તુલનાત્મક જીનોમિક્સ
સેવાના ફાયદા
●વ્યાપક કુશળતા અને પ્રકાશન રેકોર્ડ્સ: સંચિત સાથે, BMKGene એ 90 થી વધુ તુલનાત્મક જીનોમિક્સ પ્રોજેક્ટ્સ પૂર્ણ કર્યા છે, જેમાં સંચિત અસર પરિબળ 900 સુધી પહોંચ્યું છે.
●વ્યાપક બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ: વિશ્લેષણ પેકેજમાં આઠ સૌથી સામાન્ય રીતે જરૂરી વિશ્લેષણો શામેલ છે, જે સારી રીતે ડિઝાઇન કરેલા પ્રકાશિત કરવા માટે તૈયાર આંકડા પ્રદાન કરે છે અને પરિણામોનું સરળ અર્થઘટન કરવાની મંજૂરી આપે છે.
●અત્યંત કુશળ બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ ટીમ અને ટૂંકા વિશ્લેષણ ચક્ર: તુલનાત્મક જીનોમિક્સ વિશ્લેષણમાં મહાન અનુભવ સાથે, BMKGene ની ટીમ ટૂંકા સમયમાં વિવિધ વ્યક્તિગત વિશ્લેષણ માંગણીઓ પૂર્ણ કરે છે.
●વેચાણ પછીનો સપોર્ટ:અમારી પ્રતિબદ્ધતા પ્રોજેક્ટ પૂર્ણ થવા ઉપરાંત 3 મહિનાના વેચાણ પછીના સેવા સમયગાળા સાથે વિસ્તૃત છે. આ સમય દરમિયાન, અમે પરિણામો સંબંધિત કોઈપણ પ્રશ્નોના જવાબ આપવા માટે પ્રોજેક્ટ ફોલો-અપ, મુશ્કેલીનિવારણ સહાય અને પ્રશ્ન અને જવાબ સત્રો પ્રદાન કરીએ છીએ.
સેવા સ્પષ્ટીકરણો
| અંદાજિત ટર્ન-અરાઉન્ડ સમય | પ્રજાતિઓની સંખ્યા | વિશ્લેષણ કરે છે |
| ૩૦ કાર્યકારી દિવસો | ૬ - ૧૨ | જનીન પરિવારનું ક્લસ્ટરિંગ જનીન પરિવારનું વિસ્તરણ અને સંકોચન ફાયલોજેનેટિક વૃક્ષ રચના ડાયવર્જન્સ સમય અંદાજ (અશ્મિભૂત માપાંકન જરૂરી) LTR દાખલ કરવાનો સમય (છોડ માટે) સંપૂર્ણ જીનોમ ડુપ્લિકેશન (છોડ માટે) પસંદગીયુક્ત દબાણ સિન્ટેની વિશ્લેષણ |
બાયોઇન્ફોર્મેટિક્સ વિશ્લેષણ
● જનીન પરિવાર
● ફાયલોજેનેટિક્સ
● ડાયવર્જન સમય
● પસંદગીયુક્ત દબાણ
● સિન્ટેની વિશ્લેષણ
નમૂનાની આવશ્યકતાઓ અને ડિલિવરી
નમૂના આવશ્યકતાઓ:
જીનોમ સિક્વન્સિંગ અને એસેમ્બલી માટે ટીશ્યુ અથવા ડીએનએ
ટીશ્યુ માટે
| પ્રજાતિઓ | પેશી | સર્વે | પેકબાયો સીસીએસ |
| પ્રાણી | આંતરડાની પેશીઓ | ૦.૫ ~ ૧ ગ્રામ | ≥ ૩.૫ ગ્રામ |
| સ્નાયુ પેશી | |||
| ≥ ૫.૦ ગ્રામ | |||
| ≥ ૫.૦ મિલી | |||
| સસ્તન પ્રાણીઓનું લોહી | |||
| ≥ ૦.૫ મિલી | |||
| મરઘાં/માછલીનું લોહી | |||
| છોડ | તાજું પાન | ૧ ~ ૨ ગ્રામ | ≥ ૫.૦ ગ્રામ |
| પાંખડી/થડી | ૧ ~ ૨ ગ્રામ | ≥ ૧૦.૦ ગ્રામ | |
| મૂળ/બીજ | ૧ ~ ૨ ગ્રામ | ≥ ૨૦.૦ ગ્રામ | |
| કોષો | સંસ્કારી કોષ | - | ≥ ૧ x ૧૦8 |
ડેટા
નજીકથી સંબંધિત પ્રજાતિઓની જીનોમ સિક્વન્સ ફાઇલો (.fasta) અને એનોટેશન ફાઇલો (.gff3)
સેવા કાર્ય પ્રવાહ
પ્રયોગ ડિઝાઇન
નમૂના વિતરણ
પુસ્તકાલય બાંધકામ
ક્રમ
ડેટા વિશ્લેષણ
વેચાણ પછીની સેવાઓ
*અહીં બતાવેલ ડેમો પરિણામો બાયોમાર્કર ટેક્નોલોજીસ દ્વારા પ્રકાશિત જીનોમમાંથી છે.
