ઉત્ક્રાંતિ જિનેટિક્સ
સેવા લાભો
તાકાગી એટ અલ.,પ્લાન્ટ જર્નલ, 2013
●વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટીક વિશ્લેષણ:આનુવંશિક વિવિધતાના અંદાજને સક્ષમ બનાવવું, જે પ્રજાતિઓની ઉત્ક્રાંતિની સંભાવનાને પ્રતિબિંબિત કરે છે, અને કન્વર્જન્ટ ઇવોલ્યુશન અને સમાંતર ઉત્ક્રાંતિના ન્યૂનતમ પ્રભાવ સાથે પ્રજાતિઓ વચ્ચેના વિશ્વસનીય ફાયલોજેનેટિક સંબંધને છતી કરે છે.
●વૈકલ્પિક કસ્ટમાઇઝ વિશ્લેષણ: જેમ કે ન્યુક્લિયોટાઇડ અને એમિનો એસિડના સ્તરે વિવિધતાના આધારે વિચલન સમય અને ગતિનો અંદાજ.
●વ્યાપક નિપુણતા અને પ્રકાશન રેકોર્ડ: BMKGene હજારો પ્રજાતિઓ વગેરેને આવરી લેતા 15 વર્ષથી વધુ સમય માટે વસ્તી અને ઉત્ક્રાંતિ જિનેટિક્સ પ્રોજેક્ટ્સમાં વિશાળ અનુભવ સંચિત કર્યો છે અને નેચર કોમ્યુનિકેશન્સ, મોલેક્યુલર પ્લાન્ટ્સ, પ્લાન્ટ બાયોટેકનોલોજી જર્નલ, વગેરેમાં પ્રકાશિત 1000 થી વધુ ઉચ્ચ-સ્તરના પ્રોજેક્ટ્સમાં યોગદાન આપ્યું છે.
● અત્યંત કુશળ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ ટીમ અને ટૂંકા વિશ્લેષણ ચક્ર: અદ્યતન જીનોમિક્સ વિશ્લેષણમાં મહાન અનુભવ સાથે, BMKGene ની ટીમ ઝડપી ટર્નઅરાઉન્ડ સમય સાથે વ્યાપક વિશ્લેષણો પહોંચાડે છે.
● પોસ્ટ-સેલ્સ સપોર્ટ:અમારી પ્રતિબદ્ધતા 3-મહિનાના વેચાણ પછીની સેવા અવધિ સાથે પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામોથી સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોને સંબોધવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો ઓફર કરીએ છીએ.
સેવા સ્પષ્ટીકરણો અને જરૂરિયાતો
| સિક્વન્સિંગનો પ્રકાર | ભલામણ કરેલ વસ્તી સ્કેલ | સિક્વન્સિંગ વ્યૂહરચના | ન્યુક્લિયોટાઇડ આવશ્યકતાઓ |
| સંપૂર્ણ જીનોમ સિક્વન્સિંગ | ≥ 30 વ્યક્તિઓ, દરેક પેટાજૂથમાંથી ≥ 10 વ્યક્તિઓ સાથે
| 10x | સાંદ્રતા: ≥ 1 ng/ µL કુલ રકમ≥ 30ng મર્યાદિત અથવા કોઈ અધોગતિ અથવા દૂષણ |
| સ્પેસિફિક-લોકસ એમ્પ્લીફાઇડ ફ્રેગમેન્ટ (SLAF) | ટેગ ઊંડાઈ: 10x ટૅગ્સની સંખ્યા: <400 Mb: WGS ની ભલામણ કરવામાં આવે છે <1Gb: 100K ટૅગ્સ 1 જીબી >2Gb: 300K ટૅગ્સ મહત્તમ 500k ટૅગ્સ | સાંદ્રતા ≥ 5 ng/µL કુલ રકમ ≥ 80 એનજી નેનોડ્રોપ OD260/280=1.6-2.5 એગેરોઝ જેલ: ના અથવા મર્યાદિત અધોગતિ અથવા દૂષણ
|
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
સિક્વન્સિંગ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
સેવામાં વસ્તી માળખું (ફાયલોજેનેટિક ટ્રી, પીસીએ, વસ્તી સ્તરીકરણ ચાર્ટ), વસ્તીની વિવિધતા અને વસ્તી પસંદગી (લિંકેજ અસંતુલન, ફાયદાકારક સાઇટ્સની પસંદગીયુક્ત સ્વીપ-સિલેકશન)નો સમાવેશ થાય છે. સેવામાં કસ્ટમાઇઝ્ડ પૃથ્થકરણ (દા.ત. વિચલનનો સમય, જનીન પ્રવાહ)નો પણ સમાવેશ કરી શકાય છે.
