BMKCloud Log in
条形 ब्यानर-03

उत्पादनहरू

DNA/RNA अनुक्रमण - PacBio अनुक्रमक

PacBio अनुक्रमणिका प्लेटफर्म एक लामो-पढिएको अनुक्रमण प्लेटफर्म हो, जसलाई तेस्रो-जेनेरेसन सिक्वेन्सिङ (TGS) प्रविधिहरू मध्ये एकको रूपमा पनि चिनिन्छ।कोर टेक्नोलोजी, एकल-मोलिक्युल रियल-टाइम (SMRT), ले दसौं किलो-बेस लम्बाइको साथ पढ्ने उत्पादनलाई सशक्त बनाउँछ।"अनुक्रमण-द्वारा-संश्लेषण" को आधारमा, शून्य-मोड वेभगाइड (ZMW) द्वारा एकल न्यूक्लियोटाइड रिजोल्युसन प्राप्त गरिन्छ, जहाँ तल्लो भागमा मात्र सीमित मात्रा (अणु संश्लेषणको साइट) लाई प्रकाशित गरिन्छ।थप रूपमा, SMRT अनुक्रमणले धेरै हदसम्म NGS प्रणालीमा अनुक्रम-विशिष्ट पूर्वाग्रहलाई बेवास्ता गर्छ, जसमा पुस्तकालय निर्माण प्रक्रियामा धेरै जसो PCR प्रवर्द्धन चरणहरू आवश्यक पर्दैन।

 

प्लेटफर्म: सिक्वेल II, Revio


सेवा विवरण

डेमो परिणामहरू

विशेषताहरु

PacBio sequencer मा दुई अनुक्रम मोडहरू: निरन्तर लामो पढाइ (CLR) र सर्कुलर कन्सेन्सस रीड (CCS)

अनुक्रम मोड पुस्तकालय आकार सैद्धान्तिक डाटाउपज (प्रति सेल) एकल आधारशुद्धता अनुप्रयोगहरू
CLR 20Kb, 30Kb, आदि। 80 Gb देखि 130 Gb लगभग।८५% नयाँ, SV कलिङ, आदि।
CCS 15-20 Kb

14 देखि 40 जीबी/सेल (सिक्वल II)

७० देखि ११० जीबी/सेल (रिभियो)

नमूनाहरूमा निर्भर गर्दछ

लगभग।९९% नयाँ, SNP/Indel/SV कलिङ, Iso-Seq,

Revio र Sequel II को प्रदर्शन र सुविधाहरूको तुलना

सर्तहरू

सिक्वेल II प्रणाली

Revio प्रणाली

बढ्नु

उच्च घनत्व

8 मिलियन ZMWs

25 मिलियन ZMWs

3x

स्वतन्त्र चरणहरू

1

4

4x

छोटो दौड समय

३० घण्टा

24 घण्टा

1.25x

30X HiFi मानव जीनोम / वर्ष

88

१,३००

15x समग्र

सेवा लाभहरू

● PacBio सिक्वेन्सिङ प्लेटफर्ममा विभिन्न प्रजातिका हजारौं बन्द परियोजनाहरूसँग ८ वर्षभन्दा बढीको अनुभव।

● पर्याप्त अनुक्रमण थ्रुपुटको ग्यारेन्टी गर्न नवीनतम PacBio अनुक्रमणिका प्लेटफर्महरू, Revio सँग पूर्ण रूपमा सुसज्जित।

● छिटो घुम्ने समय, उच्च डाटा उपज र थप सटीक डाटा।

● सयौं उच्च-प्रभाव PacBio-आधारित प्रकाशनहरूमा योगदान।

नमूना आवश्यकताहरू


नमूना प्रकार रकम एकाग्रता (Qubit®) भोल्युम शुद्धता अरू
जीनोमिक डीएनए डाटा आवश्यकता मा निर्भर गर्दछ ≥50 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230=1.8-2.5;
260 nm मा खाली शिखर,कुनै प्रदुषण छैन
एकाग्रता Qubit र Qubit/Nanopore = ०.८-२.५ द्वारा मापन गर्न आवश्यक छ
कुल आरएनए ≥1.2μg ≥120 ng/μl ≥15μl OD260/280=1.7-2.5;
OD260/230=0.5-2.5;कुनै प्रदुषण छैन

RIN मान ≥7.5

5≥28S/18S≥1

 

सेवा कार्यप्रवाह

नमूना तयारी

नमूना तयारी

पुस्तकालय तयारी

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रम

अनुक्रम

डाटा विश्लेषण

डाटा विश्लेषण

नमूना QC

परियोजना वितरण


  • अघिल्लो:
  • अर्को:

  • 1. इन-हाउस डाटा उपज

    63 सीसीएस कक्षहरूबाट उत्पन्न डाटा (२६ प्रजातिहरूबाट)

    डाटा-PacBio-CCS-15 Kb औसत अधिकतम न्यूनतम मध्य
    उपज (Gb) ४२१.१२ ५४४.२७ २२१.३८ ४२६.५८
    Yiled - CCS(Gb) २५.९३ ३८.५९ १०.८६ २५.४३
    पोलिमरेज N50 १४५,६५१ १७५,४३० ११८,११८ १४४,६८९
    सबब्रेड N50 १७,५०९ २३,९२४ १२,४८५ १७,५८४
    CCS N50 १४,४९० १९,०३४ ९,८७६ १४,७४७
    औसत लम्बाइ - पोलिमरेज ६७,९९५ ८९,३७९ ४९,६६४ ६६,४३३
    औसत लम्बाइ-सबब्रेडहरू १५,८६६ २१,०३६ ११,६५७ १६,०१२
    औसत लम्बाइ-CCS १४,४८९ १९,०७४ ८,५७५ १४,६५५

    16 CLR कक्षहरू (७६ प्रजातिहरूबाट) बाट उत्पन्न डाटा

    DATA-PacBio-CLR-30Kb औसत अधिकतम न्यूनतम मध्य
    उपज (Gb) १४२.२० २९१.४० ५०.५५ १४२.४९
    पोलिमरेज N50 ३९,४५६ १२१,१९१ १५,३८९ 35,231
    सबब्रेड N50 २८,४९० ४१,०१२ १४,४३० २९,०६३
    औसत लम्बाइ - पोलिमरेज २२,०६३ ४८,८८६ ८,७४७ २१,५५५
    औसत लम्बाइ-सबब्रेडहरू १७,७२० २७,२२५ ८,२९३ १७,७७९

    2. डेटा QC - डेमोडाटा उपज मा तथ्याङ्क

    नमूना

    ccs पढेको संख्या

    कुल सीसीएस आधारहरू (bp)

    ccs पढ्छ N50 (bp)

    ccs औसत लम्बाइ (bp)

    ccs सबैभन्दा लामो पढाइ (bp)

    सबरीड आधारहरू (bp)

    सीसीएस दर (%)

    PB_BMKxxx

    ३,४४४,१५९

    ५४,१६४,१२२,५८६

    १५,७२८

    १५,७२६

    36,110

    ८६३,३२६,३३०,४६५

    ६.२७

     

    एक उद्धरण प्राप्त

    यहाँ आफ्नो सन्देश लेख्नुहोस् र हामीलाई पठाउनुहोस्

    हामीलाई आफ्नो सन्देश पठाउनुहोस्: