page_head_bg

Производи

Секвенцирање ДНК/РНА -ПацБио Секуенцер

ПацБио платформа за секвенцирање је платформа за секвенционирање која се дуго чита, која је такође позната као једна од технологија секвенцирања треће генерације (ТГС).Основна технологија, са једним молекулом у реалном времену (СМРТ), омогућава генерисање читања дужине десетине килограма.На основу „Секвенцирања по синтези“, резолуција једног нуклеотида се постиже помоћу таласовода нултог режима (ЗМВ), где је осветљен само ограничен волумен на дну (место синтезе молекула).Поред тога, СМРТ секвенцирање у великој мери избегава пристрасност специфичну за секвенцу у НГС систему, јер већина корака ПЦР амплификације није потребна у процесу изградње библиотеке.


Детаљи услуге

Демо Ресултс

Карактеристике

Два режима секвенцирања на ПацБио секвенцеру: континуирано дуго читање (ЦЛР) и кружно консензус читање (ЦЦС)

Секуенцинг Моде Величина библиотеке Теоријски подациПринос (по ћелији) Сингле-басеПрецизност Пријаве
ЦЛР 20Кб, 30Кб, итд. 80 Гб до 130 Гб Прибл.85% Де ново, СВ позивање итд.
ЦЦС 15-20 Кб 14 до 40 Гб/ћелији (ЦЦС) Прибл.99% Де ново, СНП/Индел/СВ позивање, Исо-Сек,

Предности услуге

ØПреко 7 година искуства на ПацБио платформи за секвенцирање са хиљадама затворених пројеката са различитим врстама.

ØПотпуно опремљен најновијим ПацБио Секуенцинг платформама, Секуел ИИ да гарантује довољан проток секвенцирања

ØБрже време обрта, већи принос података и тачнији подаци.

ØДопринео стотинама издатих публикација заснованих на ПацБио-у

Захтеви за узорке


Тип узорка Износ Концентрација (Кубит®) Волуме Чистоћа Други
Геномска ДНК Зависи од захтева за подацима ≥20 нг/μл ≥15μл ОД260/280=1,6-2,3;
ОД260/230=1,5-2,5;
Јасан врх на 260 нм,нема контаминација
Концентрацију треба мерити помоћу Кубит-а и Кубит/Нанопоре = 0,8-2,0
Укупна РНК ≥1,5 μг ≥40 нг/μл ≥15μл ОД260/280=1,7-2,5;
ОД260/230=0,5-2,5;нема контаминација
РИН вредност ≥7,5

 

Ток рада услуге

logo_02

Припрема узорка

logo_03

Изградња библиотеке

logo_05

Секвенцирање

logo_06

Анализа података

logo_01

Испорука пројекта


  • Претходна:
  • Следећи:

  • 1. Ин-хоусе Дата Ииелд

    Подаци генерисани из 63 ЦЦС ћелије (од 26 врста)

    Дата-Пацбио-ЦЦС-15 Кб Просек Макс Мин медијана
    Принос - подчитани (Гб) 421.12 544.27 221.38 426.58
    Иилед - ЦЦС(Гб) 25.93 38.59 10.86 25.43
    Полимераза Н50 145,651 175,430 118,118 144,689
    Субреадс Н50 17,509 23,924 12,485 17,584
    ЦЦС Н50 14,490 19,034 9,876 14,747
    Просечна дужина-полимераза 67,995 89,379 49,664 66,433
    Просечна дужина-Подхлебови 15,866 21,036 11,657 16,012
    Просечна дужина-ЦЦС 14,489 19,074 8,575 14,655

    Подаци генерисани из 16 ЦЛР ћелија (од 76 врста)

    ДАТА-Пацбио-ЦЛР-30Кб Просек Макс Мин медијана
    Принос - подчитани (Гб) 142.20 291.40 50.55 142.49
    Полимераза Н50 39,456 121,191 15,389 35,231
    Субреадс Н50 28,490 41,012 14,430 29,063
    Просечна дужина-полимераза 22,063 48,886 8,747 21,555
    Просечна дужина-Подхлебови 17,720 27,225 8,293 17,779

    2. КЦ података – ДемоСтатистика о приносу података

    Узорак

    ццс Чита бр

    Укупно ццс базе (бп)

    ццс чита Н50 (бп)

    ццс Средња дужина (бп)

    цц Најдуже читање (бп)

    субреадс базе (бп)

    ццс стопа (%)

    ПБ_БМКккк

    3,444,159

    54,164,122,586

    15,728

    15,726

    36,110

    863,326,330,465

    6.27

     

    добили Цитат

    Напишите своју поруку овде и пошаљите нам је

    Пошаљите нам своју поруку: