Metagenomics (NGS)

Shotgun metagenomics oo leh Illumina waa aalad caan ah oo lagu baranayo microbiomes iyadoo si toos ah DNA looga kala saarayo muunado adag, taasoo awood u siineysa daraasadda kala duwanaanshaha taxonomic iyo shaqada labadaba. Dhuumaha BMKCloud metagenomic (NGS) waxay ku bilaabataa xakamaynta tayada iyo isu-ururinta metagenome, kuwaas oo hiddo-wadaha la saadaaliyay oo lagu ururiyay xog-ururin aan caydhnayn kuwaas oo lagu sharraxay shaqada iyo cashuurta iyadoo la adeegsanayo xog ururin badan. Macluumaadkan waxa loo istcimaalaa in lagu falanqeeyo muunada kala duwanaanshaha cashuuraha (Alfa diversity) iyo muunada kala duwananshiyaha (beta diversity). Falanqaynta kala duwanaanshiyaha kooxaha waxay helayaan OTU-yada iyo hawlaha bayooloji ee ka duwan labada kooxood iyagoo isticmaalaya imtixaanada parametric iyo non parametric, halka falanqaynta isku xidhku ay la xiriirto kala duwanaanshahan arrimaha deegaanka.