Metagenomika (NGS)

Illumina bilan o'tkazilgan metagenomika murakkab namunalardan DNKni to'g'ridan-to'g'ri ketma-ketlashtirish orqali mikrobiomlarni o'rganish uchun mashhur vosita bo'lib, bu ham taksonomik, ham funktsional xilma-xillikni o'rganish imkonini beradi. BMKCloud metagenomik (NGS) quvur liniyasi sifat nazorati va metagenom yig'ishdan boshlanadi, undan genlar bashorat qilinadi va bir nechta ma'lumotlar bazalaridan foydalangan holda funksiya va taksonomiya uchun izohlangan ortiqcha bo'lmagan ma'lumotlar to'plamlariga klasterlanadi. Ushbu ma'lumot namuna ichidagi taksonomik xilma-xillikni (alfa xilma-xillik) va namunalar orasidagi xilma-xillikni (beta xilma-xillik) tahlil qilish uchun ishlatiladi. Guruhlar orasidagi differentsial tahlil parametrik va parametrik bo'lmagan testlardan foydalangan holda ikki guruh o'rtasida farq qiladigan OTU va biologik funktsiyalarni topadi, korrelyatsiya tahlili esa bu farqlarni atrof-muhit omillari bilan bog'laydi.