગલ-ન્યુક્લિયસ સસ્પેન્શનમાં તૈયાર કરવામાં આવે છે. સેલ સિક્વન્સિંગ.
BMK 10× જીનોમિક્સ ક્રોમિયમટીએમ આધારિત સિંગલ-સેલ આરએનએ સિક્વન્સિંગ સેવા પ્રદાન કરે છે.આ સેવાનો વ્યાપકપણે રોગ સંબંધિત અભ્યાસો, જેમ કે રોગપ્રતિકારક કોષોના વિભેદકતા, ગાંઠની વિષમતા, પેશીઓનો વિકાસ વગેરે પરના અભ્યાસમાં ઉપયોગ કરવામાં આવ્યો છે.
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ચિપ: 10× જીનોમિક્સ
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq 6000
-
છોડ/પ્રાણી સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ
સંપૂર્ણ જિનોમ રિ-સિક્વન્સિંગ, જેને WGS તરીકે પણ ઓળખવામાં આવે છે, સિંગલ ન્યુક્લિયોટાઇડ પોલીમોર્ફિઝમ (SNP), ઇન્સર્શન ડિલીશન (InDel), સ્ટ્રક્ચર વેરિએશન (SV), અને કોપી નંબર વેરિએશન (CNV) સહિત સમગ્ર જિનોમ પર સામાન્ય અને દુર્લભ બંને મ્યુટેશનને જાહેર કરવામાં સક્ષમ બનાવે છે. ).SVs એ SNPs કરતા ભિન્નતાના આધારનો મોટો હિસ્સો બનાવે છે અને જિનોમ પર વધુ અસર કરે છે, જે જીવંત સજીવો પર નોંધપાત્ર અસર કરે છે.લાંબા-વાંચન રિક્વન્સિંગ મોટા ટુકડાઓ અને જટિલ ભિન્નતાઓની વધુ ચોક્કસ ઓળખ માટે પરવાનગી આપે છે કારણ કે લાંબા વાંચન જટિલ પ્રદેશો જેમ કે ટેન્ડમ રિપીટ્સ, GC/AT-સમૃદ્ધ પ્રદેશો અને હાયપર-વેરિયેબલ પ્રદેશો પર રંગસૂત્રને પાર કરવાનું વધુ સરળ બનાવે છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ
કોષોનું અવકાશી સંગઠન વિવિધ જૈવિક પ્રક્રિયાઓમાં મહત્વપૂર્ણ ભૂમિકા ભજવે છે, જેમ કે રોગપ્રતિકારક ઘૂસણખોરી, ગર્ભ વિકાસ, વગેરે. અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ, જે અવકાશી સ્થિતિની માહિતી જાળવી રાખતી વખતે જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલિંગ સૂચવે છે, તે ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ-સ્તરની પેશી આર્કિટેક્ચરમાં મહાન આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે.ટેક્નોલોજીના વિકાસ સાથે, અલ્ટ્રા-ક્લિયર ટીશ્યુ મોર્ફોલોજી અને અવકાશી પરમાણુ અભિવ્યક્તિના વાસ્તવિક માળખાકીય તફાવતનો ઉચ્ચ રિઝોલ્યુશન સાથે અભ્યાસ કરવાની જરૂર છે.BMKGENE નમૂનાઓથી લઈને જૈવિક આંતરદૃષ્ટિ સુધી વ્યાપક, વન-સ્ટોપ અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ સેવા પ્રદાન કરે છે.
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ ટેક્નોલોજીઓએ વિજાતીય નમૂનાઓમાં અવકાશી સામગ્રી સાથે જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલને ઉકેલીને વિવિધ સંશોધન ક્ષેત્રમાં નવલકથા પરિપ્રેક્ષ્યને સશક્ત બનાવ્યું છે.