*અહીં દર્શાવેલ ડેમો પરિણામો બધા BMKGENE સાથે પ્રકાશિત થયેલ જીનોમમાંથી છે
1. ઉત્ક્રાંતિ વિશ્લેષણમાં આનુવંશિક ભિન્નતાના આધારે ફાયલોજેનેટિક વૃક્ષ, વસ્તી માળખું અને પીસીએનું નિર્માણ શામેલ છે.
ફાયલોજેનેટિક વૃક્ષ સામાન્ય પૂર્વજ સાથેની પ્રજાતિઓ વચ્ચે વર્ગીકરણ અને ઉત્ક્રાંતિ સંબંધોનું પ્રતિનિધિત્વ કરે છે.
PCA નો ઉદ્દેશ પેટા-વસ્તી વચ્ચેની નિકટતાની કલ્પના કરવાનો છે.
વસ્તી માળખું એલીલ ફ્રીક્વન્સીઝના સંદર્ભમાં આનુવંશિક રીતે અલગ પેટા-વસ્તીની હાજરી દર્શાવે છે.
ચેન, એટ. અલ.,PNAS, 2020
2.પસંદગીયુક્ત સ્વીપ
પસંદગીયુક્ત સ્વીપ એ એવી પ્રક્રિયાનો ઉલ્લેખ કરે છે કે જેના દ્વારા ફાયદાકારક સાઇટ પસંદ કરવામાં આવે છે અને લિંક કરેલી તટસ્થ સાઇટ્સની ફ્રીક્વન્સીઝ વધે છે અને અનલિંક કરેલી સાઇટ્સની આવર્તન ઘટે છે, પરિણામે પ્રાદેશિક ઘટાડો થાય છે.
પસંદગીના સ્વીપ પ્રદેશો પર જિનોમ-વ્યાપી શોધની પ્રક્રિયા ચોક્કસ પગલા (10 Kb) પર સ્લાઇડિંગ વિન્ડો (100 Kb) ની અંદર તમામ SNP ના વસ્તી આનુવંશિક અનુક્રમણિકા (π，Fst, Tajima's D) ની ગણતરી કરીને પ્રક્રિયા કરવામાં આવે છે.
ન્યુક્લિયોટાઇડ વિવિધતા (π)
તાજીમાના ડી
ફિક્સેશન ઇન્ડેક્સ(Fst)
વુ, એટ. અલ.,મોલેક્યુલર પ્લાન્ટ, 2018
3.જીન ફ્લો
વુ, એટ. અલ.,મોલેક્યુલર પ્લાન્ટ, 2018
4. વસ્તી વિષયક ઇતિહાસ
ઝાંગ, એટ. અલ.,નેચર ઇકોલોજી એન્ડ ઇવોલ્યુશન, 2021
5.વિચલન સમય
ઝાંગ, એટ. અલ.,નેચર ઇકોલોજી એન્ડ ઇવોલ્યુશન, 2021
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની ઉત્ક્રાંતિ આનુવંશિક સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલ પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો:
હસન્યાર, એકે એટ અલ. (2023) 'સમગ્ર-જીનોમ રિક્વેન્સિંગ દ્વારા એપીસ સેરાના સેરાના લાર્વામાં સેકબ્રૂડ વાયરસ રેઝિસ્ટન્સ સાથે સંકળાયેલ SNP મોલેક્યુલર માર્કર્સ અને કેન્ડિડેટ જીન્સની શોધ',મોલેક્યુલર સાયન્સનું ઇન્ટરનેશનલ જર્નલ, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
ચાઇ, જે. એટ અલ. (2022) 'જંગલીની શોધ, આનુવંશિક રીતે શુદ્ધ ચાઇનીઝ જાયન્ટ સૅલમેન્ડર નવી સંરક્ષણ તકો બનાવે છે',પ્રાણીશાસ્ત્રીય સંશોધન, 2022, વોલ્યુમ. 43, અંક 3, પૃષ્ઠો: 469-480, 43(3), પૃષ્ઠ 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
હાન, એમ. એટ અલ. (2022) 'ફિલોજિયોગ્રાફિકલ પેટર્ન એન્ડ પોપ્યુલેશન ઈવોલ્યુશન હિસ્ટ્રી ઓફ ઈન્ડિજિનસ એલિમસ સિબિરિકસ એલ. ઓન ક્વિંઘાઈ-તિબેટીયન પ્લેટુ',પ્લાન્ટ સાયન્સમાં ફ્રન્ટીયર્સ, 13, પૃષ્ઠ. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
વાંગ, જે. એટ અલ. (2022) 'ક્રોમોસોમ-લેવલ જીનોમ એસેમ્બલી અને લોંગન એક્સેસન્સની વસ્તી જીનોમિક્સમાંથી લોંગન ઇવોલ્યુશનમાં જીનોમિક ઇન્સાઇટ્સ',બાગાયત સંશોધન, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.
