પૂર્ણ-લંબાઈ mRNA સિક્વન્સિંગ-નેનોપોર
સુવિધાઓ
● પોલી-એ mRNA નું કેપ્ચર, ત્યારબાદ cDNA સંશ્લેષણ અને લાઇબ્રેરી તૈયારી
● પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટનો ક્રમ
● સંદર્ભ જીનોમના સંરેખણ પર આધારિત બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ
● બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણમાં ફક્ત જનીન અને આઇસોફોર્મ-સ્તર પર અભિવ્યક્તિ જ નહીં પરંતુ lncRNA, જનીન ફ્યુઝન, પોલી-એડીનેલેશન અને જનીન રચનાનું વિશ્લેષણ પણ શામેલ છે.
સેવાના ફાયદા
●આઇસોફોર્મ સ્તરે અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણીકરણ: વિગતવાર અને સચોટ અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણને સક્ષમ બનાવવું, સમગ્ર જનીન અભિવ્યક્તિનું વિશ્લેષણ કરતી વખતે છુપાવી શકાય તેવા ફેરફારને ઉજાગર કરવો
●ઘટાડેલી ડેટા માંગ:નેક્સ્ટ-જનરેશન સિક્વન્સિંગ (NGS) ની તુલનામાં, નેનોપોર સિક્વન્સિંગ ઓછી ડેટા આવશ્યકતાઓ દર્શાવે છે, જે નાના ડેટા સાથે જનીન અભિવ્યક્તિ ક્વોન્ટિફિકેશન સંતૃપ્તિના સમાન સ્તરને મંજૂરી આપે છે.
●અભિવ્યક્તિ પરિમાણની ઉચ્ચ ચોકસાઈ: જનીન અને આઇસોફોર્મ બંને સ્તરે
●વધારાની ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક માહિતીની ઓળખ: વૈકલ્પિક પોલિએડેનિલેશન, ફ્યુઝન જનીનો અને lcnRNA અને તેમના લક્ષ્ય જનીનો
●વ્યાપક કુશળતા: અમારી ટીમ દરેક પ્રોજેક્ટમાં અનુભવનો ભંડાર લાવે છે, જેમણે 850 થી વધુ નેનોપોર પૂર્ણ-લંબાઈના ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રોજેક્ટ્સ પૂર્ણ કર્યા છે અને 8,000 થી વધુ નમૂનાઓ પર પ્રક્રિયા કરી છે.
●વેચાણ પછીનો સપોર્ટ: અમારી પ્રતિબદ્ધતા પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થયા પછી પણ 3 મહિનાની વેચાણ પછીની સેવા સમયગાળા સાથે વિસ્તરે છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામો સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોના જવાબ આપવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો પ્રદાન કરીએ છીએ.
નમૂનાની આવશ્યકતાઓ અને ડિલિવરી
| પુસ્તકાલય | ક્રમ વ્યૂહરચના | ભલામણ કરેલ ડેટા | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| પોલી એ સમૃદ્ધ | નેનોપોર પ્રોમિથિઓન 48 | ૬/૧૨ જીબી | સરેરાશ ગુણવત્તા સ્કોર: Q10 |
નમૂના આવશ્યકતાઓ:
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
| સંક્ષિપ્ત (ng/μl) | રકમ (μg) | શુદ્ધતા | પ્રામાણિકતા |
| ≥ ૧૦૦ | ≥ ૧.૦ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 જેલ પર મર્યાદિત અથવા કોઈ પ્રોટીન અથવા ડીએનએ દૂષણ દર્શાવવામાં આવ્યું નથી. | છોડ માટે: RIN≥7.0; પ્રાણીઓ માટે: RIN≥7.5; ૫.૦≥૨૮એસ/૧૮એસ≥૧.૦; મર્યાદિત અથવા કોઈ બેઝલાઇન ઊંચાઈ નહીં |
● છોડ:
મૂળ, થડ અથવા પાંખડી: 450 મિલિગ્રામ
પાન અથવા બીજ: ૩૦૦ મિલિગ્રામ
ફળ: ૧.૨ ગ્રામ
● પ્રાણી:
હૃદય અથવા આંતરડા: 300 મિલિગ્રામ
વિસેરા અથવા મગજ: 240 મિલિગ્રામ
સ્નાયુ: 450 મિલિગ્રામ
હાડકાં, વાળ અથવા ત્વચા: ૧ ગ્રામ
● આર્થ્રોપોડ્સ:
જંતુઓ: 6 ગ્રામ
ક્રસ્ટેસીયા: 300 મિલિગ્રામ
● આખું લોહી: ૧ ટ્યુબ
● કોષો: ૧૦6 કોષો
ભલામણ કરેલ નમૂના વિતરણ
કન્ટેનર: 2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (ટીન ફોઇલની ભલામણ કરવામાં આવતી નથી)
નમૂના લેબલિંગ: જૂથ+પ્રતિકૃતિ દા.ત. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
શિપમેન્ટ:
૧. સૂકો બરફ: નમૂનાઓને બેગમાં પેક કરીને સૂકો બરફમાં દાટી દેવા જોઈએ.