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ચિપ: BMKMANU S1000
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq 6000
-
10x જીનોમિક્સ વિઝિયમ સ્પેશિયલ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ
વિઝિયમ સ્પેશિયલ જીન એક્સપ્રેશન એ કુલ એમઆરએનએ પર આધારિત પેશીને વર્ગીકૃત કરવા માટે મુખ્ય પ્રવાહની અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ ટેકનોલોજી છે.સામાન્ય વિકાસ, રોગ પેથોલોજી અને ક્લિનિકલ ટ્રાન્સલેશનલ રિસર્ચમાં નવલકથા આંતરદૃષ્ટિ શોધવા માટે મોર્ફોલોજિકલ સંદર્ભ સાથે સમગ્ર ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમનો નકશો બનાવો.BMKGENE નમૂનાઓથી લઈને જૈવિક આંતરદૃષ્ટિ સુધી વ્યાપક, વન-સ્ટોપ અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ સેવા પ્રદાન કરે છે.
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ તકનીકોએ વિજાતીય નમૂનાઓમાં અવકાશી સામગ્રી સાથે જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલને ઉકેલીને વિવિધ સંશોધન ક્ષેત્રમાં નવલકથા પરિપ્રેક્ષ્યને સશક્ત બનાવ્યું.
અવકાશી ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ચિપ: 10x જીનોમિક્સ વિઝિયમ
પ્લેટફોર્મ:ઇલુમિના નોવાસેક 6000
-
પૂર્ણ-લંબાઈ mRNA સિક્વન્સિંગ-નેનોપોર
વ્યાપક ટ્રાન્સક્રિપ્ટમ વિશ્લેષણ માટે આરએનએ સિક્વન્સિંગ એક અમૂલ્ય સાધન છે.નિઃશંકપણે, પરંપરાગત ટૂંકા-વાંચન અનુક્રમે અહીં અસંખ્ય મહત્વપૂર્ણ વિકાસ પ્રાપ્ત કર્યો છે.તેમ છતાં, તે ઘણીવાર પૂર્ણ-લંબાઈના આઇસોફોર્મ ઓળખ, પ્રમાણીકરણ, પીસીઆર પૂર્વગ્રહમાં મર્યાદાઓનો સામનો કરે છે.
નેનોપોર સિક્વન્સિંગ પોતાને અન્ય સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ્સથી અલગ પાડે છે, જેમાં ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ ડીએનએ સંશ્લેષણ વિના સીધા વાંચવામાં આવે છે અને દસ કિલોબેઝ પર લાંબું વાંચન પેદા કરે છે.આ સંપૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટ્સને પાર કરીને ડાયરેક્ટ રીડ-આઉટ અને આઇસોફોર્મ-સ્તરના અભ્યાસમાં પડકારોનો સામનો કરવા સક્ષમ બનાવે છે.
પ્લેટફોર્મ:નેનોપોર પ્રોમેથિયન
પુસ્તકાલય:cDNA-PCR
-
પૂર્ણ-લંબાઈની mRNA સિક્વન્સિંગ -PacBio
ડી નોવોપૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ તરીકે પણ ઓળખાય છેડી નોવોIso-Seq વાંચન લંબાઈમાં PacBio સિક્વન્સરનો લાભ લે છે, જે કોઈપણ વિરામ વિના પૂર્ણ-લંબાઈના cDNA પરમાણુઓના અનુક્રમને સક્ષમ કરે છે.આ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ એસેમ્બલી સ્ટેપ્સમાં જનરેટ થતી કોઈપણ ભૂલોને સંપૂર્ણપણે ટાળે છે અને આઇસોફોર્મ-લેવલ રિઝોલ્યુશન સાથે યુનિજીન સેટ બનાવે છે.આ યુનિજીન સેટ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સ્તરે "સંદર્ભ જીનોમ" તરીકે શક્તિશાળી આનુવંશિક માહિતી પ્રદાન કરે છે.વધુમાં, નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વન્સિંગ ડેટા સાથે જોડીને, આ સેવા આઇસોફોર્મ-સ્તરની અભિવ્યક્તિના ચોક્કસ પ્રમાણીકરણને સશક્ત બનાવે છે.