૧. LTR દાખલ સમયનો અંદાજ: આ આંકડો અન્ય પ્રજાતિઓની તુલનામાં, વેઇનિંગ રાઈ જીનોમમાં LTR-RTs દાખલ સમયનો એક અનોખો બાયમોડલ વિતરણ દર્શાવે છે. સૌથી તાજેતરનું શિખર લગભગ ૦.૫ મિલિયન વર્ષો પહેલા દેખાયું હતું.
લી ગુઆંગ અને અન્ય,કુદરત જિનેટિક્સ, 2021
2. ચાયોટ (સેચિયમ એડ્યુલ) પર ફાયલોજેની અને જનીન પરિવારનું વિશ્લેષણ: ચાયોટ અને જનીન પરિવારમાં અન્ય 13 સંબંધિત પ્રજાતિઓનું વિશ્લેષણ કરીને, ચાયોટ સાપના દૂધી (ટ્રાઇકોસેન્થેસ એન્ગુઇના) સાથે સૌથી વધુ નજીકથી સંબંધિત હોવાનું જાણવા મળ્યું. ચાયોટ લગભગ 27-45 માયામાં સાપના દૂધીમાંથી ઉતરી આવ્યું હતું અને 25±4 માયામાં ચાયોટમાં સંપૂર્ણ જીનોમ ડુપ્લિકેશન (WGD) જોવા મળ્યું હતું, જે કુકુઇબિટેસીમાં ત્રીજી WGD ઘટના છે.
ફુ એ અને અન્ય,બાગાયતી સંશોધન, 2021
૩. સિન્ટેની વિશ્લેષણ: ચાયોટ, સાપ દૂધી અને સ્ક્વોશમાં ફળના વિકાસમાં ફાયટોહોર્મોન્સ સંબંધિત કેટલાક જનીનો મળી આવ્યા હતા. ચાયોટ અને સ્ક્વોશ વચ્ચેનો સંબંધ ચાયોટ અને સાપ દૂધી કરતાં થોડો વધારે છે.
ફુ એ અને અન્ય,બાગાયતી સંશોધન, 2021
4. જનીન પરિવાર વિશ્લેષણ: G.thurberi અને G.davidsonii જીનોમમાં જનીન પરિવારના વિસ્તરણ અને સંકોચન પર KEGG સંવર્ધન દર્શાવે છે કે સ્ટીરોઈડ બાયોસિન્થેસિસ અને બ્રેસિનોસ્ટેરોઇડ બાયોસિન્થેસિસ સંબંધિત જનીનોનો વિસ્તાર કરવામાં આવ્યો હતો.
યાંગ ઝેડ અને અન્ય,બીએમસી બાયોલોજી, 2021
૫. સંપૂર્ણ જીનોમ ડુપ્લિકેશન વિશ્લેષણ: 4DTV અને Ks વિતરણ વિશ્લેષણમાં સંપૂર્ણ જીનોમ ડુપ્લિકેશન ઘટના દર્શાવવામાં આવી છે. આંતરજાતિઓના શિખરોએ ડુપ્લિકેશન ઘટનાઓ દર્શાવી છે. આંતરજાતિઓના શિખરોએ વિશિષ્ટતા ઘટનાઓ દર્શાવી છે. વિશ્લેષણ દર્શાવે છે કે અન્ય ત્રણ નજીકથી સંબંધિત પ્રજાતિઓ સાથે સરખામણી કરતા, O. europaea તાજેતરમાં મોટા પાયે જનીન ડુપ્લિકેશનમાંથી પસાર થયું છે.
