Metagenomics (NGS)

Shotgun metagenomics yokhala ndi Illumina ndi chida chodziwika bwino chophunzirira ma microbiomes mwa kutsata mwachindunji DNA kuchokera ku zitsanzo zovuta, zomwe zimathandizira kuphunzira zamitundu yosiyanasiyana ya taxonomic ndi magwiridwe antchito. Mapaipi a BMKCloud metagenomic (NGS) amayamba ndi kuwongolera kwabwino komanso kuphatikiza kwa metagenome, komwe majini amanenedweratu ndikuphatikizidwa m'ma dataset osafunikira omwe amafotokozedwa kuti agwire ntchito ndi taxonomy pogwiritsa ntchito ma database angapo. Izi zimagwiritsidwa ntchito kusanthula zamitundu yosiyanasiyana ya taxonomic (kusiyana kwa alpha) ndi pakati pazitsanzo zosiyanasiyana (zosiyanasiyana za beta). Kusanthula kosiyana pakati pa magulu kumapeza ma OTU ndi ntchito zamoyo zomwe zimasiyana pakati pa magulu awiriwa pogwiritsa ntchito mayesero a parametric ndi osakhala a parametric, pamene kusanthula kwa mgwirizano kumagwirizana ndi kusiyana kumeneku kuzinthu zachilengedwe.