સંપૂર્ણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ - ઇલુમિના
સુવિધાઓ
● સંપૂર્ણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમને ક્રમ આપવા માટે ડ્યુઅલ લાઇબ્રેરી જનરેશન: rRNA ડિપ્લેશન લાઇબ્રેરી અને નાની RNA લાઇબ્રેરી તૈયારી.
● mRNA, lncRNA, circRNA અને miRNA નું અલગ બાયોઇન્ફોર્મેટિક રિપોર્ટ્સમાં સંપૂર્ણ બાયોઇન્ફોર્મેટિક વિશ્લેષણ, ઉપરાંત ceRNA નેટવર્ક વિશ્લેષણ સહિત તમામ RNA અભિવ્યક્તિઓ સાથે સંયુક્ત વિશ્લેષણ.
સેવાના ફાયદા
●વ્યાપક કુશળતા: અમે વિવિધ પ્રકારના નમૂનાઓને આવરી લેતા 2100 થી વધુ સંપૂર્ણ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રોજેક્ટ્સ પર પ્રક્રિયા કરી છે. અમે દરેક પ્રોજેક્ટમાં કુશળતાનો ભંડાર લાવીએ છીએ.
●સખત ગુણવત્તા નિયંત્રણ: અમે નમૂના તૈયારીથી લઈને પુસ્તકાલય તૈયારી, સિક્વન્સિંગ અને બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ સુધીના તમામ તબક્કામાં મુખ્ય નિયંત્રણ બિંદુઓનો અમલ કરીએ છીએ. અમારું ઝીણવટભર્યું નિરીક્ષણ સતત ઉચ્ચ-ગુણવત્તાવાળા પરિણામોની ડિલિવરી સુનિશ્ચિત કરે છે.
●વ્યાપક ટીકા: અમે ડિફરન્શિયલી એક્સપ્રેસ્ડ જનીનો (DEGs) ને કાર્યાત્મક રીતે એનોટેટ કરવા અને અનુરૂપ સંવર્ધન વિશ્લેષણ કરવા માટે બહુવિધ ડેટાબેઝનો ઉપયોગ કરીએ છીએ. આ વ્યાપક અભિગમ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ પ્રતિભાવ અંતર્ગત કોષીય અને પરમાણુ પ્રક્રિયાઓમાં આંતરદૃષ્ટિ પ્રદાન કરે છે, જે ખાતરી કરે છે કે તમને તમારા પ્રયોગના ડેટા વિશે શક્ય તેટલી બધી માહિતી મળે છે.
●નિયમનકારી નેટવર્ક્સનું ઊંડાણપૂર્વક વિશ્લેષણ: ceRNA નેટવર્ક વિશ્લેષણ mRNA, lncRNA, circRNA અને miRNA ના સંયુક્ત ક્રમ દ્વારા અને સંપૂર્ણ બાયોઇન્ફોર્મેટિક વર્કફ્લો દ્વારા સક્ષમ છે.
●વેચાણ પછીનો સપોર્ટ: અમે સમજીએ છીએ કે હાજર રહેવું કેટલું મહત્વપૂર્ણ છે, તેથી જ અમારી પ્રતિબદ્ધતા પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થવા ઉપરાંત 3 મહિનાના વેચાણ પછીના સેવા સમયગાળા સાથે વિસ્તૃત છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામો સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોના જવાબ આપવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો પ્રદાન કરીએ છીએ.
નમૂનાની આવશ્યકતાઓ અને ડિલિવરી
| પુસ્તકાલય | ક્રમ વ્યૂહરચના | ભલામણ કરેલ ડેટા | ગુણવત્તા નિયંત્રણ |
| rRNA ક્ષીણ થઈ ગયું | ઇલુમિના PE150 | ૧૬ જીબી | Q30≥85% |
| કદ પસંદ કર્યું | ઇલુમિના SE50 | ૧૦-૨૦ મિલિયન વાંચન |
નમૂના આવશ્યકતાઓ:
ન્યુક્લિયોટાઇડ્સ:
| સંક્ષિપ્ત (ng/μl) | રકમ (μg) | શુદ્ધતા | પ્રામાણિકતા |
| ≥ ૮૦ | ≥ ૧.૬ | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 જેલ પર મર્યાદિત અથવા કોઈ પ્રોટીન અથવા ડીએનએ દૂષણ દર્શાવવામાં આવ્યું નથી. | RIN≥6.0 ૫.૦≥૨૮એસ/૧૮એસ≥૧.૦; મર્યાદિત અથવા કોઈ બેઝલાઇન ઊંચાઈ નહીં |
ભલામણ કરેલ નમૂના વિતરણ
કન્ટેનર: 2 મિલી સેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (ટીન ફોઇલની ભલામણ કરવામાં આવતી નથી)
નમૂના લેબલિંગ: જૂથ+પ્રતિકૃતિ દા.ત. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
શિપમેન્ટ:
૧. સૂકો બરફ: નમૂનાઓને બેગમાં પેક કરીને સૂકો બરફમાં દાટી દેવા જોઈએ.
2. RNAstable ટ્યુબ: RNA નમૂનાઓને RNA સ્ટેબિલાઇઝેશન ટ્યુબ (દા.ત. RNAstable®) માં સૂકવી શકાય છે અને ઓરડાના તાપમાને મોકલી શકાય છે.
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
આરએનએ નિષ્કર્ષણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ
દરેક અલગ અલગ પ્રકારના વિશ્લેષણ ઉપરાંત, 4 પ્રકારના RNA ને આપણા સંયુક્ત વિશ્લેષણમાં જોડવામાં આવ્યા છે:
- RNA ડેટાના તમામ વિવિધ પ્રકારો વચ્ચે સહ-અભિવ્યક્તિ વિશ્લેષણ
- આરએનએ અભિવ્યક્તિ ઝાંખી
- વિભેદક અભિવ્યક્તિ ઝાંખી
- CeRNA નેટવર્ક
- માર્ગમાં સંકલિત મુખ્ય જનીનો
- સંરક્ષણ વિશ્લેષણ
- સંબંધોને લક્ષ્ય બનાવવું
આરએનએ અભિવ્યક્તિ ઝાંખી
વિભેદક રીતે વ્યક્ત કરાયેલ જનીનો
ceRNA વિશ્લેષણ
વિભેદક રીતે વ્યક્ત કરાયેલા miRNA અને સંબંધિત RNA
પ્રકાશનોના ક્યુરેટેડ સંગ્રહ દ્વારા BMKGene ની સમગ્ર ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ સિક્વન્સિંગ સેવાઓ દ્વારા સુવિધા આપવામાં આવેલી સંશોધન પ્રગતિઓનું અન્વેષણ કરો.
Dai, Y. et al. (2022) 'RNA-સિક્વન્સિંગ દ્વારા ઓળખાયેલ કાશિન-બેક રોગમાં mRNAs, lncRNAs અને miRNAs ની વ્યાપક અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સ',મોલેક્યુલર ઓમિક્સ, 18(2), પાના. 154-166. doi: 10.1039/D1MO00370D.
લિયુ, એન. નાન એટ અલ. (2022) 'શિયાળાના સમયગાળા દરમિયાન ચાંગબાઈ પર્વતમાં એપિસ સેરાનાના ઠંડા-પ્રતિરોધકતાનું પૂર્ણ-લંબાઈ ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ્સ વિશ્લેષણ.',જનીન, 830, પૃષ્ઠ 146503–146503. doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
વાંગ, એક્સજે એટ અલ. (2022) 'સ્મોલ સેલ ફેફસાના કેન્સરમાં સ્પર્ધાત્મક એન્ડોજેનસ આરએનએ નિયમન નેટવર્ક્સની બહુ-ઓમિક્સ એકીકરણ-આધારિત પ્રાથમિકતા: મોલેક્યુલર લાક્ષણિકતાઓ અને ડ્રગ ઉમેદવારો',ઓન્કોલોજીમાં ફ્રન્ટીઅર્સ, 12, પૃષ્ઠ. 904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
ઝુ, પી. એટ અલ. (2022) 'lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA અભિવ્યક્તિ પ્રોફાઇલ્સનું સંકલિત વિશ્લેષણ મગફળીમાં રુટ-નોટ નેમાટોડ્સના પ્રતિભાવમાં સંભવિત પદ્ધતિઓમાં નવીન આંતરદૃષ્ટિ દર્શાવે છે',બીએમસી જીનોમિક્સ, 23(1), પૃષ્ઠ 1–12. doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/આકૃતિઓ/7.
યાન, ઝેડ. એટ અલ. (2022) 'હોલ-ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમ આરએનએ સિક્વન્સિંગ લાલ એલઇડી ઇરેડિયેશન દ્વારા બ્રોકોલીમાં લણણી પછીની ગુણવત્તા જાળવવા સાથે સંકળાયેલ પરમાણુ પદ્ધતિઓ પર પ્રકાશ પાડે છે',પોસ્ટહાર્વેસ્ટ બાયોલોજી અને ટેકનોલોજી, ૧૮૮, પૃષ્ઠ ૧૧૮૭૮. doi: ૧૦.૧૦૧૬/J.POSTHARVBIO.૨૦૨૨.૧૧૧૮૭૮.