રાવ જી વગેરે,બાગાયતી સંશોધન, 2021
BMK કેસ
કાંટા વગરનું ગુલાબ: ભેજ અનુકૂલન સાથે જોડાયેલ જીનોમિક આંતરદૃષ્ટિ
પ્રકાશિત: રાષ્ટ્રીય વિજ્ઞાન સમીક્ષા, 2021
ક્રમ વ્યૂહરચના:
'બસેય'સકાંટા વગરનું' (આર.વિચુરૈનન) જીનોમ:
આશરે ૯૩ X પેકબાયો + આશરે ૯૦ X નેનોપોર + ૨૬૭ X ઇલુમિના
મુખ્ય પરિણામો
1. ઉચ્ચ ગુણવત્તાવાળા R.wichuraiana જીનોમનું નિર્માણ લાંબા સમયથી વાંચેલા સિક્વન્સિંગ તકનીકોનો ઉપયોગ કરીને કરવામાં આવ્યું હતું, જે 530.07 Mb ની એસેમ્બલી ઉત્પન્ન કરે છે (ફ્લો સાયટોમેટ્રી દ્વારા અંદાજિત જીનોમ કદ આશરે 525.9 Mb અને જીનોમ સર્વે દ્વારા 525.5 હતું; હેટરોઝાયગોસિટી લગભગ 1.03% હતી). BUSCO નો અંદાજિત સ્કોર 93.9% હતો. "ઓલ્ડ બ્લશ" (haploOB) સાથે સરખામણી કરતા, આ જીનોમની ગુણવત્તા અને સંપૂર્ણતા બેઝ સિંગલ-બેઝ ચોકસાઈ અને LTR એસેમ્બલી ઇન્ડેક્સ (LAI=20.03) દ્વારા પુષ્ટિ મળી હતી. R.wichuraiana જીનોમમાં 32,674 પ્રોટીન કોડિંગ જનીનો છે.
2. તુલનાત્મક જીનોમિક્સ, ટ્રાન્સક્રિપ્ટોમિક્સ, આનુવંશિક વસ્તીના QTL વિશ્લેષણનો સમાવેશ કરતી મલ્ટિ-ઓમિક્સ સંયુક્ત વિશ્લેષણમાં R. wichuraiana અને Rosa chinensis વચ્ચેની મહત્વપૂર્ણ વિશિષ્ટતા જાહેર થઈ. ઉપરાંત, QTL માં સંબંધિત જનીનોની અભિવ્યક્તિ ભિન્નતા સ્ટેમ પ્રિકલ પેટર્નિંગ સાથે સંકળાયેલ હોવાની શક્યતા હતી.
બેઝીના થોર્નલેસ અને રોઝા ચાઇનેન્સિસ વચ્ચે તુલનાત્મક જીનોમિક્સ વિશ્લેષણ, જેમાં સિન્ટેની વિશ્લેષણ, જનીન પરિવાર ક્લસ્ટર, વિસ્તરણ અને સંકોચન વિશ્લેષણનો સમાવેશ થાય છે, તેમાં મોટી સંખ્યામાં વિવિધતાઓ જાહેર થઈ, જે ગુલાબમાં મહત્વપૂર્ણ લક્ષણો સાથે સંબંધિત હતી. NAC અને FAR1/FRS જનીન પરિવારમાં અનન્ય વિસ્તરણ કાળા ડાઘ સામે પ્રતિકાર સાથે સંકળાયેલ હોવાની શક્યતા ખૂબ જ હતી.
BT અને haploOB જીનોમ વચ્ચે તુલનાત્મક જીનોમિક્સ વિશ્લેષણ.
ઝોંગ, એમ., વગેરે. "કાંટા વગરનું ગુલાબ: ભેજ અનુકૂલન સાથે જોડાયેલ જીનોમિક આંતરદૃષ્ટિ"રાષ્ટ્રીય વિજ્ઞાન સમીક્ષા, ૨૦૨૧;, nwab092.
