Metagenomics (NGS)

Haglabyssumyndfræði með Illumina er vinsælt tæki til að rannsaka örverur með því að raða DNA beint úr flóknum sýnum, sem gerir kleift að rannsaka bæði flokkunarfræðilegan og starfrænan fjölbreytileika. BMKCloud metagenomic (NGS) leiðslan hefst með gæðaeftirliti og metagenome samsetningu, þar sem genum er spáð fyrir og safnað saman í óþarfa gagnapakka sem eru merkt fyrir virkni og flokkun með því að nota marga gagnagrunna. Þessar upplýsingar eru notaðar til að greina flokkunarfræðilegan fjölbreytileika innan úrtaks (alfa fjölbreytni) og fjölbreytni milli úrtaks (beta fjölbreytni). Mismunagreining milli hópa finnur OTUs og líffræðilegar aðgerðir sem eru mismunandi á milli hópanna tveggja með því að nota bæði parametrisk og non-parametric próf, en fylgnigreining tengir þennan mun við umhverfisþætti.