સંદર્ભ જીનોમ સાથે mRNA-seq (NGS)
RNA-seq એ જીવન અને પાક વિજ્ઞાનમાં એક પ્રમાણભૂત સાધન છે, જે જીનોમ અને પ્રોટીઓમ વચ્ચેના અંતરને દૂર કરે છે. તેની શક્તિ નવી ટ્રાન્સક્રિપ્ટ્સ શોધવામાં અને એક જ પરીક્ષણમાં તેમની અભિવ્યક્તિનું પ્રમાણ નક્કી કરવામાં રહેલી છે. તેનો વ્યાપકપણે તુલનાત્મક ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક અભ્યાસ માટે ઉપયોગ થાય છે, વિવિધ લક્ષણો અથવા ફેનોટાઇપ્સથી સંબંધિત જનીનો પર પ્રકાશ પાડે છે, જેમ કે મ્યુટન્ટ્સની જંગલી-પ્રકારો સાથે સરખામણી કરવી અથવા ચોક્કસ પરિસ્થિતિઓમાં જનીન અભિવ્યક્તિ જાહેર કરવી. BMKCloud mRNA(Reference) APP mRNA-seq(NGS) બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ પાઇપલાઇનમાં અભિવ્યક્તિ પરિમાણ, વિભેદક અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ (DEG), અને ક્રમ માળખું વિશ્લેષણને એકીકૃત કરે છે અને સમાન સોફ્ટવેરની શક્તિઓને એકીકૃત કરે છે, સુવિધા અને વપરાશકર્તા-મિત્રતા સુનિશ્ચિત કરે છે. વપરાશકર્તાઓ તેમના RNA-seq ડેટાને ક્લાઉડ પર અપલોડ કરી શકે છે, જ્યાં એપ્લિકેશન એક વ્યાપક, એક-સ્ટોપ બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ ઉકેલ પ્રદાન કરે છે. વધુમાં, તે ગ્રાહક અનુભવને પ્રાથમિકતા આપે છે, વપરાશકર્તાઓની ચોક્કસ જરૂરિયાતોને અનુરૂપ વ્યક્તિગત કામગીરી પ્રદાન કરે છે. વપરાશકર્તાઓ પરિમાણો સેટ કરી શકે છે અને પાઇપલાઇન મિશન જાતે સબમિટ કરી શકે છે, ઇન્ટરેક્ટિવ રિપોર્ટ ચકાસી શકે છે, ડેટા/ડાયાગ્રામ જોઈ શકે છે અને ડેટા માઇનિંગ પૂર્ણ કરી શકે છે, જેમ કે: લક્ષ્ય જનીન પસંદગી, કાર્યાત્મક ક્લસ્ટરિંગ, ડાયાગ્રામિંગ, વગેરે.
પ્લેટફોર્મ:ઇલુમિના, એમજીઆઈ
વ્યૂહરચના:આરએનએ-સેક
લેઆઉટ: પેરીડ, ક્લીન-ડેટા.
લાઇબ્રેરી પ્રકાર:fr-unstranded, fr-firststrand અથવા fr-secondstrand
વાંચન લંબાઈ:૧૫૦ બીપી
ફાઇલ પ્રકાર:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz અથવા *.fq.gz. સિસ્ટમ કરશે.fastq ફાઇલોને તેમના ફાઇલ નામો અનુસાર આપમેળે જોડી દો,દા.ત. *_1.fastq ને *._2.fastq સાથે જોડી બનાવી.
નમૂનાઓની સંખ્યા:સંખ્યા પર કોઈ નિયંત્રણો નથીનમૂનાઓની સંખ્યા, પરંતુ વિશ્લેષણનો સમય સંખ્યા તરીકે વધશેનમૂનાઓ વધે છે.
ભલામણ કરેલ ડેટા રકમ:પ્રતિ નમૂના 6G