પ્લેટફોર્મ: PacBio સિક્વલ IIલાઇબ્રેરી: SMRT બેલ લાઇબ્રેરી -
યુકેરીયોટિક mRNA સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
mRNA સિક્વન્સિંગ ચોક્કસ પરિસ્થિતિઓ હેઠળ કોષોમાંથી ટ્રાન્સક્રિપ્ટ થયેલ તમામ mRNA ની પ્રોફાઇલિંગને સક્ષમ કરે છે.તે જનીન અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ, જનીન રચનાઓ અને ચોક્કસ જૈવિક પ્રક્રિયાઓની મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સ જાહેર કરવા માટે એક શક્તિશાળી તકનીક છે.આજની તારીખે, mRNA સિક્વન્સિંગ મૂળભૂત સંશોધન, ક્લિનિકલ ડાયગ્નોસ્ટિક્સ, ડ્રગ ડેવલપમેન્ટ વગેરેમાં વ્યાપકપણે કાર્યરત છે.
પ્લેટફોર્મ: Illumina NovaSeq 6000
-
બિન-સંદર્ભ આધારિત mRNA સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
એમઆરએનએ સિક્વન્સિંગ ચોક્કસ સમયગાળામાં મેસેન્જર આરએનએ(એમઆરએનએ) ફોર્મ યુકેરીયોટને કેપ્ચર કરવા માટે નેક્સ્ટ જનરેશન સિક્વન્સિંગ ટેકનિક (એનજીએસ) અપનાવે છે જ્યારે કેટલાક વિશેષ કાર્યો સક્રિય થઈ રહ્યા છે.સૌથી લાંબી ટ્રાંસ્ક્રિપ્ટને 'યુનિજીન' કહેવામાં આવતું હતું અને અનુગામી પૃથ્થકરણ માટે સંદર્ભ ક્રમ તરીકે ઉપયોગમાં લેવાય છે, જે સંદર્ભ વિના પ્રજાતિના મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ અને નિયમનકારી નેટવર્કનો અભ્યાસ કરવાનું અસરકારક માધ્યમ છે.
ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ ડેટા એસેમ્બલી અને યુનિજીન ફંક્શનલ એનોટેશન પછી
(1) SSR વિશ્લેષણ, CDS અનુમાન અને જનીન માળખું પ્રીફોર્મ કરવામાં આવશે.
(2) દરેક નમૂનામાં યુનિજીન અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણીકરણ કરવામાં આવશે.
(3)યુનિજીન અભિવ્યક્તિના આધારે નમૂનાઓ (અથવા જૂથો) વચ્ચે વિભેદક રીતે વ્યક્ત કરાયેલ યુનિજીન શોધવામાં આવશે.
(4) વિભિન્ન રીતે વ્યક્ત યુનિજીન્સનું ક્લસ્ટરીંગ, કાર્યાત્મક ટીકા અને સંવર્ધન વિશ્લેષણ કરવામાં આવશે.
-
લાંબી નોન-કોડિંગ સિક્વન્સિંગ-ઇલ્યુમિના
લાંબા નોન-કોડિંગ RNAs (lncRNAs) એ 200 nt થી વધુ લંબાઈ ધરાવતા RNA અણુઓનો એક પ્રકાર છે, જે અત્યંત ઓછી કોડિંગ સંભવિતતા દ્વારા વર્ગીકૃત થયેલ છે.LncRNA, નોન-કોડિંગ RNAsમાં મુખ્ય સભ્ય તરીકે, મુખ્યત્વે ન્યુક્લિયસ અને પ્લાઝ્મામાં જોવા મળે છે.સિક્વન્સિંગ ટેક્નોલોજી અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સનો વિકાસ અસંખ્ય નવલકથા એલએનસીઆરએનએની ઓળખને સક્ષમ કરે છે અને તેને જૈવિક કાર્યો સાથે સાંકળે છે.સંચિત પુરાવા સૂચવે છે કે lncRNA એપિજેનેટિક નિયમન, ટ્રાન્સક્રિપ્શન નિયમન અને પોસ્ટ-ટ્રાન્સક્રિપ્શન નિયમનમાં વ્યાપકપણે સામેલ છે.
