● નેનોપોર P48 (10Kb લાઇબ્રેરી) પર લાંબા વાંચન સિક્વન્સિંગ; PacBio Revio (8Kb લાઇબ્રેરી)
● ભૂલ-સુધારણા: ઇલુમિના નોવાસેક (PE150 લાઇબ્રેરી) પર સિક્વન્સિંગ
●ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળી મેટાજેનોમ એસેમ્બલી:ઓછા કોન્ટિગ્સ સાથે જેમાં સાતત્ય વધુ હોય છે.
●ઉચ્ચ ચોકસાઈ:પ્રજાતિઓની ઓળખ અને કાર્યાત્મક જનીન આગાહી.
●સુધારેલ એસેમ્બલી: બેક્ટેરિયલ જીનોમ આઇસોલેશન અને તુલનાત્મક મેટાજેનોમ વિશ્લેષણને સરળ બનાવવું.
●વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ:અમારું વિશ્લેષણ ફક્ત વર્ગીકરણ વિવિધતા પર જ નહીં પરંતુ સમુદાયની કાર્યાત્મક વિવિધતા પર પણ કેન્દ્રિત છે.
●વ્યાપક અનુભવ: અમારી ટીમ દરેક પ્રોજેક્ટમાં અનુભવનો ભંડાર લાવે છે, વિવિધ સંશોધન ક્ષેત્રોમાં બહુવિધ મેટાજેનોમિક્સ પ્રોજેક્ટ્સને સફળતાપૂર્વક પૂર્ણ કરવાનો અને 200,000 થી વધુ નમૂનાઓની પ્રક્રિયા કરવાનો ટ્રેક રેકોર્ડ ધરાવતી, અમારી ટીમ દરેક પ્રોજેક્ટમાં અનુભવનો ભંડાર લાવે છે.
| સિક્વન્સિંગ પ્લેટફોર્મ | સિક્વન્સિંગ સ્ટ્રેટેજી | ભલામણ કરેલ ડેટા |
| ઇલુમિના નોવાસેક | પીઈ૧૫૦ | ૬ જીબી |
| નેનોપોર P48 | ૧૦ કેબી | ૬ / ૧૦ જીબી |
| પેકબાયો રેવિયો | ૮ કેબી | ૧૦ / ૨૦ જીબી |
| સાંદ્રતા (ng/µL) | કુલ રકમ (µg) | વોલ્યુમ (µL) | |
| ઇલુમિના PE150 લાઇબ્રેરી | ≥1 | ≥0.03 | ≥૨૦ |
| નેનોપોર ૧૦ કેબી લાઇબ્રેરી | ≥૪૦ | ≥2 | ≥૨૦ |
| પેકબાયો ૮ કેબી લાઇબ્રેરી | ≥૫૦ | ૧૦ µg/કોષ | ≥૨૦ |
નીચેના વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે:
● સિક્વન્સિંગ ડેટા ગુણવત્તા નિયંત્રણ
● મેટાજેનોમ એસેમ્બલી અને જનીન આગાહી
● જનીન ટીકા
● વર્ગીકરણ આલ્ફા વિવિધતા વિશ્લેષણ
● સમુદાયનું કાર્યાત્મક વિશ્લેષણ: જૈવિક કાર્ય, ચયાપચય, એન્ટિબાયોટિક પ્રતિકાર
● કાર્યાત્મક અને વર્ગીકરણ વિવિધતા બંનેનું વિશ્લેષણ:
બીટા વિવિધતા વિશ્લેષણ
આંતર-જૂથ વિશ્લેષણ
સહસંબંધ વિશ્લેષણ: પર્યાવરણીય પરિબળો અને OUT રચના અને વિવિધતા વચ્ચે
બિન-રિડન્ડન્ટ જનીન સેટ વિતરણ:
જનીન ટીકા: KEGG માર્ગ
જનીન ટીકા: eggNOG
જનીન ટીકા: CAZY કાર્બોહાઇડ્રેટ્સ
પ્રજાતિ સહસંબંધ નેટવર્ક:
આ ફીચર્ડ પ્રકાશન સાથે નેનોપોર + ઇલુમિના સાથે BMKGene ની મેટાજેનોમિક્સ સિક્વન્સિંગ સેવા દ્વારા કરવામાં આવેલી પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો:
જિન, એચ. એટ અલ. (2023) 'ઇનર મોંગોલિયન્સના માનવ આંતરડાના માઇક્રોબાયોમનું ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા જીનોમ કમ્પેન્ડિયમ', નેચર માઇક્રોબાયોલોજી 2023 8:1, 8(1), પૃષ્ઠ. 150–161. doi: 10.1038/s41564-022-01270-1.