પૂર્ણ-લંબાઈનું mRNA સિક્વન્સિંગ -PacBio
સુવિધાઓ
● પોલી-એ mRNA માંથી cDNA સંશ્લેષણ અને ત્યારબાદ લાઇબ્રેરી તૈયારી
● CCS મોડમાં સિક્વન્સિંગ, HiFi રીડ જનરેટ કરવું
● પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટનો ક્રમ
● વિશ્લેષણ માટે સંદર્ભ જીનોમની જરૂર નથી; જોકે, તેનો ઉપયોગ કરી શકાય છે
● બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સ આઇસોફોર્મ lncRNA, જનીન ફ્યુઝન, પોલી-એડેનિલેશન અને જનીન માળખાનું વિશ્લેષણ સક્ષમ બનાવે છે.
સેવાના ફાયદા
●ઉચ્ચ ચોકસાઈ: હાઇફાઇ વાંચન 99.9% (Q30) થી વધુ ચોકસાઈ સાથે, NGS સાથે તુલનાત્મક
● વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વિશ્લેષણ: સમગ્ર ટ્રાન્સક્રિપ્ટનું ક્રમ આઇસોફોર્મ ઓળખ અને લાક્ષણિકતાને સક્ષમ કરે છે
●વ્યાપક કુશળતા: 1100 થી વધુ PacBio પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રોજેક્ટ્સ પૂર્ણ કરવાનો અને 2300 થી વધુ નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરવાનો ટ્રેક રેકોર્ડ ધરાવતી, અમારી ટીમ દરેક પ્રોજેક્ટમાં અનુભવનો ભંડાર લાવે છે.
●વેચાણ પછીનો સપોર્ટ: અમારી પ્રતિબદ્ધતા પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી પણ 3 મહિનાની વેચાણ પછીની સેવા સમયગાળા સાથે વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામો સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોના જવાબ આપવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો પ્રદાન કરીએ છીએ.
નમૂનાની આવશ્યકતાઓ અને ડિલિવરી
| પુસ્તકાલય | ક્રમ વ્યૂહરચના | ભલામણ કરેલ ડેટા | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| પોલીએ સમૃદ્ધ mRNA CCS લાઇબ્રેરી | પેકબાયો સિક્વલ II પેકબાયો રેવિયો | ૨૦/૪૦ જીબી ૫/૧૦ મીટર સીસીએસ | Q30≥85% |
નમૂના આવશ્યકતાઓ:
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
● છોડ:
મૂળ, થડ અથવા પાંખડી: 450 મિલિગ્રામ
પાન અથવા બીજ: ૩૦૦ મિલિગ્રામ
ફળ: ૧.૨ ગ્રામ
● પ્રાણી:
હૃદય અથવા આંતરડા: 300 મિલિગ્રામ
વિસેરા અથવા મગજ: 240 મિલિગ્રામ
સ્નાયુ: 450 મિલિગ્રામ
હાડકાં, વાળ અથવા ત્વચા: ૧ ગ્રામ
● આર્થ્રોપોડ્સ:
જંતુઓ: 6 ગ્રામ
ક્રસ્ટેસીયા: 300 મિલિગ્રામ
● આખું લોહી: ૧ ટ્યુબ
● કોષો: 106 કોષો
| સંક્ષિપ્ત (ng/μl) | રકમ (μg) | શુદ્ધતા | પ્રામાણિકતા |
| ≥ ૧૦૦ | ≥ ૧.૦ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 જેલ પર મર્યાદિત અથવા કોઈ પ્રોટીન અથવા ડીએનએ દૂષણ દર્શાવવામાં આવ્યું નથી. | છોડ માટે: RIN≥7.5; પ્રાણીઓ માટે: RIN≥8.0; ૫.૦≥ ૨૮સે/૧૮સે≥૧.૦; મર્યાદિત અથવા કોઈ બેઝલાઇન ઊંચાઈ નહીં |
ભલામણ કરેલ નમૂના વિતરણ
કન્ટેનર: 2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (ટીન ફોઇલની ભલામણ કરવામાં આવતી નથી)
નમૂના લેબલિંગ: જૂથ+પ્રતિકૃતિ દા.ત. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
શિપમેન્ટ:
૧. સૂકો બરફ: નમૂનાઓને બેગમાં પેક કરીને સૂકો બરફમાં દાટી દેવા જોઈએ.
