Metagenomics (NGS)

Awọn metagenomics Shotgun pẹlu Illumina jẹ ohun elo olokiki fun kikọ awọn microbiomes nipa ṣiṣe lẹsẹsẹ DNA taara lati awọn ayẹwo idiju, ṣiṣe ikẹkọ ti taxonomic mejeeji ati oniruuru iṣẹ. Opo opo gigun ti epo BMKCloud metagenomic (NGS) bẹrẹ pẹlu iṣakoso didara ati apejọ metagenome, lati inu eyiti awọn jiini ti sọ asọtẹlẹ ati ṣajọpọ sinu awọn ipilẹ data ti kii ṣe laiṣe ti o jẹ asọye fun iṣẹ ati taxonomy nipa lilo awọn apoti isura data pupọ. Alaye yii ni a lo lati ṣe itupalẹ laarin-apẹẹrẹ oniruuru taxonomic (oriruuru alpha) ati laarin awọn oniruuru apẹẹrẹ (oriruuru beta). Onínọmbà iyatọ laarin awọn ẹgbẹ rii awọn OTU ati awọn iṣẹ iṣe ti ara ti o yatọ laarin awọn ẹgbẹ mejeeji nipa lilo awọn idanwo parametric ati ti kii ṣe parametric, lakoko ti itupalẹ ibamu ṣe ibatan awọn iyatọ wọnyi si awọn ifosiwewe ayika.