डीएनए/आरएनए सिक्वेंसींग -पॅकबिओ सिक्वेंसर
वैशिष्ट्ये
पॅकबीओ सिक्वेंसरवरील दोन अनुक्रम मोडः सतत लाँग रीड (सीएलआर) आणि परिपत्रक एकमत वाचन (सीसीएस)
| अनुक्रम मोड | ग्रंथालयाचा आकार | सैद्धांतिक डेटाउत्पन्न (प्रति सेल) | एकल-बेसअचूकता | अनुप्रयोग |
| सीएलआर | 20 केबी, 30 केबी, इ. | 80 जीबी ते 130 जीबी | अंदाजे. 85% | डी नोव्हो, एसव्ही कॉलिंग, इ. |
| सीसीएस | 15-20 केबी | 14 ते 40 जीबी/सेल (सिक्वेल II) 70 ते 110 जीबी/सेल (रेविओ) नमुन्यांवर अवलंबून असते | अंदाजे. 99% | डी नोव्हो, एसएनपी/इंडेल/एसव्ही कॉलिंग, आयएसओ-सेक, |
रेव्हिओ आणि सिक्वेल II च्या कामगिरीची आणि वैशिष्ट्यांची तुलना
| अटी | सिक्वेल II सिस्टम | रेविओ सिस्टम | वाढवा |
| उच्च घनता | 8 दशलक्ष झेडएमडब्ल्यू | 25 दशलक्ष झेडएमडब्ल्यू | 3x |
| स्वतंत्र टप्पे | 1 | 4 | 4x |
| लहान धावण्याच्या वेळेस | 30 तास | 24 तास | 1.25x |
| 30 एक्स हिफाई मानवी जीनोम / वर्ष | 88 | 1,300 | 1एकूण 5 एक्स |
सेवा फायदे
Pac विविध प्रजातींसह हजारो बंद प्रकल्पांसह पॅकबीओ सिक्वेंसींग प्लॅटफॉर्मवर 8 वर्षांचा अनुभव.
Tose नवीनतम पॅकबीओ सिक्वेंसींग प्लॅटफॉर्मसह पूर्णपणे सुसज्ज, रेविओ पुरेसे सिक्वेंसींग थ्रूपुटची हमी देण्यासाठी.
Trand वेगवान वळण-वेळ, उच्च डेटा उत्पन्न आणि अधिक अचूक डेटा.
Hight शेकडो उच्च-प्रभाव पॅकबीओ-आधारित प्रकाशनांमध्ये योगदान दिले.
नमुना आवश्यकता
| नमुना प्रकार | रक्कम | एकाग्रता （कुबिट） | खंड | शुद्धता | इतर |
| जीनोमिक डीएनए | डेटा आवश्यकतेवर अवलंबून रहा | ≥50 एनजी/μL | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230 = 1.8-2.5 ； 260 एनएम वर स्पष्ट पीक ，दूषित नाही | एकाग्रता क्विट आणि क्यूबिट/नॅनोपोर = 0.8-2.5 द्वारे मोजणे आवश्यक आहे |
| एकूण आरएनए | ≥1.2μg | ≥120 एनजी/μL | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0.5-2.5 ；दूषित नाही | आरआयएन मूल्य ≥7.5 5 -28 एस/18 एस 1 |
सेवा वर्कफ्लो
नमुना तयार करणे
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
प्रकल्प वितरण
1. घरातील डेटा उत्पन्न
63 सीसीएस पेशींमधून तयार केलेला डेटा (26 प्रजातींमधून)
| डेटा-पॅकबिओ-सीसीएस -15 केबी | सरासरी | कमाल | मि | मध्यम |
| उत्पन्न - सब्रेड्स (जीबी) | 421.12 | 544.27 | 221.38 | 426.58 |
| वायल्ड - सीसीएस (जीबी) | 25.93 | 38.59 | 10.86 | 25.43 |
| पॉलिमरेज एन 50 | 145,651 | 175,430 | 118,118 | 144,689 |
| सब्रेड्स एन 50 | 17,509 | 23,924 | 12,485 | 17,584 |
| सीसीएस एन 50 | 14,490 | 19,034 | 9,876 | 14,747 |
| सरासरी लांबी-पॉलिमरेस | 67,995 | 89,379 | 49,664 | 66,433 |
| सरासरी लांबी-घुसखोरी | 15,866 | 21,036 | 11,657 | 16,012 |
| सरासरी लांबी-सीसी | 14,489 | 19,074 | 8,575 | 14,655 |
16 सीएलआर पेशींमधून तयार केलेला डेटा (76 प्रजातींमधून)
| डेटा-पॅसबीओ-सीएलआर -30 केबी | सरासरी | कमाल | मि | मध्यम |
| उत्पन्न - सब्रेड्स (जीबी) | 142.20 | 291.40 | 50.55 | 142.49 |
| पॉलिमरेज एन 50 | 39,456 | 121,191 | 15,389 | 35,231 |
| सब्रेड्स एन 50 | 28,490 | 41,012 | 14,430 | 29,063 |
| सरासरी लांबी-पॉलिमरेस | 22,063 | 48,886 | 8,747 | 21,555 |
| सरासरी लांबी-घुसखोरी | 17,720 | 27,225 | 8,293 | 17,779 |
2. डेटा क्यूसी - डेमोडेटा उत्पन्नाची आकडेवारी
| नमुना | सीसीएस संख्या वाचते | एकूण सीसीएस बेस (बीपी) | सीसीएस एन 50 (बीपी) वाचतो | सीसीएस म्हणजे लांबी (बीपी) | सीसीएस सर्वात लांब वाचणे (बीपी) | सब्रेड्स बेस (बीपी) | सीसीएस दर (%) |
| पीबी_बीएमकेएक्सएक्सएक्सएक्स | 3,444,159 | 54,164,122,586 | 15,728 | 15,726 | 36,110 | 863,326,330,465 | 6.27 |