2. RNAstable ટ્યુબ: RNA નમૂનાઓને RNA સ્ટેબિલાઇઝેશન ટ્યુબ (દા.ત. RNAstable®) માં સૂકવી શકાય છે અને ઓરડાના તાપમાને મોકલી શકાય છે.
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
આરએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
● કાચો ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ
● વૈકલ્પિક પોલિએડેનિલેશન વિશ્લેષણ (APA)
● ફ્યુઝન ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વિશ્લેષણ
● વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વિશ્લેષણ
● યુનિવર્સલ સિંગલ-કોપી ઓર્થોલોગ્સ (BUSCO) વિશ્લેષણનું બેન્ચમાર્કિંગ
● નવલકથા ટ્રાન્સક્રિપ્ટ વિશ્લેષણ: કોડિંગ સિક્વન્સ (CDS) અને કાર્યાત્મક એનોટેશનની આગાહી
● lncRNA વિશ્લેષણ: lncRNA અને લક્ષ્યોનું અનુમાન
● માઇક્રોસેટેલાઇટ ઓળખ (SSR)
બુસ્કો વિશ્લેષણ
વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વિશ્લેષણ
વૈકલ્પિક પોલિએડેનિલેશન વિશ્લેષણ (APA)
નવલકથા ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સની કાર્યાત્મક ટીકા
આ ફીચર્ડ પ્રકાશનમાં BMKGene ની નેનોપોર પૂર્ણ-લંબાઈની mRNA સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા કરવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
મા, વાય. એટ અલ. (2023) 'નેમોપિલેમા નોમુરાઈ ઝેર ઓળખ માટે પેકબાયો અને ઓએનટી આરએનએ સિક્વન્સિંગ પદ્ધતિઓનું તુલનાત્મક વિશ્લેષણ', જીનોમિક્સ, 115(6), પૃષ્ઠ 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
ચાઓ, ક્યૂ. એટ અલ. (2019) 'પોપ્યુલસ સ્ટેમ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમની વિકાસલક્ષી ગતિશીલતા', પ્લાન્ટ બાયોટેકનોલોજી જર્નલ, 17(1), પૃષ્ઠ 206–219. doi: 10.1111/PBI.12958.
ડેંગ, એચ. એટ અલ. (2022) 'ફળ વિકાસ અને એક્ટિનીડિયા લેટીફોલિયા (એસ્કોર્બેટ-સમૃદ્ધ ફળ પાક) ના પાક દરમિયાન એસ્કોર્બિક એસિડ સામગ્રીમાં ગતિશીલ ફેરફારો અને સંકળાયેલ મોલેક્યુલર મિકેનિઝમ્સ', ઇન્ટરનેશનલ જર્નલ ઓફ મોલેક્યુલર સાયન્સિસ, 23(10), પૃષ્ઠ 5808. doi: 10.3390/IJMS23105808/S1.
હુઆ, એક્સ. એટ અલ. (2022) 'પેરિસ પોલીફિલામાં બાયોએક્ટિવ પોલીફિલિનમાં સામેલ બાયોસિન્થેટિક પાથવે જનીનોની અસરકારક આગાહી', કોમ્યુનિકેશન્સ બાયોલોજી 2022 5:1, 5(1), પૃષ્ઠ 1–10. doi: 10.1038/s42003-022-03000-z.
લિયુ, એમ. એટ અલ. (2023) 'ટુટા એબ્સોલ્યુટા (મેરિક) ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ અને સાયટોક્રોમ P450 જનીનોનું સંયુક્ત પેકબાયો આઇસો-સેક અને ઇલુમિના આરએનએ-સેક વિશ્લેષણ', ઇન્સેક્ટ્સ, 14(4), પૃષ્ઠ 363. doi: 10.3390/INSECTS14040363/S1.
વાંગ, લિજુન એટ અલ. (2019) 'રિકિનસ કોમ્યુનિસમાં રિસિનોલિક એસિડ બાયોસિન્થેસિસની વધુ સારી સમજ માટે ઇલુમિના આરએનએ સિક્વન્સિંગ સાથે સંયુક્ત પેકબાયો સિંગલ-મોલેક્યુલ રીઅલ-ટાઇમ વિશ્લેષણનો ઉપયોગ કરીને ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ જટિલતાનો સર્વે', બીએમસી જીનોમિક્સ, 20(1), પૃષ્ઠ 1–17. doi: 10.1186/S12864-019-5832-9.