2. RNAstable ટ્યુબ: RNA નમૂનાઓને RNA સ્ટેબિલાઇઝેશન ટ્યુબ (દા.ત. RNAstable®) માં સૂકવી શકાય છે અને ઓરડાના તાપમાને મોકલી શકાય છે.
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પેશી:
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
આરએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
● કાચો ડેટા પ્રોસેસિંગ
● ટ્રાન્સક્રિપ્ટ ઓળખ
● વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ
● જનીન સ્તર અને આઇસોફોર્મ સ્તરમાં અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણીકરણ
● વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ
● ફંક્શન એનોટેશન અને સંવર્ધન (DEGs અને DETs)
વૈકલ્પિક સ્પ્લિસિંગ વિશ્લેષણ
વૈકલ્પિક પોલિએડેનિલેશન વિશ્લેષણ (APA)
lncRNA આગાહી
નવા જનીનોની ટીકા
ડીઈટીનું ક્લસ્ટરિંગ
DEGs માં પ્રોટીન-પ્રોટીન નેટવર્ક્સ
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની નેનોપોર પૂર્ણ-લંબાઈની mRNA સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
ગોંગ, બી. એટ અલ. (2023) 'ગ્લિઓમામાં ઓન્કોજીન તરીકે સિક્રેટરી કાઇનેઝ FAM20C નું એપિજેનેટિક અને ટ્રાન્સક્રિપ્શનલ એક્ટિવેશન', જર્નલ ઓફ જિનેટિક્સ એન્ડ જીનોમિક્સ, 50(6), પૃષ્ઠ. 422–433. doi: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
He, Z. et al. (2023) 'IFN-γ ને પ્રતિભાવ આપતા લિમ્ફોસાઇટ્સનું પૂર્ણ-લંબાઈનું ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ ફ્લાઉન્ડર (પેરાલિચથિસ ઓલિવેસિયસ) માં Th1-સ્ક્યુડ રોગપ્રતિકારક પ્રતિભાવ દર્શાવે છે', ફિશ એન્ડ શેલફિશ ઇમ્યુનોલોજી, 134, પૃષ્ઠ 108636. doi: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
મા, વાય. એટ અલ. (2023) 'નેમોપિલેમા નોમુરાઈ ઝેર ઓળખ માટે પેકબાયો અને ઓએનટી આરએનએ સિક્વન્સિંગ પદ્ધતિઓનું તુલનાત્મક વિશ્લેષણ', જીનોમિક્સ, 115(6), પૃષ્ઠ 110709. doi: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
યુ, ડી. એટ અલ. (2023) 'નેનો-સેક વિશ્લેષણ hUMSC માંથી મેળવેલા એક્સોસોમ્સ અને માઇક્રોવેસિકલ્સ વચ્ચે વિવિધ કાર્યાત્મક વલણ દર્શાવે છે', સ્ટેમ સેલ રિસર્ચ એન્ડ થેરાપી, 14(1), પૃષ્ઠ 1–13. doi: 10.1186/S13287-023-03491-5/TABLES/6.
