Метагеномика (NGS)

Метагеномика „shotgun“ помоћу Illumina-е је популаран алат за проучавање микробиома директним секвенцирањем ДНК из сложених узорака, омогућавајући проучавање и таксономске и функционалне разноликости. BMKCloud метагеномски (NGS) процес почиње контролом квалитета и склапањем метагенома, из којих се гени предвиђају и групишу у нередундантне скупове података који су анотирани за функцију и таксономију користећи више база података. Ове информације се користе за анализу таксономске разноликости унутар узорка (алфа разноликост) и разноликости између узорака (бета разноликост). Диференцијална анализа између група проналази OTU-е и биолошке функције које се разликују између две групе користећи и параметарске и непараметарске тестове, док корелациона анализа повезује ове разлике са факторима животне средине.