Ургамал/амьтны бүхэл геномын дараалал
1.Үйлчилгээний давуу тал
1000 гаруй зүйлийн геномын дараалал тогтоох арвин туршлагатай.
4000 гаруй хуримтлагдсан импакт хүчинтэй 800 гаруй нийтлэгдсэн тохиолдол.
Вариацын дуудлага болон функцийн шинжилгээний талаархи биоинформатикийн цогц шинжилгээ.
2. Үйлчилгээний үзүүлэлтүүд
| Платформ | Номын сан | Санал болгож буй дарааллын гүн | |
| Иллюмина | PE 150 | SNP-ийн хувьд InDel дуудлага ≥ 10x SV, CNY-ийн хувьд ≥ 30x дуудлага хийх
| |
| Нанопур
| 8 кб | SV, CNY-ийн хувьд ≥ 20x дуудлага хийх | |
| Пакбио | CCS | 15 кб | SNP, InDel, SV, CNY-д ≥ 10x дуудлага хийх |
3. Загварт тавигдах шаардлага
| Платформ | Conc.(ng/μL)
| Дүн (нг)
| Цэвэр байдал
| Агароз гель
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. Үгүй эсвэл хязгаарлагдмал үндсэн хамтлагийг арилгахгель дээр ажиглагдсан доройтол. 2. РНХ, уургийн бохирдол байхгүй буюу хязгаарлагдмал
| ||||
| Иллюмина | ≥1 | ≥30
| - | - | ||
| Нанопур
| ≥30 | Өгөгдлийн гарцаас хамаарна 10 мкг / эс | 1.7-2.2 | ≥1.5 | ||
| Пакбио | CCS | ≥50 | 1.7-2.2 | 1.8-2.5 | ||
4. Био мэдээллийн шинжилгээ
5. Үйлчилгээний ажлын урсгал
Дээж хүргэх
ДНХ олборлолт
Номын сангийн барилга
Дараалал
Мэдээллийн дүн шинжилгээ хийх
Өгөгдөл хүргэх
1) Геномын зураглалын статистик
Хүснэгт 1 Зураглалын үр дүнгийн статистик
Зураг 1 Оруулах хэмжээ болон уншигдах хамрах хүрээний хуваарилалт.
2) Өөрчлөлтийг илрүүлэх
Зураг 2 Дээжийн дундах SNP/INDEL/SV-ийн статистик ба тайлбар
Зураг 3 Геномын хэмжээнд хэлбэлзлийн тархалт
3) Хувилбаруудын функциональ тайлбар
| 2019 он | Байгалийн харилцаа холбоо | Бүтэн геномын дараалал нь Brassica napus-ийн гарал үүсэл, түүнийг сайжруулахад оролцдог генетикийн байршлыг илрүүлдэг. |
| 2020 он | PNAS | Алтан загасны (Carassius auratus) хувьслын гарал үүсэл, гаршуулах түүх |
| 2021 он | Ургамлын биотехнологийн сэтгүүл | Таримал хоёр зүйлийн геномын лавлагаа |
| 2021 он | Ургамлын биотехнологийн сэтгүүл | Хүнсний ногоо, тосны үрийн аллополиплоид Brassicajuncea-ийн геном шинж тэмдэг ба глюкозинолатуудын хуримтлалыг хянадаг удамшлын байрлалууд |
| 2019 он | Молекулын ургамал | Дэлхий даяар тархсан рапсын нэгдлүүдийн цуглуулгын бүхэл геномын дарааллыг тогтоох нь тэдний экотипийн ялгааны генетикийн үндсийг харуулж байна. |
| 2022 он | Цэцэрлэгжүүлэлтийн судалгаа | Геномын өргөн хүрээний ассоциацийн шинжилгээ нь тарвасны үрийн байгалийн өөрчлөлтийн талаарх молекулын ойлголтыг өгдөг. |
| 2021 он | Туршилтын ургамал судлалын сэтгүүл | Геномын өргөн хүрээний нийгэмлэгийн судалгаагаар хөвөнгийн хүйтэнд тэсвэртэй GhSAD1-ийн хувилбаруудыг тодорхойлсон. |
| 2021 он | Туршилтын ургамал судлалын сэтгүүл | Геномын өргөн хүрээний нийгэмлэгийн судалгаа, транскриптомын харьцуулалт нь рапс дахь дэлбээний хэмжээг хянадаг шинэ QTL болон нэр дэвшигч генийг илрүүлсэн. |
