Metagenomics (NGS)

Metagenomics Shotgun pẹ̀lú Illumina jẹ́ ohun èlò tó gbajúmọ̀ fún kíkẹ́kọ̀ọ́ àwọn microbiomes nípa títẹ̀lé DNA tààrà láti inú àwọn àpẹẹrẹ tó díjú, èyí tó ń jẹ́ kí ìkẹ́kọ̀ọ́ nípa onírúurú taxonomic àti functional diversity. Opopona BMKCloud metagenomic (NGS) bẹ̀rẹ̀ pẹ̀lú ìṣàkóso dídára àti àkójọpọ̀ metagenome, láti ibi tí a ti ń sọ àsọtẹ́lẹ̀ àwọn jiini àti tí a kó wọn jọ sí àwọn data tí kò ní agbára púpọ̀ tí a kọ orúkọ wọn fún iṣẹ́ àti taxonomy nípa lílo ọ̀pọ̀lọpọ̀ database. A lo ìwífún yìí láti ṣe àtúpalẹ̀ onírúurú taxonomic nínú-sample (alpha diversity) àti láàárín-sample diversity (beta diversity). Ìwádìí ìyàtọ̀ láàrín àwọn ẹgbẹ́ rí àwọn OTU àti àwọn iṣẹ́ ẹ̀dá alààyè tí ó yàtọ̀ láàrín àwọn ẹgbẹ́ méjèèjì nípa lílo àwọn ìdánwò parametric àti non-parametric, nígbà tí ìṣàyẹ̀wò ìbáramu so àwọn ìyàtọ̀ wọ̀nyí mọ́ àwọn ohun tó ń fa àyíká.