Metagjenomika (NGS)

Metagjenomika e Shotgun me Illumina është një mjet i njohur për studimin e mikrobiomeve duke renditur drejtpërdrejt ADN -në nga mostrat komplekse, duke mundësuar studimin e diversitetit taksonomik dhe funksional. Tubacioni metagjenomik BMKCLOUD (NGS) fillon me kontrollin e cilësisë dhe montimin e metagjenit, nga i cili parashikohen dhe grumbullohen gjenet në të dhëna jo të rrepta që janë shënuar për funksion dhe taksonomi duke përdorur baza të të dhënave të shumta. Ky informacion përdoret për të analizuar diversitetin taksonomik brenda mostrës (diversitetin alfa) dhe diversitetin midis mostrave (diversiteti beta). Analiza diferenciale midis grupeve gjen OTU dhe funksione biologjike që ndryshojnë midis dy grupeve duke përdorur të dyja testet parametrike dhe jo-parametrike, ndërsa analiza e korrelacionit i lidh këto ndryshime me faktorët mjedisorë.