Metagenomika (NGS)

Illumina bilan ov miltig'i metagenomikasi murakkab namunalardan DNKni to'g'ridan-to'g'ri ketma-ketlashtirish orqali mikrobiomalarni o'rganish uchun mashhur vosita bo'lib, taksonomik va funktsional xilma-xillikni o'rganish imkonini beradi. BMKCloud metagenomik (NGS) quvur liniyasi sifat nazorati va metagenom yig'ilishidan boshlanadi, undan genlar bashorat qilinadi va bir nechta ma'lumotlar bazalari yordamida funksiya va taksonomiya uchun izohlangan ortiqcha bo'lmagan ma'lumotlar to'plamlariga to'planadi. Ushbu ma'lumotlar namuna ichidagi taksonomik xilma-xillikni (alfa xilma-xilligi) va namunalar orasidagi xilma-xillikni (beta xilma-xilligini) tahlil qilish uchun ishlatiladi. Guruhlar orasidagi differentsial tahlil parametrik va parametrik bo'lmagan testlardan foydalangan holda ikki guruh o'rtasida farq qiluvchi OTU va biologik funktsiyalarni topadi, korrelyatsiya tahlili esa bu farqlarni atrof-muhit omillari bilan bog'laydi.