Metagenómík (NGS)

Erfðamengisgreining með haglabyssum með Illumina er vinsælt tól til að rannsaka örveruflórur með því að raðgreina DNA beint úr flóknum sýnum, sem gerir kleift að rannsaka bæði flokkunarfræðilegan og virknisfjölbreytileika. Metagenomic ferlið (NGS) BMKCloud hefst með gæðaeftirliti og samsetningu erfðamengis, þar sem gen eru spáð fyrir um og flokkuð í gagnasöfn sem eru ekki umfram og merkt með virkni og flokkun með því að nota marga gagnagrunna. Þessar upplýsingar eru notaðar til að greina flokkunarfjölbreytileika innan sýna (alfa-fjölbreytileika) og fjölbreytileika milli sýna (beta-fjölbreytileika). Mismunargreining milli hópa finnur OTU-einingar og líffræðilega virkni sem eru mismunandi milli hópanna tveggja með því að nota bæði stikaðar og óstikaðar prófanir, en fylgnigreining tengir þennan mun við umhverfisþætti.